Utilisations créatives Neuves de l'ADN « barcoding »

Le « éclair de code barre » Global accélère ; 450 experts convergent Adelaïde le 28 novembre - 3 décembre

L'alimentation électrique scientifique récemment découverte rapidement « de relever les empreintes digitales » de la substance par l'intermédiaire de l'ADN est déployée de démasquer des phytothérapies de charlatan, indiquer des types de durée de vie Arctique antique congelée en pergélisol, exposition ce qui mange ce qu'en nature, et arrêtez les parasites des instruments aratoires et de sylviculture aux cadres, entre d'autres applications en travers d'une grande sélection d'intérêts publics.

La décomposition des utilités neuves créatives de l'ADN « barcoding » -- recensant la substance basée sur un extrait d'ADN -- occupera le stade de centre comme 450 experts en matière du monde s'assemblent à l'Université de l'Australie d'Adelaïde du 28 Novembre au 3 Décembre.

La technologie de code barre d'ADN a déjà suscité des Audiences du Congrès des USA en exposant répandue la « fraude de poissons » -- les poissons bon marché mal étiquetants en tant que substances plus désirables et plus chères aiment le thon ou la cordelette. D'Autres études cette année ont indiqué les ingrédients non inscrits dans des sachets à thé plante.

Les applications neuves Chaudes comprennent :

Ingrédients De Remplacement en phytothérapies

La Forte demande entraîne la « adultération régulière ou remplacement des médicaments plante, » les experts barcoding ont découvert.

En Effet, le chercheur Malaisien Muhammad Sharir Abdul Rahman de notes, un fraudeur dans son pays a traité le bois d'arbre en caoutchouc avec de la quinine pour lui donner un goût amer assimilé au longifolia d'Eurycoma -- un médicament traditionnel pour la malaria, le diabète et d'autres mal.

Une bibliothèque de codes barre d'ADN pour 1.200 substances de la centrale de la Malaisie avec la valeur médicinale potentielle est à l'étude, offrant éventuellement « une une trousse rapide de dépistage de phase » pour réduire la fraude dans l'industrie lucrative de phytothérapie, dit M. Sharir.

Ses préoccupations résonnent dans d'autres pays autour des teneurs réelles de certaines marques de ginseng et d'autres produits.

Les bibliothèques de code barre d'ADN sont en construction pour les plantes médicinales de plusieurs autres pays aussi bien, y compris l'Afrique du Sud, l'Inde et le Nigéria.

Pergélisol de Barcoding

Du rhinocéros laineux aux plantes et aux champignons, les scientifiques utilisant l'ADN déchiffrent ce qui a vécu dans l'environnement Arctique antique, produisant des analyses neuves dans le changement climatique dans le procédé.

Les analyses barcoding de « ADN » des cylindres du sédiment creusés du pergélisol Arctique s'échelonnant dans l'âge de 10.000 à plusieurs centaines de mille ans ont jeté l'animal de passé de la lumière en circuit et les distributions fongiques et les chercheurs permis pour impliquer quelle substance de centrale a vraisemblablement coexisté.

Les analyses de l'ADN des années du sédiment de pergélisol 15.000 à 30.000 de Sibérie du nord-est ont indiqué une plaine de steppe de prairie au cours de la période glaciaire supportant une diverse communauté mammifère, y compris le bison, les orignaux et l'ADN du rhinocéros laineux rare, le tout premier trouvé en sédiments de pergélisol.

Dit l'Université du chercheur Oslo-Basé Eva Bellemain, qui présentera le projet BarFrost (Barcoding de Pergélisol) : « Dans l'Arctique, fossiles soyez rare et long pour trouver et analyser. Cependant, l'ADN est une molécule dure. Il a dû être afin de servir à son but milliard de dernières années et plus. Incroyablement, il peut persister dans la saleté pour des dizaines de milliers d'années et rester relativement intact. »

Ce Qui mange ce que

La technologie peut même discerner la substance contenue dans l'intestin ou le fumier des animaux, indiquant ce qui mange ce qui. L'Université de la Croix de Hugh de chercheur d'Adelaïde, par exemple, détaillera sa recherche sur le régime de l'Australie à croissance rapide, 1 population million-intense des chameaux sauvages, qui influencent sévèrement l'écologie du pays.

Introduit pendant les 1800s comme animaux de paquet, les chameaux sauvages de l'Australie mangent un 80% environ de substances disponibles de centrale dans leur domaine.

