Il nuovo studio genoma di ampiezza identifica le cause di disturbo immunitario serio di infanzia

Un nuovo studio di genomica, piombo dal centro per genomica applicata all'ospedale pediatrico di Filadelfia, colloca la fase per il primo test diagnostico premonitore in una malattia seria di immunodeficienza in bambini. Se il disordine, malattia di immunodeficienza di variabile comune (CVID), può essere diagnosticato presto, i bambini possono ricevere i trattamenti di salvataggio prima che la malattia possa progredire.

“Corrente, ci può essere una mora di fino a nove anni dalla prima volta un bambino si ammala da questa malattia molto complessa fino a diagnosticarla lui o lei,„ ha detto la Giordania S. Orange, M.D., Ph.D., un immunologo pediatrico all'ospedale pediatrico di Filadelfia ed autore del co-cavo dello studio. “Durante questa mora, un bambino può subire le infezioni ed il danno ripetuti dell'organo della vita riduzione. L'identificazione del CVID ad una fase iniziale può permettere che i medici intervengano più presto con il trattamento appropriato.„

All'ospedale pediatrico, l'arancia dirige il centro diagnostico e le cure di Jeffrey Modell per i bambini con le malattie primarie di immunodeficienza. L'arancia ha collaborato con Hakon Hakonarson, M.D., Ph.D., Direttore del centro per genomica applicata all'ospedale pediatrico di Filadelfia, Charlotte Cunningham Rundles, M.D., della scuola di medicina del monte Sinai, di New York e dei ricercatori da parecchie altre istituzioni.

La ricerca, il primo studio basato sulla popolazione genoma di ampiezza di CVID, 15 aprile online comparso nel giornale dell'allergia ed immunologia clinica.

In CVID, un bambino ha un a basso livello degli anticorpi (specificamente immunoglobuline), diminuendo la capacità dell'organismo di combattere la malattia e lasciando il bambino vulnerabile alle infezioni ricorrenti. CVID può in primo luogo accadere presto o più successivamente nella vita ed i sintomi sono altamente variabili. Le frequenti infezioni respiratorie possono piombo a danno ai polmoni permanente. I pazienti possono anche soffrire l'infiammazione unita, disordini di viscere e dello stomaco e un elevato rischio dei cancri.

La grande variabilità della malattia, accoppiata con la mancanza di test diagnostico netto, induce spesso CVID a andare undiagnosed per anni prima che medici possano iniziare il trattamento. La complessità della malattia egualmente ha frustrato i tentativi di identificare le cause.

Nello studio corrente, il gruppo di ricerca ha intrapreso gli studi genoma di ampiezza di associazione (GWAS) per cercare sia comune che le varianti genetiche rare che potrebbero permettere che i medici identifichino i reticoli genetici hanno trovato in bambini con CVID ma non in bambini in buona salute.

Facendo uso di strumentazione genotyping altamente automatizzata al centro dell'ospedale pediatrico per genomica applicata, il gruppo di studio ha eseguito un GWAS in un campione di 363 pazienti con CVID, confrontato a 3.031 comando sano. Ha cercato i polimorfismi del unico nucleotide (SNPs) come pure le variazioni più rare di numero di copia (CNVs). SNPs è cambiamenti in una singola base di DNA, mentre CNVs è cancellato o sequenze ripetute in un allungamento di DNA.

Il GWAS ha individuato una forte associazione con i geni nella regione complessa di istocompatibilità (MHC) principale, un'area conosciuta per svolgere un ruolo importante nelle circostanze in relazione con immune e precedentemente collegata a CVID. I ricercatori egualmente hanno trovato che SNPs in un'area quella codici per una famiglia delle proteine ha compreso nelle risposte immunitarie.

Nella sua ricerca di CNV il gruppo di studio egualmente ha trovato più dei geni di dozzina romanzi con pertinenza diretta o potenziale con sistema immunitario. Le scoperte del gene hanno fornito le bugne alla biologia in gran parte sconosciuta di come CVID si sviluppa, facente luce sui meccanismi biologici che sono alla base della malattia. “Questi risultati forniscono la comprensione nella patogenesi di CVID e dei sui vari sottotipi e possono piombo ai trattamenti futuri,„ ha detto l'arancia.

I risultati di GWAS hanno confermato la complessità genetica di CVID, ma più d'importanza per l'applicazione clinica, i ricercatori potevano usare le loro scoperte per sviluppare un algoritmo premonitore. Quando hanno verificato quell'algoritmo sui gruppi dei casi e dei comandi di CVID, potevano distinguere CVID dai comandi sani con 99 per cento di accuratezza.

I ricercatori ora stanno lavorando per raffinare l'algoritmo in un test diagnostico standardizzato per CVID. L'arancia aggiunta, “questo è molto emozionante. Suggerisce che possiamo potere usare il profilo genetico di un paziente ad una fase iniziale per predire se lui o lei svilupperà CVID. Dal trattamento precedente può notevolmente migliorare la capacità di un bambino di vivere con CVID, questa ricerca può rappresentare un avanzamento importante nella gestione della malattia complessa e d'imbarazzo.„