Les Scientifiques produisent la première carte du réseau systématique des interactions de protéines de centrale

Un consortium international de scientifiques a produit la première carte du réseau systématique des interactions qui se produisent entre les protéines dans la thaliana d'Arabidopsis de centrale. (Arabidopsis est une centrale de moutarde qui a 27.000 protéines et servir d'organisme modèle populaire aux études biologiques des centrales, analogues aux rats de laboratoire qui servent d'organismes modèles populaires aux études biologiques des animaux.)

Connu comme « interactome, » la carte du réseau neuve d'Arabidopsis définit 6.205 interactions d'Arabidopsis de protéine-à-protéine concernant 2.774 différentes protéines. Par lui-même, ce plan double le volume de données sur des interactions de protéines aux centrales qui sont actuellement disponibles.

La carte du réseau neuve est couverte dans la question du 29 juillet de la Science. Elle a été produite avec le financement partiel à partir du National Science Foundation par le soi-disant « Consortium de Mappage d'Arabidopsis Interactome. » Le Consortium a une appartenance internationale et se compose de beaucoup d'institutions et de chercheurs.

La carte du réseau neuve du Consortium d'Arabidopsis a déjà fourni la fondation pour des découvertes neuves concernant la croissance et la résistance aux maladies de plantes. Par exemple, la question du 29 juillet de la Science comporte une étude d'accouplement cela--établi sur le plan neuf-- recense les protéines qui aident les agents pathogènes variés de lutte d'Arabidopsis. De Telles découvertes peuvent aider les efforts anticipés pour améliorer des plantes cultivées.

La production de la carte du réseau d'Arabidopsis a été rendue possible, en partie, par la production précédente de la séquence de génome d'Arabidopsis ; cette séquence est une véritable « liste des pièces » des composants génétiques de la centrale. Mais plus indiquant que la séquence de génome, la carte du réseau fournit des analyses sur les fonctionnements des protéines, de compositions des communautés de protéine, et des modifications évolutionnaires des protéines par le temps, notamment. (Voir l'illustration.)

« Ceci commence à nous donner une grande, niveau des systèmes image de la façon dont Arabidopsis fonctionne, et beaucoup de cette illustration niveau des systèmes va être appropriée à--et de recherche de guide davantage en circuit--l'autre substance de centrale, y compris ceux utilisés en agriculture humaine et même pharmaceutiques, » dit le biologiste Joseph Ecker, un membre expérimenté d'Institut de Salk du Consortium.

Cependant, à cause de la vaste complexité de la biologie d'Arabidopsis, les 6.205 interactions de protéine-à-protéine d'Arabidopsis recensées dans la carte du réseau neuve de la centrale représente seulement environ deux pour cent d'interactions de protéines d'Arabidopsis. On s'attend à ce que de Plus Grands et plus sensibles plans qui recensent plus de ces interactions soient développés à l'avenir.

Source : National Science Foundation