Dit l'organisateur David Schindel, Secrétaire De Direction De conférence du CBOL, basé chez Smithsonian Institution, Washington, C.C : Les « Biologistes utilisés pour se reposer et attendre et observer pour apprendre comment les chaînes alimentaires fonctionnent en Nature et ce que se produit quand ils s'effondrent. Maintenant ils peuvent traiter des contenus de l'estomac et des échantillons de fumier pour obtenir l'illustration complète en quelques heures. »

Parasites Invasifs

Jusqu'ici, l'inspection de cadre pour maintenir les parasites des instruments aratoires, les insectes maladie-transportants et la substance invasive d'entrer dans un pays a été un effort de coup-et-coup manqué. Barcoding offre un outil pour passer des réponses dans la journée pour recevoir ou rejeter des importations, une délivrance d'importance économique aiguë pour l'Australie et le Nouvelle-Zélande.

Avec le financement d'Union Européenne, un consortium de 20 universités, les instituts de recherches, et d'autres organismes sont des associés dans le Projet QBoL (Code barre de Quarantaine de Durée De Vie, www.qbol.org), développant une bibliothèque de codes barre d'ADN pour aider rapidement à recenser les organismes invasifs communs que les autorités veulent arrêter aux cadres nationaux.

Avec l'outil neuf de code barre d'ADN, les inspecteurs mettent en boîte plus facilement et recensent sûrement et évitent ainsi l'entrée des parasites de envahissement comprenant des bactéries, des champignons, des mouches à fruit, d'autres insectes, des nématodes, des virus, des centrales et d'autres organismes. Le Commerce de la coupure de bois de construction de l'espèce menacée peut également être ralenti avec codes barre pour recenser des produits en bois et de bois de charpente.

Centaines de sujets à Adelaïde

« Du thé au thon, identification d'ADN entre dans la vie quotidienne, » Jesse Ausubel, présidence marqué à nouveau de Code barre International d'initiative (iBOL) de Durée De Vie, un programme de six ans maintenant dans le milieu du courant d'un groupe des laboratoires les plus actifs établissant la bibliothèque de code barre.

Ajoute M. Schindel : « Comme Google et Wikipedia, ADN barcoding n'a à peine existé il y a une décennie, et maintenant nous sommes une communauté vibrante établie sur les outils scientifiques du 21ème siècle. »

Le « ADN barcoding est la file exprese à résoudre plusieurs des mystères de la Nature concernant un éventail des intérêts nationaux. »

Il note que scores de sujets supplémentaires seront explorés à Adelaïde, enjambant la protection de l'environnement de santé, culturelle et, comme :

  • Recensant la proie des insectes maladie-transportants basés sur l'analyse de leurs repas de sang
  • « Barcoding Nemo » et toute autre substance du commerce ornemental de poissons
  • Recensement des champignons et des moulages
  • Estimation du mode global des pollinisateurs tels que des abeilles, et
  • L'Évaluation de la qualité de l'eau

Les repas de sang des insectes mordants

Ressemblant à une mouche domestique commune, la mouche tsé-tsé Africaine transmet la trypanosomiase, AKA la maladie du sommeil Africaines Humaines, aux gens et aux animaux. Un des vecteurs de maladies les plus dangereux du monde, elle a écarté l'épidémie 2008 dans laquelle 48.000 Ougandais sont morts. Et l'incidence économique annuelle est estimée à US$4.5 milliard, avec environ 3 millions de bétail détruits chaque année.

Les Scientifiques emploient codes barre d'ADN pour recenser la substance de mouche tsé-tsé et leur proie basées sur l'analyse des repas de sang de l'insecte, se démêlant la relation entre les hôtes et les vecteurs.

En développant la bibliothèque de code barre, les outils et la capacité de discerner promptement la substance des mouches tsé-tsé, des moustiques, des tiques et d'autres vecteurs des maladies telles que la malaria, la leishmaniose, la schistosomiase, l'encéphalite Japonaise, et la maladie de Lyme, scientifiques peuvent tracer des zones de risque plus efficacement et des autorités vigilantes à l'écart des dangers pour la santé.

Barcoders ont repris un objectif de cinq ans ambitieux une bibliothèque complète de 10.000 substances d'insecte qui endommagent ou détruisent tant de vies humaines : 3.000 1.000 de phlébotome, 2.000 de puceron noir, 2.000 de puce et 1.000 de tique substances de moustique.

Nemo et amis

Selon des scientifiques, plus de 1 milliard de poissons ornementaux -- comporter plus de 4.000 substances d'eau douce et 1.400 marines -- sont commercés internationalement tous les ans, les USA $5 milliards d'industrie s'élevant annuellement à 8 pour cent.

