L'étude de la taille du génome neuve recense des causes de trouble immunitaire d'enfance sérieux

Une étude génomique neuve, aboutie par le centre pour la génomique appliquée à l'hôpital pour enfants de Philadelphie, prépare le terrain pour les premiers tests diagnostique prévisionnels dans une maladie sérieuse d'immunodéficience chez les enfants. Si le trouble, la maladie d'immunodéficience de variable courante (CVID), peut être diagnostiqué tôt, les enfants peuvent recevoir des demandes de règlement de sauvetage avant que la maladie puisse progresser.

« Actuel, il peut y a un délai de jusqu'à neuf ans de la première fois qu'un enfant devient malade de cette maladie très complexe jusqu'à ce que lui ou lui soit diagnostiqué, » a dit la Jordanie S. Orange, M.D., Ph.D., un Immunologue pédiatrique à l'hôpital pour enfants de Philadelphie et auteur de Co-fil de l'étude. « Pendant ce délai, un enfant peut subir des infections répétées et des dégâts d'organe de durée-rapetissement. Le recensement de CVID à un stade précoce peut permettre à des médecins d'intervenir plus tôt avec le traitement adapté. »

À l'hôpital pour enfants, l'orange dirige le centre de diagnostic et les soins de Jeffrey Modell pour des enfants avec les maladies primaires d'immunodéficience. L'orange a collaboré avec Hakon Hakonarson, M.D., Ph.D., directeur du centre pour la génomique appliquée à l'hôpital pour enfants de Philadelphie, Charlotte Cunningham Rundles, M.D., d'École de Médecine du mont Sinaï, de New York City, et de chercheurs de plusieurs autres institutions.

La recherche, la première étude basée sur la population de la taille du génome de CVID, 15 avril en ligne apparu dans le tourillon de l'allergie et immunologie clinique.

Dans CVID, un enfant a un à basse altitude des anticorps (particulièrement immunoglobulines), réduisant la capacité du fuselage de combattre la maladie, et laissant l'enfant vulnérable aux infections à répétition. CVID peut d'abord se produire tôt ou plus tard dans la durée, et les sympt40mes sont hautement variables. Les infections respiratoires fréquentes peuvent mener aux dégâts de poumon permanents. Les patients peuvent également souffrir l'inflammation commune, les troubles d'estomac et d'entrailles, et un plus gros risque des cancers.

La variabilité grande de la maladie, ajoutée au manque des tests diagnostique nets, fait souvent aller CVID non disgnostiqué pendant des années avant que les médecins puissent commencer la demande de règlement. La complexité de la maladie a également frustré des tentatives de recenser des causes.

Dans l'étude actuelle, l'équipe de recherche a entrepris une étude de la taille du génome d'association (GWAS) pour rechercher courant et les variants génétiques rares qui pourraient permettre à des médecins de recenser les configurations génétiques ont trouvé chez les enfants avec CVID mais pas chez les enfants en bonne santé.

Utilisant le matériel hautement robotisé de génotypage au centre de l'hôpital pour enfants pour la génomique appliquée, le groupe d'étude a exécuté un GWAS dans un groupe de 363 patients avec CVID, comparé à 3.031 contrôles sains. Ils ont recherché des polymorphismes d'unique-nucléotide (SNPs) ainsi que des variations plus rares de numéro de copie (CNVs). Les SNP sont des changements d'une base unique d'ADN, alors que CNVs sont effacés ou des séquences répétées dans une extension d'ADN.

Le GWAS a trouvé une association intense avec des gènes dans la région complexe d'histocompatibilité (MHC) principale, un endroit connu pour jouer un rôle majeur dans des conditions liées immunisé, et précédemment lié à CVID. Les chercheurs ont également trouvé des SNP dans un endroit ces des indicatifs pour une famille des protéines impliquées dans les réactions immunitaires.

Dans sa recherche de CNV le groupe d'étude a également trouvé plus que de des gènes douzaine romans avec la pertinence directe ou potentielle avec le système immunitaire. Les découvertes de gène ont fourni des indices à la biologie en grande partie inconnue de la façon dont CVID se développe, jetant la lumière sur les mécanismes biologiques étant à la base de la maladie. « Ces découvertes fournissent l'analyse dans la pathogénie de CVID et de ses sous-types variés, et peuvent mener à de futures demandes de règlement, » a dit l'orange.

Les découvertes de GWAS ont confirmé la complexité génétique de CVID, mais d'une manière primordiale pour l'application clinique, les chercheurs pouvaient employer leurs découvertes pour développer un algorithme prévisionnel. Quand ils ont vérifié cet algorithme sur des cohortes des cas et des contrôles de CVID, ils pouvaient discerner CVID des contrôles sains avec 99 pour cent d'exactitude.

Les chercheurs travaillent maintenant pour raffiner l'algorithme dans des tests diagnostique normalisés pour CVID. L'orange ajoutée, « ceci est très passionnante. Elle propose que nous puissions pouvoir employer le profil génétique d'un patient à un stade précoce pour prévoir si lui ou lui développera CVID. Depuis une demande de règlement plus tôt peut grand améliorer la capacité d'un enfant de vivre avec CVID, cette recherche peut représenter une avance importante en manageant une maladie complexe et incompréhensible. »