Los científicos producen el primer mapa de red sistemático de las acciones recíprocas de la fitoproteína

Un consorcio internacional de científicos ha producido el primer mapa de red sistemático de las acciones recíprocas que ocurren entre las proteínas en el thaliana de Arabidopsis de la instalación. (Arabidopsis es una instalación de la mostaza que tiene 27.000 proteínas y servicios como organismo modelo popular para los estudios biológicos de instalaciones, análogos a las ratas del laboratorio que sirven como organismos modelo populares para los estudios biológicos de animales.)

Conocido como “interactome,” el nuevo mapa de red de Arabidopsis define 6.205 acciones recíprocas de Arabidopsis de la proteína-a-proteína que implican 2.774 proteínas individuales. En sí mismo, este mapa duplica el volumen de datos sobre acciones recíprocas de la proteína en instalaciones que estén actualmente disponibles.

El nuevo mapa de red se reviste en la aplicación del 29 de julio la ciencia. Fue producido con el financiamiento parcial del National Science Foundation por el supuesto “Arabidopsis Interactome que correlacionaba el consorcio.” El consorcio tiene una calidad de miembro internacional y se compone de muchas instituciones e investigadores.

El nuevo mapa de la red del consorcio de Arabidopsis ha ofrecido ya el asiento para los nuevos descubrimientos que implicaban crecimiento vegetal y resistencia a la enfermedad. Por ejemplo, la aplicación del 29 de julio la ciencia ofrece un estudio del compañero eso--empleado el nuevo mapa-- determina las proteínas que ayudan a Arabidopsis a luchar diversos patógeno. Tales conclusión pueden ayudar a los esfuerzos anticipados de perfeccionar las plantas cultivadas.

La producción del mapa de red de Arabidopsis fue hecha posible, en parte, por la producción anterior de la serie del genoma de Arabidopsis; esta serie es una “lista de partes verdadera” de los componentes genéticos de la instalación. Pero revelando que la serie del genoma, el mapa de red ofrece discernimientos en las funciones de proteínas, de las composiciones de las comunidades de la proteína, y de los cambios evolutivos de proteínas con tiempo, entre otras cosas. (Véase el ejemplo.)

“Esto comienza a darnos un grande, retrato del sistema-nivel de cómo Arabidopsis trabaja, y mucho de ese retrato del sistema-nivel va a ser relevante a--e investigación adicional de la guía conectado--la otra especie de la instalación, incluyendo ésos usados en agricultura humana e incluso productos farmacéuticos,” dice al biólogo José Ecker, pieza mayor del instituto de Salk del consorcio.

Sin embargo, debido a la complejidad extensa de la biología de Arabidopsis, las 6.205 acciones recíprocas de la proteína-a-proteína de Arabidopsis determinadas en el nuevo mapa de la red de la instalación representan el solamente cerca de dos por ciento de acciones recíprocas de la proteína de Arabidopsis. Se prevee que mapas más grandes y más sensibles que determinan más de estas acciones recíprocas sean desarrollados en el futuro.