Les Chercheurs au travail sur cette question incluent Gulab Khedkar de l'Inde, qui indique : « Pour faciliter le commerce ornemental de poissons, et dans la conformité de la Loi de la Biodiversité (de l'Inde), une méthode universelle doit valider les poissons ornementaux avec leurs noms de substance. Ceci peut aider à assurer un poisson ornemental viable pour commercer. »

Champignons

Les Champignons sont un groupe taxonomique de beaucoup de lignées évolutionnaires importantes et distinctes, s'échelonnant des champignons aux moulages. Bien Que deux substances des champignons puissent être plus lointainement apparentées qu'un poisson est lié à un insecte, tous les champignons sont classifiés dans le même groupe.

On s'attend à ce que des Chercheurs à la conférence annoncent la sélection de la région de code barre pour des champignons. Les régions normales de code barre utilisées pour des animaux et végétaux n'est pas pertinente pour des champignons et un groupe de travail international avait réalisé des analyses comparatives des régions de candidat pendant deux années. On s'attend à ce que la décision ouvre les vannes à la recherche barcoding fongique.

Un projet sur les champignons d'intérieur qui posent des problèmes de santé humains sera également dévoilé à Adelaïde, affichant l'énorme potentiel pour des études fongiques.

Le scientifique Australien Wieland Meyer discute le ce, infections fongiques invasives solidement croissantes données, identification inadéquate, traitements limités et l'émergence des souches résistantes, « il y a un besoin urgent d'améliorer l'identification fongique » pour améliorer le traitement réussi.

Les Champignons fournissent également à l'humanité la nourriture et les antibiotiques et aux services de la fermentation et du délabrement. la taxonomie ADN-basée promet de révolutionner la compréhension de la diversité fongique et de connecter les leurs stades de durée de vie.

Objectif de Barcoders pour produire une bibliothèque au moins de 10.000 substances fongiques d'ici 2015, particulièrement pour les champignons d'intérieur, pour des basidiomycetes (« les champignons supérieurs ») et pour des agents pathogènes d'agriculture et de sylviculture.

Insectes pollinisateurs

Le service d'écosystème de la pollinisation de centrale par des insectes a une valeur globale prévue à plus de $400 milliards par année.

Facilité par Code barre International de Durée De Vie (iBOL), les barcoders étudient des tendances à long terme de population en assemblant des bibliothèques de code barre pour toutes les abeilles et d'autres pollinisateurs importants -- mouches et scarabées. En combination avec des campagnes aux mites, aux guindineaux et aux oiseaux de code barre, ils fourniront la base de données requise pour évaluer la condition des communautés de pollinisateur mondiales.

L'Évaluation de la qualité de l'eau

Les Scientifiques en Californie Du Sud et ailleurs frayent un chemin codes barre pour évaluer la qualité de l'eau marin d'eau douce et son incidence l'espèce marine dedans, sablent, déposent, et des roches ou dans la boue dans les rivières et en mer.

Traditionnellement après le rassemblement d'un échantillon d'eau en vrac, les taxonomists doivent recenser par vue plusieurs milliers d'invertébrés, un procédé exigeant des mois et des milliers de dollars. Codes barre d'ADN leur permettent d'analyser les échantillons en vrac dans une fraction du temps à une fraction du prix.

Des projets Assimilés en cours en Corée, en Irak, en Belgique et la région Baltique seront présentés à Adelaïde.

L'ADN barcoding apparaît comme outil de choix pour surveiller la qualité de l'eau, bibliothèques de code barre d'ADN des insectes aquatiques en construction. Des technologies Neuves sont développées et testées qui permettront des analyses plus rapides et plus complètes des communautés biologiques entières dans le streamwater sur des « microprocesseurs d'ADN et par l'ordonnancement de la deuxième génération.

Dit M. Schindel : « Il prenait des semaines ou des mois pour analyser les organismes dans les flots pour déterminer la qualité de l'eau. Maintenant cela prend à des heures à une fraction le coût. »

Un éclair global de code barre

Les Scientifiques à Adelaïde avanceront également le progrès vers une bibliothèque internationale de codes barre pour des substances de 500.000 centrale, d'animal et de champignons dans un délai de cinq ans - « un éclair de code barre » qui pourrait transformer la science de biologie. Code barre de Base De Données de Durée De Vie comprend plus de 167.000 sûrement nommés et substance provisoire aujourd'hui. Les Guindineaux et les mites sont le plus grand groupe bien-analysé jusqu'ici, avec plus de 60.000 nommés et substance provisoire -- une grande partie du total prévu du monde de 170.000.

