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NuGEN augmente l'installation de NGS pour l'analyse microbienne de transcriptome avec le système ARN-Seq procaryotique d'ovation

NuGEN Technologies, Inc., un chef dans la préparation des échantillons génomique, augmente l'installation de l'ordonnancement de la deuxième génération (NGS) pour l'analyse de la substance microbienne et des échantillons de microbiome avec son système ARN-Seq procaryotique d'ovation. La technologie de base utilisée dans ce produit enrichit pour l'ARNm dans des bibliothèques de NGS, et peut être appliquée aux transcriptomes extraits à partir des cultures microbiennes pures et mélangées dans un flux de travail simple.

NuGEN annonce un programme limité d'accès pour le desserrage de ce produit visant les centres de recherche microbiens médicaux et environnementaux. Les deux premiers sites recevant le système ARN-Seq procaryotique d'ovation sont université de Washington à St Louis et l'université de Washington.

M. George Weinstock, chef du projet de Microbiome et du professeur humains de la génétique et de la microbiologie à l'université de Washington à St Louis, ainsi que directeur associé du centre de génome d'université de Washington voit la technologie de NuGEN comme importante pour activer la préparation des échantillons ARN-Seq avec une large gamme de substance bactérienne.

« Notre groupe utilise l'ordonnancement de la deuxième génération pour caractériser la structure et le fonctionnement des génomes microbiens, et comment les microbes forment des communautés pour coloniser le corps humain, » M. Weinstock a dit. « L'objectif de notre travail est d'analyser les génomes de ces organismes pour comprendre quels gènes sont exprimés dans différentes conditions et pour mesurer comment les communautés changent dans différentes conditions de santé et de maladie. L'analyse fonctionnelle est aussi importante qu'énumérant des taxa ou des gènes dans cette analyse, mais le recensement quels gènes sont exprimés, particulièrement avec les communautés complexes, est très provocant. Nous avons exigé d'un système ARN-Seq de préparation des échantillons de permettre l'utilisation des quantités de nanogramme de commencer l'ARN total qui pourrait de manière significative enrichir pour la partie d'ARNm de transcriptomes bactériens. Dans les études pilotes faites avec NuGEN, j'ai été impressionné par le rendement du système ARN-Seq procaryotique d'ovation en termes de toutes les conditions d'entrée d'ARN, reproductibilité, et simplicité générale du flux de travail. »

M. Caroline Harwood est un professeur de la microbiologie à l'université de Washington, et un membre de l'académie nationale des sciences. Son groupe a employé une version de prototype du système ARN-Seq procaryotique d'ovation pour vérifier l'expression du gène dans les microbes environnementaux.

« Nous avons employé des palustris de rhodopseudomonas comme système modèle pour comprendre comment les bactéries répondent aux signes environnementaux, films biologiques de forme, et dans le cas des palustris de R. peut être conçu pour la production efficace du gaz d'hydrogène, » M. Harwood a dit. « Notre travail concerne ordonnancer les transcriptomes des centaines de différentes tensions bactériennes ainsi nous avons besoin d'un moyen efficace et rentable de préparer des bibliothèques avec l'entrée minimale de l'ARN total. Nous sommes excités pour travailler avec l'équipe de NuGEN sur ces projet et régime pour soumettre les découvertes initiales de notre travail pour la publication pendant les plusieurs semaines suivantes. »

Le système ARN-Seq procaryotique d'ovation explique les efforts de NuGEN pour continuer à adresser les goulots d'étranglement critiques dans la préparation des échantillons de NGS. « Le système ARN-Seq procaryotique d'ovation pilotera davantage d'extension de NGS dans l'endroit apparaissant du metatranscriptomics, » a dit M. Christopher Raymond, Sr de NuGEN. Chargé de recherches. « Cet ajout important dans le portefeuille de produits de NuGEN pour NGS réaffirme notre engagement pour aider à résoudre les questions biologiques que nos propriétaires tâchent soutenu de répondre en étudiant les types neufs et provocants témoin. »

Source:

NuGEN Technologies Inc