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L'ordonnancement d'Exome aboutit à rectifier la demande de règlement de diagnostic et de sauvetage pour l'affection génétique mystérieuse

Un exome appelé d'approche de dépistage génétique ordonnancer-qui fournit à une alternative cliniquement pratique au l'entier-génome dirigé par ordonnancer à la demande de règlement correcte de diagnostic et de sauvetage dans un enfant une maladie génétique précédemment inconnue, enregistre un papier prochain en génétique en médicament, le tourillon pair-observé officiel de l'université américaine de la génétique médicale (ACMG). Le tourillon est publié par Lippincott Williams et Wilkins, une partie de santé de Wolters Kluwer.

« Nous entrons dans maintenant une ère l'où l'analyse génomique complète au niveau de nucléotide, tel que l'ordonnancement entier-exome, a été ajoutée à l'armamentarium du clinicien, » écrivons à Howard J. Jacob, Ph.D., et collègues de la faculté de médecine du Wisconsin, Milwaukee, dans un commentaire accompagnant l'état clinique neuf. « Notre vue du chevet était que l'ordonnancement d'exome activé nous pour offrir une demande de règlement basée sur un diagnostic s'est enraciné dans l'histoire de la maladie et la science naturelles de laboratoire. » M. Jacob est directeur de l'être humain et du centre de génétique moléculaire à MCW.

L'ordonnancement d'Exome permet le diagnostic de l'affection génétique mystérieuse
Elizabeth A. Worthey, Ph.D., et Alan D. Mayer, Ph.D., a abouti une équipe interdisciplinaire vérifiant une maladie sérieuse et mystérieuse dans un jeune garçon. Commençant à l'âge 15 mois, l'enfant a développé une forme « exceptionnellement agressive » de la maladie inflammatoire de l'intestin qui n'a pas réagi aux demandes de règlement habituelles.

Le contrôle n'en a montré de nombreuses anomalies du système immunitaire de l'enfant, mais aucun qui ont indiqué n'importe quel diagnostic spécifique. « Sur une période de trois ans, il y avait plus de 100 opérations, consultations cliniques avec des médecins de partout dans le monde, discussions informelles innombrables, contacts cliniques hebdomadaires de soins, et consultations informelles d'email avec de monde-principaux experts, » les auteurs écrivent. « En dépit de ces mesures, nous avons apprécié peu de réussite stratégique. »

En conclusion, elles ont essayé une approche neuve : ordonnancement entier-exome. Comme alternative à l'ordonnancement de tous les gènes d'une personne (génome), exome ordonnançant des orientations sur la région de protéine-codage (exome). Cette gamme limitée des gènes cibles fournit une approche faisable à recenser le gène responsable d'une maladie inconnue.

De plus de 16.000 variantes de gène recensées par l'exome ordonnançant, environ 1.500 étaient précédemment inconnus. Par un procédé d'élimination, les généticiens médicaux ont recensé le coupable le plus susceptible : une mutation du gène XIAP, qui joue un rôle critique dans le procédé inflammatoire et la mort cellulaire programmée (apoptose).

D'autres mutations de XIAP ont été liées à un hémophagocytique appelé de hémopathie rare mais potentiellement fatale (HLH) lymphohistiocytosis-qui peut être avec succès traité par greffe de moelle osseuse. Puisque les médecins ont considéré leur patient être au haut risque de développer HLH, ils ont exécuté une greffe de cellules hématopoïétique d'ancêtre utilisant le sang de cordon ombilical de distributeur indépendant comme source de cellule souche de sang. Dans quelques semaines, les cellules de distributeur engrafted, fournissant au patient les gènes normalement de fonctionnement de XIAP.

Après la récupération de la procédure de greffe, l'enfant pouvait enfin manger et boire normalement, sans le renvoi de la maladie intestinale. Les médecins sont confiants que la greffe évitera HLH-et plein d'espoir qu'elle maintiendra sa maladie inflammatoire de l'intestin du retour aussi bien.

Les résultats expliquent le pouvoir de l'exome ordonnançant pour effectuer les diagnostics qui seraient pratiquement impossibles utilisant les tests génétiques conventionnels. Bien que l'ordonnancement d'exome soit très cher, le coût est décroissant rapidement, alors que la connaissance requise pour interpréter les résultats continue à augmenter.

« Les outils procurables pour inciter ce diagnostic à avoir évolué tellement rapidement qu'ils n'étaient pas procurables quand l'enfant s'est présenté la première fois il y a 4 ans, » M. Jacob et collègues écrivent. Ils croient que, dans un avenir pas trop lointain, l'exome ou même le séquençage du génome peut même remonter des approches actuelles de test de gène unique. Les auteurs mettent l'accent sur que de telles approches élèvent une foule de considérations éthiques neuves, y compris le besoin de consentement éclairé attentif.

Basé sur l'expérience acquise de leur expérience, l'équipe à l'être humain et le centre de génétique moléculaire développent des stratégies et des polices neuves pour guider leur approche aux cas assimilés à l'avenir. Le M. Jacob et co-auteurs concluent, « nous sommes confiants que l'ordonnancement génomique aura un rôle croissant en déterminant le diagnostic correct pour des patients et, avant tout, en améliorant des résultats. »

Source:

 Genetics in Medicine