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Concessão grande da oportunidade para levar a cabo arranjar em seqüência do “inteiro-genoma” dos pacientes com autismo

O instituto nacional da saúde mental concede $4,5 milhões para aplicar a tecnologia da próxima geração a encontrar as causas do autismo

O hospital de crianças Boston, com o instituto e a Faculdade de Medicina largos de Harvard, foi concedido uma concessão grande da oportunidade do instituto nacional da saúde mental como parte do pacote de estímulo federal, para levar a cabo arranjar em seqüência do “inteiro-genoma” dos pacientes com autismo, usando novas tecnologias para o ADN rápido que arranja em seqüência para compreender melhor as causas do autismo. Aproximadamente $4,5 milhões a concessão, parte do pacote de estímulo federal, começa oficialmente o 30 de setembro. Todos os dados genéticos da seqüência serão feitos publicamente - disponíveis.

O autismo é executado freqüentemente nas famílias, e é o o mais altamente genético de desordens neuropsiquiátricas. Sobre genes e mutações de dúzia específicos foram descobertos, incluindo diversos por pesquisadores em crianças. Contudo estes genes ainda saem inexplicado da grande maioria de casos do autismo -- aproximadamente 85 por cento, dizem Christopher A. Walsh, DM, PhD, chefe da genética no hospital de crianças Boston, que está conduzindo a nova iniciativa com co-investigador Michael Greenberg, PhD, cabeça da neurobiologia na Faculdade de Medicina de Harvard, e uma equipe no instituto largo do MIT e do Harvard, conduzido por Stacey Gabriel, PhD, e David Altshuler, DM, PhD.

O projecto focalizará primeiramente em 85 pacientes do Oriente Médio, estudados previamente no laboratório de Walsh, cujos os pais compartilham da ascendência comum e que têm formulários recessivos do autismo. Estes pacientes fazem bons assuntos iniciais para o estudo porque as análises do enlace de suas famílias extensas já reduziram o campo de mutações do candidato para baixo a apenas 1 por cento de seu genoma. Porque o autismo é extremamente variável genetically, as grandes famílias raras com os indivíduos afetados múltiplos fornecem uma boa oportunidade traçando genes decausa, muitos de que igualmente ocorra em pacientes do autismo geralmente.

Porque as técnicas são refinadas, Walsh e os colegas começarão a executar e interpretar a informação genética da seqüência de outros grupos de pacientes do autismo, incluindo famílias americanas. “Dentro de um ano ou de dois, nós esperamos desenvolver a tecnologia e as técnicas da informática que devem ajudar a compreender muitos cabritos com autismo,” Walsh diz.

A equipe começará analisando o “exome” - os 2 por cento do genoma esse directamente códigos para proteínas. Para os pacientes cuja a causa genética permanece um mistério, uma segunda fase do estudo arranjará em seqüência e analisará os 3,2 bilhão pares baixos do genoma inteiro (as combinações de A, de C, de T e G) de que compo nosso complemento completo de 20.000 a 25.000 genes. Desta maneira, os pesquisadores esperam descobrir parcelas noncoding do genoma -- ADN às vezes chamado da “sucata” -- isso não faz proteínas mas pode conter os interruptores críticos que controlam a actividade de gene.

A peça da informática do projecto, conduzida por Timothy Yu, DM, PhD, no laboratório de Walsh, será a mais importante e desafiante. Com máquinas novas, arranjar em seqüência do ADN tornou-se relativamente fácil e barato; o que é duro está interpretando a inundação da informação. Os pesquisadores compararão a informação da seqüência de seus pacientes do autismo com a aquela dos controles normais, usando dados do international “que 1000 genomas se projectam,” permitindo que distingam variações genéticas pessoais normais das variações que causam o autismo. “Estes dados novos devem dar-nos a potência enorme interpretar os resultados em nossos pacientes do autismo, e figuram para fora o que são o sinal e o que é ruído,” Walsh dizem. “Três milhão letras na seqüência do ADN podem diferir entre você e mim -- nós precisamos de figurar para fora que as mudanças estão causando à doença.”

Uma parte separada do projecto, conduzida por Greenberg, olhará a actividade de gene nos neurônios humanos, focalizando nos genes que se encontram nos pedaços do ADN que foram encontrados previamente para ser suprimidos nas famílias do Oriente Médio com autismo. Em 2008, Greenberg e Walsh relataram que algumas mutações do autismo podem afectar seqüências do “promotor” ou do “realçador”, os bits do ADN que actuam como os interruptores “de ligar/desligar” que controlam a actividade de gene. (Veja: http://www.childrenshospital.org/newsroom/Site1339/mainpageS1339P1sublevel445.html.) agora, o laboratório de Greenberg estudará a vida, neurônios activos para criar um mapa sistemático destes interruptores críticos no genoma humano, quando a equipe do hospital de crianças procurarar pelo relacionamento entre estes interruptores e autismo.

Porque o financiamento grande da oportunidade exige que o dinheiro da concessão esteja gastado dentro de 18 meses, o projecto mover-se-á ràpida. O objectivo último do projecto é relacionar formulários diferentes do autismo clínico às variações no ADN e na actividade de gene, e fazer esta informações disponíveis a todos os pesquisadores do autismo.