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NuGEN amplia l'utilità di NGS per l'analisi microbica del transcriptome con il sistema RNA-Seguente Prokaryotic di ovazione

NuGEN le Technologies, Inc., una guida nel preparato del campione di genomica, amplia l'utilità di ordinamento di prossima generazione (NGS) per l'analisi delle specie e dei campioni microbici del microbiome con il suo sistema RNA-Seguente Prokaryotic di ovazione. La tecnologia di base utilizzata in questo prodotto arricchisce per il mRNA nelle librerie di NGS e può applicarsi ai transcriptomes estratti dalle culture microbiche pure e miste in un flusso di lavoro semplice.

NuGEN sta annunciando un programma ad accesso limitato per la versione di questo prodotto che mira ai centri di ricerca microbici medici ed ambientali. I primi due siti che ricevono il sistema RNA-Seguente Prokaryotic di ovazione sono università di Washington a St. Louis e l'università di Washington.

Il Dott. George Weinstock, guida del progetto Microbiome e del professore umani della genetica e della microbiologia all'università di Washington a St. Louis come pure direttore associato del centro del genoma dell'università di Washington osserva la tecnologia di NuGEN come importante per permettere al preparato RNA-Seguente del campione con una vasta gamma di specie batteriche.

“Il nostro gruppo utilizza l'ordinamento di prossima generazione per caratterizzare la struttura e la funzione dei genoma microbici e come i microbi formano le comunità per colonizzare il corpo umano,„ il Dott. Weinstock ha detto. “Lo scopo del nostro lavoro è di analizzare i genoma di questi organismi per capire quali geni sono espressi in circostanze varie e misurare come le comunità cambiano negli stati differenti di malattia e di salubrità. L'analisi funzionale è importante quanto enumerando i tassi o i geni in questa analisi, ma identificare quale geni sono espressi, particolarmente con le comunità complesse, è molto provocatoria. Abbiamo richiesto un sistema RNA-Seguente del preparato del campione di permettere l'uso degli importi del nanogram di iniziare il RNA totale in grado di arricchire significativamente per la parte del mRNA di transcriptomes batterici. Negli studi pilota fatti con NuGEN, sono stato impressionato dalla prestazione del sistema RNA-Seguente Prokaryotic di ovazione in termini di requisiti totali dell'input del RNA, riproducibilità e semplicità globale del flusso di lavoro.„

Il Dott. Caroline Harwood è un professore di microbiologia all'università di Washington e un membro dell'Accademia nazionale delle scienze. Il suo gruppo ha usato una versione del prototipo del sistema RNA-Seguente Prokaryotic di ovazione per studiare l'espressione genica in microbi ambientali.

“Abbiamo usato i palustris delle rodopseudomone come sistema-modello per capire come i batteri rispondono ai segnali ambientali, biofilms del modulo e nel caso dei palustris del R. può essere costruito per produzione efficiente dell'idrogeno,„ il Dott. Harwood ha detto. “Il nostro lavoro comprende ordinare i transcriptomes delle centinaia di ceppi batterici differenti in modo da abbiamo bisogno di un modo efficiente e redditizio preparare le librerie con input minimo di RNA totale. Siamo eccitati per lavorare con il gruppo di NuGEN su questi progetto e pianificazione per presentare i risultati iniziali del nostro lavoro per la pubblicazione nelle parecchie settimane prossime.„

Il sistema RNA-Seguente Prokaryotic di ovazione dimostra gli sforzi di NuGEN per continuare ad indirizzare i gravi ostacoli critici nel preparato del campione di NGS. “Il sistema RNA-Seguente Prokaryotic di ovazione determinerà ulteriore espansione di NGS nell'area emergente del metatranscriptomics,„ ha detto il Dott. Christopher Raymond, Sr di NuGEN. Ricercatore. “Questa aggiunta importante al portafoglio del prodotto di NuGEN per NGS riafferma il nostro impegno per contribuire a risolvere le domande che biologiche i nostri clienti si sforzano continuamente di rispondere a studiando i nuovi e tipi provocatori del campione.„

Source:

NuGEN Technologies Inc