O estudo genoma-largo novo identifica causas da desordem imune da infância séria

Um estudo novo da genómica, conduzido pelo centro para genómica aplicada no hospital de crianças de Philadelphfia, ajusta a fase para o primeiro teste de diagnóstico com carácter de previsão em uma doença séria da imunodeficiência nas crianças. Se a desordem, doença da imunodeficiência da variável comum (CVID), pode ser diagnosticada cedo, as crianças podem receber tratamentos do salvamento antes que a doença possa progredir.

“Actualmente, pode haver um atraso de até nove anos da primeira vez que uma criança se torna doente desta doença muito complexa até que ou estejam diagnosticados,” disse Jordânia S. Alaranjado, M.D., Ph.D., um imunologista pediatra no hospital de crianças de Philadelphfia e autor do co-chumbo do estudo. “Durante este atraso, uma criança pode sofrer infecções e dano repetidos do órgão da vida-gordura. Identificar CVID em uma fase inicial pode permitir que os médicos intervenham mais cedo com tratamento apropriado.”

No hospital de crianças, a laranja dirige o centro diagnóstico e os cuidados de Jeffrey Modell para crianças com doenças preliminares da imunodeficiência. A laranja colaborou com o Hakon Hakonarson, M.D., Ph.D., director do centro para genómica aplicada no hospital de crianças de Philadelphfia, Charlotte Cunningham Rundles, M.D., da Faculdade de Medicina de Monte Sinai, do New York City, e dos pesquisadores de diversas outras instituições.

A pesquisa, o primeiro estudo população-baseado genoma-largo de CVID, o 15 de abril em linha aparecido no jornal da alergia e imunologia clínica.

Em CVID, uma criança tem um de baixo nível dos anticorpos (especificamente imunoglobulina), reduzindo a capacidade do corpo para lutar a doença, e deixando a criança vulnerável às infecções periódicas. CVID pode primeiramente ocorrer cedo ou mais tarde na vida, e os sintomas são altamente variáveis. As infecções respiratórias freqüentes podem conduzir a dano de pulmão permanente. Os pacientes podem igualmente sofrer a inflamação comum, as desordens do estômago e de entranhas, e um risco mais alto de cancros.

A grande variabilidade da doença, acoplada com a falta de um teste de diagnóstico bem defenido, faz com frequentemente que CVID vá undiagnosed por anos antes que os doutores possam iniciar o tratamento. A complexidade da doença igualmente frustrou tentativas de identificar causas.

No estudo actual, a equipa de investigação conduziu um estudo genoma-largo da associação (GWAS) para procurarar por comum e as variações genéticas raras que puderam permitir que os médicos identifiquem testes padrões genéticos encontraram nas crianças com CVID mas não em crianças saudáveis.

Usando o equipamento genotyping altamente automatizado no centro de hospital de crianças para genómica aplicada, a equipe de estudo executou um GWAS em uma amostra de 363 pacientes com o CVID, comparada a 3.031 controles saudáveis. Procurararam por polimorfismo do único-nucleotide (SNPs) assim como por umas variações mais raras do número de cópia (CNVs). SNPs é mudanças em uma única base do ADN, quando CNVs for suprimido ou seqüências repetidas em um estiramento do ADN.

O GWAS detectou uma associação forte com os genes na região complexa do histocompatibility (MHC) principal, uma área conhecida para jogar um papel importante em circunstâncias imune-relacionadas, e ligada previamente a CVID. Os pesquisadores igualmente encontraram que SNPs em uma área essa códigos para uma família das proteínas envolveu em respostas imunes.

Em sua pesquisa de CNV a equipe de estudo igualmente encontrou mais do que genes de dúzia novelas com importância directa ou potencial ao sistema imunitário. As descobertas do gene forneceram indícios à biologia pela maior parte desconhecida de como CVID se torna, derramando a luz nos mecanismos biológicos que são a base da doença. “Estes resultados fornecem a introspecção na patogénese de CVID e de seus vários subtipos, e podem conduzir aos tratamentos futuros,” disse a laranja.

Os resultados de GWAS confirmaram a complexidade genética de CVID, mas mais importante para a aplicação clínica, os pesquisadores podiam usar suas descobertas para desenvolver um algoritmo com carácter de previsão. Quando testaram esse algoritmo em coortes de casos e de controles de CVID, podiam distinguir CVID dos controles saudáveis com 99 por cento de precisão.

Os investigador estão trabalhando agora para refinar o algoritmo em um teste de diagnóstico estandardizado para CVID. A laranja adicionada, “isto é muito emocionante. Sugere que nós possamos poder usar o perfil genético de um paciente em uma fase inicial para prever se ou desenvolverão CVID. Desde um tratamento mais adiantado pode extremamente melhorar a capacidade de uma criança para viver com o CVID, esta pesquisa pode representar um avanço importante em controlar uma doença complexa, confundindo.”