Nuevas aplicaciones creativas de la DNA “barcoding”

Los “bombardeos Globales del código de barras aceleran; 450 expertos convergen el Adelaide el 28 de noviembre - 3 de diciembre

Se está desplegando la potencia científica newfound “de tomar las huellas dactilares rápidamente” especie vía la DNA de desenmascarar remedio herbario del curandero, revelar tipos de vida Ártica antigua congelada en capa permanente de hielo, exposición qué come lo que en naturaleza, y pare los parásitos agrícolas y de la silvicultura en las bandas, entre otras aplicaciones a través de una amplia gama de intereses públicos.

La explosión de nuevas aplicaciones creativas de la DNA “barcoding” -- determinando la especie basada en un recorte de la DNA -- ocupará el escenario de centro como 450 expertos del mundo convocan en la Universidad de Australia de Adelaide del 28 de Noviembre al 3 de Diciembre.

La tecnología del código de barras de la DNA ha chispeado ya Sesiones del Congreso de los E.E.U.U. exponiendo “fraude disperso de los pescados” -- los pescados baratos mislabelling como especies más deseables y más costosas tienen gusto del atún o de los mordedores. Otros estudios este año revelaron los ingredientes sin apuntar en bolsitas de té herbarias.

Las nuevas aplicaciones Calientes incluyen:

Ingredientes Substitutos en remedio herbario

De mucha demanda está causando la “adulteración regular o la substitución de drogas herbarias,” los expertos barcoding ha descubierto.

De Hecho, el investigador Malasio Mohamed Sharir Abdul Rahman de las notas, un impostor en su país trató la madera del árbol de goma con la quinina para darle un gusto amargo similar al longifolia de Eurycoma -- un remedio tradicional para la malaria, la diabetes y otras dolencias.

Una biblioteca de los códigos de barras de la DNA para 1.200 especies de la instalación de Malasia con valor medicinal potencial está en el revelado, ofreciendo eventual “un un conjunto rápido de la detección del paso de progresión” para reducir fraude en la industria lucrativa del remedio herbario, dice a Sr. Sharir.

Sus preocupaciones resuenan en otros países alrededor del contenido verdadero de ciertas marcas de ginseng y de otros productos.

Las bibliotecas del código de barras de la DNA son bajo construcción para las plantas medicinales de varias otras naciones también, incluyendo Suráfrica, la India y Nigeria.

Capa permanente de hielo de Barcoding

Del rinoceronte lanoso a las instalaciones y a los hongos, los científicos que usan la DNA están descifrando qué vivió en el ambiente Ártico antiguo, creando nuevos discernimientos en cambio de clima en el proceso.

Los análisis barcoding de la “DNA” de los cilindros del sedimento vaciados de la capa permanente de hielo Ártica que colocaba en edad a partir del 10.000 a varios cientos de mil años han vertido el animal del pasado de la luz conectado y las distribuciones fungicidas y los investigadores permitidos para deducir coexistió qué especie de la instalación probablemente.

Los análisis de la DNA de los años del sedimento 15.000 a 30.000 de la capa permanente de hielo de Siberia del noreste revelaron un llano de la estepa del prado durante el período glacial que apoyaba a una comunidad diversa del mamífero, incluyendo el bisonte, los alces y la DNA del rinoceronte lanoso raro, el primero encontrado en sedimentos de la capa permanente de hielo.

Dice la Universidad del investigador Oslo-Basado Eva Bellemain, que presentará el proyecto BarFrost (Barcoding de la Capa Permanente De Hielo): “En el Ártico, fósiles sea escaso y que toma tiempo encontrar y analizar. Sin Embargo, la DNA es una molécula resistente. Tuvo que ser para servir a su propósito los mil millones años pasados y más. Increíblemente, puede retrasarse en el suelo por decenas de miles de años y tirante relativamente intacta.”

Qué come qué

La tecnología puede incluso distinguir la especie contenida en la tripa o el estiércol de animales, revelando qué come lo que. La Universidad de la Cruz de Hugh del investigador de Adelaide, por ejemplo, detallará su investigación en la dieta de Australia de rápido crecimiento, 1 población millón-fuerte de camellos salvajes, que afectan seriamente la ecología del país.

Introducido en los 1800s como animales de paquete, los camellos salvajes de Australia comen un 80% estimado de especies disponibles de la instalación en su rango.