Les mines d'or pour barcoding sont les musées et les herbiers du monde, où les spécimens innombrables de substance sont grâce concentrée et dispensée aux placements grands du temps et des dollars.

Il y a une année, une équipe d'Institut de cinq Biodiversités des chercheurs d'Ontario a conduit un éclair de code barre dans la Collection Nationale Australienne d'Insecte. Se Concentrant sur des mites et des guindineaux pendant 10 semaines, ils ont traité plus de 28.000 spécimens représentant plus de 8.000 substances et 65 pour cent de la substance connue de l'insecte du pays 10.000. En Attendant au Musée National de Smithsonian Institution de l'Histoire Naturelle, Une autre équipe récent à code à barres plus de 3.000 tissus figés d'oiseau de plus de 1.400 substances, ajoutant plus de 500 substances neuves à la bibliothèque aviaire du monde ADN, couvrant maintenant environ 40% d'oiseaux connus.

Les techniques Neuves pour l'extraction d'ADN introduisent des spécimens plus anciens et plus anciens dans des musées d'histoire naturelle dans la tranche d'âge où l'ADN barcoding peut être pertinent. Ces découvertes ouvriront des questions neuves de recherches au sujet des changements des substances au cours des siècles antérieurs de l'incidence humaine sur les populations naturelles.

Le Jardin Botanique de Munich est la plus défunte institution avec une collection importante de spécimens bien fondés de référence ouvrant son ramassage à un éclair de code barre d'ADN.

La capacité de recenser et discerner la substance connue et inconnue ever more plus rapidement, à bon marché, facilement et exactement basé sur des extraits d'indicatif d'ADN s'est développée d'un rapport de recherche en 2003 à une entreprise globale en pleine expansion aujourd'hui, abouti par le Consortium pour Code barre de la Durée De Vie (CBOL) chez Smithsonian Institution.

Code barre International de Conférence de Durée De Vie à Adelaïde est le 4ème dans une suite qui a commencé au Musée d'Histoire Naturelle, Londres, en février 2005.

En 2005, il y avait 33.000 dossiers couvrant 12.700 substances dans Code barre des Systèmes de Données de Durée De Vie (GRAS) à l'Université de Guelph, Canada. Affichant une augmentation de plus de 40 fois, presque 1,4 millions de dossiers sont maintenant encaissés, représentant approximativement 167.000 connus et substance provisoire (voir le www.barcodinglife.org/views/taxbrowser_root.php).

Le Consortium pour Code barre de la Durée De Vie (CBOL) développe l'ADN barcoding comme norme globale pour l'identification de substance. Avec plus de 200 organismes de membre de plus de 50 pays, les constructions participation globale de CBOL, fixe des normes de communauté, et dispense et supporte des groupes de travail, ateliers, réseaux, opportunités de formation, et les Conférences Internationales ont retenu tous les deux ans. Libérez et ouvrez-vous à tous, CBOL introduit la conscience générale de barcoding par un site Web de l'information (www.barcodeoflife.org) et le partage des informations Connectent (http://connect.barcodeoflife.net), Code barre de réseau social de Durée De Vie.

L'initiative génomique de la plus grande biodiversité jamais lancée, Code barre International de Durée De Vie (l'iBOL, http://ibol.org) vise à produire d'ici la fin de l'année 2015 une bibliothèque de référence de 5 millions de Séquences d'ADN normalisées capables de recenser 500 mille substances, davantage qu'un quart de toute la substance connue sur Terre. Siégé au Canada, le programme d'iBOL est la création de plus de 100 scientifiques de plus de 20 pays. Lancé en 2010 avec le support du Génome Canada et de l'Institut Génomique d'Ontario, les participants des iBOL commettez le support moyen-financier, effort humain, et spécimen-vers l'objectif 5M/500K.

Ordre Du Jour à Adelaïde : www.dnabarcodes2011.org/conference/program/schedule/index.php

Les parraineurs de Commandant du mouvement barcoding global incluent :

Académie des Sciences Chinoise
CONABIO et CONACYT (Mexique)
Génome Canada
Ministère De L'éducation Fédéral Allemand Et la Recherche (BMBF)
Centre de Recherches International de Développement (Canada)
Fondation de Richard Lounsbery
Ministère de la Science et Technologie (Brésil)
Gordon et Fondation de Betty Moore
Conseil " Recherche " Naturel de Scientifiques et Techniques (Canada)
Institut de Génomique d'Ontario
Ministère d'Ontario de Recherche et d'Innovation
Alfred P. Sloan Foundation
Smithsonian Institution
Université d'Adelaïde
Université de Guelph

Source : Consortium pour Code barre de la Durée De Vie (CBOL)