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O CUBO de Indiana CTSI oferece o software livre acelerar a pesquisa clínica e translational

Numa altura em que a investigação médica exige cada vez mais a colaboração por um grande número povos ocupados, o CUBO clínico e Translational do Indiana da ciência do instituto oferece um modelo para usar tecnologia da informação avançada aos cientistas da relação, aos fornecedores da saúde, aos sócios da comunidade e a outro com a finalidade de acelerar a pesquisa clínica e translational.

O CUBO de Indiana CTSI é uma organização virtual, da instituição-escala de investigação médica para Indiana, incluindo a universidade de Indiana, a universidade de Purdue e a universidade de Notre Dame. Lançado em 2008 com apoio dos institutos de saúde nacionais, apoia equipas de investigação clínicas virtuais, a pesquisa contratada a comunidade, a revelação de programa de investigação, e o outreach do indústria e o público.

“A cultura da pesquisa deslocou para team a ciência, programas de investigação distribuídos, e recursos analíticos distribuídos tais como sequenceres e colliders do gene,” disse William K. Barnett, director da arquitetura da informação para o Indiana CTSI. As “equipes dos investigador devem poder encontrar-se colaboradora, submeter concessões da junção, administrar programas de investigação, limas e dados da parte, instrumentação do acesso e trabalhos, e publicar resultados.”

Barnett, do instituto patente das tecnologias de universidade de Indiana, descreveu o projecto hoje, o 19 de fevereiro, na reunião anual da associação americana para o avanço da ciência em Vancôver, B.C. Sua conversa era parte de um painel em HUBzero, uma plataforma de software livre criada por cientistas da universidade de Purdue para permitir que os cientistas usem-se e as ferramentas da pesquisa da parte, as apresentações e os resultados. O painel igualmente incluído:

  • Michael McLennan, cientista superior da pesquisa na universidade de Purdue, que discutiu nanoHUB.org, que fornece a cyber-infra-estrutura para a comunidade da nanotecnologia, conectando pesquisadores um com o otro e a simulação e modelando ferramentas para fazer seu trabalho.
  • Ellen M. Rathje, professor da engenharia civil na Universidade do Texas, que explicou a cyber-infra-estrutura HUBzero-baseada usou-se pela rede do Jr. de George E. Brown para que a simulação da engenharia de terremoto permita pesquisadores do terremoto de compartilhar de recursos.

Barnett explorou os usos de HUBzero apoiar a pesquisa e a prática de cuidados médicos. Por exemplo, o CUBO da engenharia do cuidado do cancro é uma organização virtual que apoie a investigação do cancro colorectal e de outros projectos clínicos na Faculdade de Medicina e em Purdue do IU. Os dados do alojamento centralmente e fazendo lhe relações directas facilmente acessíveis da Web do CUBO conduziram a uma aceleração marcada da pesquisa através de cinco equipes distribuídas, Barnett disse.

Além do que a arquitetura modular do CUBO usual, as ferramentas de publicação para compartilhar do índice e das extensões de Joomla do open source para a funcionalidade, o CUBO de Indiana CTSI fornece o apoio federado da identidade para o acesso confiado aos dados sensíveis. Incorpora ferramentas tais como a parte Alfresco, que permite que os pesquisadores criem rapidamente espaços da Web para compartilhar de limas e ter discussões; REDCap, uma ferramenta para criar, usar e compartilhar de bases de dados da pesquisa; e i2iConnect, que liga pesquisadores aos sócios potenciais da indústria que estão procurando ideias e projectos inovativos.