Dice al organizador David Schindel, Secretario Ejecutivo de la conferencia del CBOL, basado en Smithsonian Institution, Washington, C.C.: Suceso los “Biólogos usados para sentarse y para esperar y para mirar para aprender cómo las redes alimentarias trabajan en Naturaleza y lo que cuando se desploman. Ahora pueden tramitar contenido de estómago y dung muestras para conseguir el retrato completo en algunas horas.”

Parásitos Invasores

Hasta ahora, el examen de la banda para guardar a parásitos agrícolas, los insectos enfermedad-que llevaban y la especie invasor de entrar en un país ha sido un esfuerzo de la golpe-y-falta. Barcoding ofrece una herramienta para llegar respuestas el mismo día para validar o rechazar las importaciones, una aplicación la importancia económica aguda a Australia y Nueva Zelanda.

Con el financiamiento de la Unión Europea, un consorcio de 20 universidades, los institutos de investigación, y otras organizaciones son socios en el Proyecto QBoL (Código De Barras de la Cuarentena de la Vida, www.qbol.org), desarrollando una biblioteca de los códigos de barras de la DNA para ayudar rápidamente a determinar los organismos invasores comunes que las autoridades quieren parar en las bandas nacionales.

Con la nueva herramienta del código de barras de la DNA, los inspectores pueden más fácilmente y determinan seguramente y previenen así el asiento de parásitos invasores incluyendo bacterias, hongos, moscas del vinagre, otros insectos, nematodos, virus, instalaciones y otros organismos. El Comercio del corte de la madera de la especie en peligro se puede también reducir con los códigos de barras para determinar productos de madera y de la madera de construcción.

Centenares de temas en Adelaide

“De té al atún, identificación de la DNA ahora está incorporando vida cotidiana,” Jesse comentado Ausubel, silla del Código De Barras Internacional (iBOL) de la iniciativa de la Vida, un programa de seis años en centro de la corriente de un grupo de los laboratorios más activos que construyen la biblioteca del código de barras.

Agrega al Dr. Schindel: “Como Google y Wikipedia, DNA el barcoding existió apenas hace una década, y ahora somos una comunidad vibrante empleada las herramientas científicas del siglo XXI.”

La “DNA barcoding es la senda expresa a resolver muchos de los misterios de la Naturaleza relevantes a un espectro de intereses nacionales.”

Él observa que decenas de temas adicionales serán explorados en Adelaide, atravesando la protección del medio ambiente de la salud, cultural y, por ejemplo:

  • Determinando la presa de los insectos enfermedad-que llevan basados en el análisis de sus comidas de la sangre
  • “Barcoding el Nemo” y la otra especie del comercio ornamental de los pescados
  • Determinar hongos y moldes
  • Evaluación del estatus global de donadoras de polen tales como abejas, y
  • Evaluar calidad del agua

Las harinas de sangre de insectos penetrantes

Asemejándose a una mosca doméstica común, el mosca tse-tsé Africano transmite tripanosomiasis Africana Humana, AKA enfermedad durmiente, a la gente y a los animales. Uno de los vectores más peligrosos de la enfermedad del mundo, extendió la epidemia 2008 en la cual 48.000 Ugandans murieron. Y el impacto económico anual se estima en US$4.5 mil millones, con alrededor 3 millones de ganado matado cada año.

Los Científicos están utilizando códigos de barras de la DNA para determinar la especie del mosca tse-tsé y su presa basadas en el análisis de las harinas de sangre del insecto, desenredando el lazo entre los ordenadores principal y los vectores.

Desarrollando la biblioteca del código de barras, las herramientas y la capacidad de distinguir fácilmente la especie de mosca tse-tsé, de mosquitos, de señales y de otros vectores de enfermedades tales como malaria, leishmaniasis, esquistosomiasis, encefalitis Japonesa, y enfermedad de Lyme, científicos pueden correlacionar áreas del riesgo más eficientemente y autoridades alertas a la extensión de las amenazas de la salud.

Barcoders ha tomado una meta de cinco años ambiciosa una biblioteca completa de 10.000 especies del insecto que dañan o destruyen tan muchas vidas humanas: 3.000 1.000 del mosquito, 2.000 del jején, 2.000 de la pulga y 1.000 de la señal especies del mosquito.

Nemo y amigos

Según científicos, sobre 1 mil millones pescados ornamentales -- comprender más de 4.000 especies de agua dulce y 1.400 marinas -- se negocian internacionalmente cada año, un E.E.U.U. $5 mil millones de la industria que crece anualmente en el 8 por ciento.

