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NuGEN despliega la utilidad de NGS para el análisis microbiano del transcriptome con el sistema ARN-Seq procariótico de la ovación

NuGEN Technologies, Inc., líder en la preparación de la muestra de la genómica, despliega la utilidad de la siguiente-generación que ordena (NGS) para el análisis de la especie microbiana y de las muestras del microbiome con su sistema ARN-Seq procariótico de la ovación. La tecnología de base usada en este producto enriquece para el mRNA en bibliotecas de NGS, y se puede aplicar a los transcriptomes extraídos de culturas microbianas puras y mezcladas en un flujo de trabajo simple.

NuGEN está anunciando un programa limitado del acceso para la baja de este producto que apunta centros de investigación microbianos médicos y ambientales. Los primeros dos sitios que reciben el sistema ARN-Seq procariótico de la ovación son universidad de Washington en St. Louis y la universidad de Washington.

El Dr. George Weinstock, líder del proyecto de Microbiome y del profesor humanos de la genética y de la microbiología en la universidad de Washington en St. Louis, así como director adjunto del centro del genoma de la universidad de Washington ve la tecnología de NuGEN como importante para habilitar la preparación ARN-Seq de la muestra con una amplia gama de especie bacteriana.

“Nuestro grupo utiliza la siguiente-generación que ordena para caracterizar la estructura y la función de genomas microbianos, y cómo los microbios forman a comunidades para colonizar el cuerpo humano,” el Dr. Weinstock dijo. “La meta de nuestro trabajo es analizar los genomas de estos organismos para entender qué genes se expresan bajo diversas condiciones y medir cómo las comunidades cambian en diversos estados de la salud y de la enfermedad. El análisis funcional es tan importante como enumerando taxus o genes en este análisis, pero determinar qué genes se expresan, especialmente con las comunidades complejas, es muy desafiador. Requerimos un sistema ARN-Seq de la preparación de la muestra permitir el uso de las cantidades del nanogram de comenzar el ARN total que podría enriquecer importante para la porción del mRNA de transcriptomes bacterianos. En los estudios piloto hechos con NuGEN, el funcionamiento del sistema ARN-Seq procariótico de la ovación me creé una diferencia de potencial en términos de requisitos totales de la entrada del ARN, reproductibilidad, y simplicidad total del flujo de trabajo.”

El Dr. Caroline Harwood es profesor de la microbiología en la universidad de Washington, y una pieza de la National Academy of Sciences. Su grupo ha utilizado una versión del prototipo del sistema ARN-Seq procariótico de la ovación para investigar la expresión génica en microbios ambientales.

“Hemos utilizado palustris de los Rhodopseudomonas como sistema modelo para entender cómo las bacterias responden a las señales ambientales, biofilms de la forma, y en el caso de palustris del R. puede ser dirigido para la producción eficiente de gas de hidrógeno,” el Dr. Harwood dijo. “Nuestro trabajo implica el ordenar de los transcriptomes de centenares de diversas deformaciones bacterianas así que necesitamos medios eficientes y de poco costo de preparar bibliotecas con la entrada mínima del ARN total. Nos excitan para trabajar con las personas de NuGEN en este proyecto y plan para someter las conclusión iniciales de nuestro trabajo para la publicación en las varias semanas próximas.”

El sistema ARN-Seq procariótico de la ovación demuestra los esfuerzos de NuGEN de continuar dirigir atascamientos críticos en la preparación de la muestra de NGS. El “sistema ARN-Seq procariótico de la ovación impulsará la extensión adicional de NGS en el área emergente del metatranscriptomics,” dijo al Dr. Christopher Raymond, Sr de NuGEN. Profesor investigador. “Esta adición importante a la cartera del producto de NuGEN para NGS reafirma nuestra consolidación para ayudar a resolver las preguntas biológicas que nuestros clientes se esfuerzan continuamente contestar estudiando nuevos y desafiadores tipos de la muestra.”

Source:

NuGEN Technologies Inc