Os cientistas produzem o primeiro mapa de rede sistemático de interacções da proteína de planta

Um consórcio internacional de cientistas produziu o primeiro mapa de rede sistemático das interacções que ocorrem entre proteínas no thaliana de Arabidopsis da planta. (Arabidopsis é uma planta da mostarda que tenha 27.000 proteínas e saques como um organismo modelo popular para os estudos biológicos das plantas, análogos aos ratos do laboratório que servem como organismos modelo populares para estudos biológicos dos animais.)

Sabido como um “interactome,” o mapa de rede novo de Arabidopsis define 6.205 interacções de Arabidopsis da proteína-à-proteína que envolvem 2.774 proteínas individuais. Por si só, este mapa dobra o volume de dados em interacções da proteína nas plantas que estão actualmente disponíveis.

O mapa de rede novo é coberto na introdução do 29 de julho da ciência. Foi produzido com o financiamento parcial do National Science Foundation pelo “Arabidopsis assim chamado Interactome que traça o consórcio.” O consórcio tem uma sociedade internacional e é compor de muitos instituições e pesquisadores.

O mapa de rede novo do consórcio de Arabidopsis tem já a fundação para as descobertas novas que envolvido a resistência do crescimento vegetal e de doença. Por exemplo, a introdução do 29 de julho da ciência caracteriza um estudo do companheiro isso--construído no mapa novo-- identifica as proteínas que ajudam Arabidopsis a lutar os vários micróbios patogénicos. Tais resultados podem ajudar os esforços avançados para melhorar plantas de colheita.

A produção do mapa de rede de Arabidopsis foi tornada possível, na parte, pela produção precedente da seqüência do genoma de Arabidopsis; esta seqüência é uma “lista de peças verídico” dos componentes genéticos da planta. Mas revelando do que a seqüência do genoma, o mapa de rede fornece introspecções nas funções das proteínas, das composições das comunidades da proteína, e das mudanças evolucionárias das proteínas com o tempo, entre outras coisas. (Veja a ilustração.)

“Isto começa dar-nos uma grande, imagem do sistema-nível de como Arabidopsis trabalha, e muita dessa imagem do sistema-nível está indo ser relevante a--e pesquisa mais adicional do guia sobre--a outra espécie da planta, incluindo aquelas usadas na agricultura humana e mesmo nos fármacos,” diz o biólogo Joseph Ecker do instituto de Salk, um membro superior do consórcio.

Não obstante, devido à complexidade vasta da biologia de Arabidopsis, as 6.205 interacções da proteína-à-proteína de Arabidopsis identificadas no mapa de rede novo da planta representam somente aproximadamente dois por cento de interacções da proteína de Arabidopsis. Os mapas maiores e mais sensíveis que identificam mais destas interacções são esperados ser desenvolvidos no futuro.