Los Investigadores en el trabajo sobre esta edición incluyen Gulab Khedkar de la India, que dice: “Para facilitar el comercio ornamental de los pescados, y en concordancia del Acto de la Biodiversidad (de la India), un método universal debe validar los pescados ornamentales con sus nombres de la especie. Esto puede ayudar a asegurar un pescado ornamental sostenible para negociar.”

Hongos

Los Hongos son un grupo taxonómico de muchos linajes evolutivos importantes, distintos, colocando de hongos a los moldes. Aunque dos especies de hongos puedan ser más distante relacionadas que un pescado se relaciona con un insecto, todos los hongos se clasifican en el mismo grupo.

Se prevee que a los Investigadores en la conferencia anuncien la selección de la región del código de barras para los hongos. Las regiones estándar del código de barras usadas para los animales y las instalaciones no son efectivas para los hongos y un grupo de trabajo internacional ha estado conducto análisis comparativos de las regiones del candidato por dos años. Se prevee que la decisión abra las compuertas en la investigación barcoding fungicida.

Un proyecto sobre los hongos interiores que causan problemas de salud humana también será revelado en Adelaide, mostrando el potencial enorme para los estudios fungicidas.

El científico Australiano Wieland Meyer sostiene ese, dado infecciones por hongos invasores constantemente cada vez mayores, identificación inadecuada, terapias limitadas y la aparición de deformaciones resistentes, “hay una necesidad urgente de mejorar la identificación fungicida” para mejorar el tratamiento acertado.

Los Hongos también proporcionan humanidad de la comida y de los antibióticos y los servicios de la fermentación y de la extinción. la taxonomía DNA-basada promete revolucionar la comprensión de la diversidad fungicida y conectar sus escenarios de la vida.

Objetivo de Barcoders para crear una biblioteca por lo menos de 10.000 especies fungicidas en 2015, especialmente para los hongos interiores, para los basidiomicetos (los “hongos más altos”) y para los patógeno de la agricultura y de la silvicultura.

Donadoras de polen de Insecto

El servicio del ecosistema de la polinización de la instalación por los insectos tiene un valor global estimado en más de $400 mil millones al año.

Facilitado por el Código De Barras Internacional de la Vida (iBOL), los barcoders están reconociendo tendencias a largo plazo de la población ensamblando las bibliotecas del código de barras para todas las abejas y otras donadoras de polen importantes -- moscas y martinetes. Conjuntamente con campañas a las polillas, a las mariposas y a los pájaros del código de barras, proporcionarán a la base de datos necesaria para evaluar el estado de las comunidades de la donadora de polen por todo el mundo.

Evaluar calidad del agua

Los Científicos en California Meridional y a otra parte están promoviendo códigos de barras para evaluar calidad del agua marina de agua dulce y su impacto en vida marina hacia adentro, la arena, el sedimento, y las rocas o en barro en los ríos y a poca distancia de la costa.

Tradicionalmente después de cerco una muestra de agua a granel, los taxonomists deben determinar por mira varios miles de invertebrados, un proceso que requiere meses y millares de dólares. Los códigos de barras de la DNA les permiten analizar muestras a granel en una parte de la hora en una parte del costo.

Los proyectos Similares en curso en Corea, Iraq, Bélgica y la región Báltica serán presentados en Adelaide.

La DNA barcoding está emergiendo como la herramienta de la opción para vigilar la calidad del agua, bibliotecas del código de barras de la DNA de insectos acuáticos bajo construcción. Se están desarrollando y se están probando las Nuevas tecnologías que permitirán análisis más rápidos y más completos de comunidades biológicas enteras en streamwater en los “microchipes de la DNA” y con la secuencia de la siguiente-generación.

Dice al Dr. Schindel: “Tardaba semanas o meses para analizar los organismos en secuencias para determinar calidad del agua. Ahora toma a horas en una fracción el costo.”

Un bombardeo global del código de barras

Los Científicos en Adelaide también avance progreso hacia una biblioteca internacional de los códigos de barras para las especies de 500.000 instalación, del animal y de los hongos en el plazo de cinco años - “un bombardeo del código de barras” que podría transformar ciencia de la biología. El Código De Barras de la Base De Datos de la Vida incluye más de 167.000 nombrados seguro y especie provisional hoy. Las Mariposas y las polillas son el grupo bien-analizado más grande hasta ahora, con sobre 60.000 nombrados y especie provisional -- mucho del total estimado del mundo de 170.000.

Las minas de Oro para barcoding son los museos y los herbarios del mundo, en donde se concentran los especímenes incontables de la especie y los gracias ordenados a las grandes inversiones del tiempo y de los dólares.

Hace un año, las personas del Instituto de cinco Biodiversidades de los investigadores de Ontario conducto un bombardeo del código de barras en la Colección Nacional Australiana del Insecto. Centrándose en polillas y mariposas por 10 semanas, tramitaron sobre 28.000 especímenes que representaban sobre 8.000 especies y el 65 por ciento de la especie sabida del insecto del país 10.000. Mientras Tanto en el Museo Nacional de Smithsonian Institution de la Historia Natural, otras personas recientemente con código de barras sobre 3.000 tejidos congelados del pájaro sobre de 1.400 especies, agregando más de 500 nuevas especies a la biblioteca aviar de la DNA del mundo, ahora revistiendo el cerca de 40% de pájaros sabidos.

Las Nuevas técnicas para la extracción de la DNA están trayendo más viejos y más viejos especímenes en museos de la historia natural en el rango de edad donde la DNA barcoding puede ser efectiva. Estos descubrimientos abrirán nuevas preguntas de la investigación sobre cambios en especies durante los últimos siglos de impacto humano en poblaciones naturales.

El Jardín Botánico de Munich es la última institución con una colección importante de especímenes autoritarios de la referencia que abren su colección en un bombardeo del código de barras de la DNA.

La capacidad de determinar y de distinguir más rápidamente, barato sabida y desconocida especie, basado fácilmente y exactamente en recortes del código de la DNA creció de un trabajo de investigación en 2003 a una empresa global que brotaba hoy, llevado por el Consorcio para el Código De Barras de la Vida (CBOL) en Smithsonian Institution.

El Código De Barras Internacional de la Conferencia de la Vida en Adelaide es el 4to en una serie que comenzó en el Museo de la Historia Natural, Londres, en febrero de 2005.

En 2005, había 33.000 archivos que revestían 12.700 especies en el Código De Barras de los Sistemas de Datos de la Vida (INTRÉPIDOS) en la Universidad de Guelph, Canadá. Mostrando un aumento de más de 40 dobleces, casi 1,4 millones de archivos ahora se depositan, representando áspero 167.000 conocidos y especie provisional (véase www.barcodinglife.org/views/taxbrowser_root.php).

El Consorcio para el Código De Barras de la Vida (CBOL) desarrolla la DNA barcoding como patrón global para la identificación de la especie. Con más de 200 organizaciones de la pieza de más de 50 países, las estructuras participación global de CBOL, fijan patrones de la comunidad, y ordenan y utilizan los grupos de trabajo, cursos, redes, oportunidades de entrenamiento, y las Conferencias Internacionales llevaron a cabo cada dos años. Libere y ábrase en todos, CBOL asciende la percatación general de barcoding a través de un Web site de la información (www.barcodeoflife.org) y la distribución de información Conecta a través (http://connect.barcodeoflife.net), el Código De Barras de la red del social de la Vida.

La iniciativa más grande puesta en marcha nunca, el Código De Barras Internacional de la genómica de la biodiversidad de la Vida (el iBOL, http://ibol.org) apunta crear a finales de año 2015 una biblioteca de referencia de 5 millones de series estandardizadas de la DNA capaces de determinar 500 mil especies, más que un cuarto de toda la especie sabida en la Tierra. Establecido Jefatura en Canadá, el programa del iBOL es la creación de más de 100 científicos de más de 20 países. Lanzado en 2010 con el soporte del Genoma Canadá y del Instituto de la Genómica de Ontario, los participantes de los iBOL comprometa el soporte recurso-financiero, esfuerzo humano, y espécimen-hacia la meta 5M/500K.

Orden Del Día en Adelaide: www.dnabarcodes2011.org/conference/program/schedule/index.php

Los patrocinadores del Comandante del movimiento barcoding global incluyen:

Academia de Ciencias China
CONABIO y CONACYT (México)
Genoma Canadá
El Ministerio de Educación e Investigación Federales Alemanes (BMBF)
Centro de Investigación Internacional del Revelado (Canadá)
Asiento de Richard Lounsbery
El Ministerio de la Ciencia y de la Tecnología (el Brasil)
Asiento de Gordon y de Betty Moore
Ciencias Naturales y el Consejo de Investigación de la Ingeniería (Canadá)
Instituto de la Genómica de Ontario
El Ministerio de Ontario de la Investigación y de la Innovación
Alfred P. Sloan Foundation
Smithsonian Institution
Universidad de Adelaide
Universidad de Guelph

Fuente: Consorcio para el Código De Barras de la Vida (CBOL)