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El CUBO de Indiana CTSI ofrece el software libre para acelerar la investigación clínica y de translación

En un momento en que la investigación médica requiere cada vez más la colaboración de un gran número de personas ocupadas, el CUBO clínico y de translación de la Indiana de la ciencia del instituto ofrece un modelo para usar la tecnología de la información avanzada a los científicos del eslabón, a los proveedores de la salud, a los socios de la comunidad y a otros con el fin de acelerar la investigación clínica y de translación.

El CUBO de Indiana CTSI es una organización virtual, de la institución-escala de investigación médica para Indiana, incluyendo la universidad de Indiana, la universidad de Purdue y la universidad de Notre Dame. Lanzado en 2008 con el apoyo de los institutos de la salud nacionales, soporta los equipos de investigación clínicos virtuales, el revelado dedicado comunidad de la investigación, del programa de investigación, y el outreach del industria y público.

“La cultura de la investigación ha cambio para team la ciencia, programas de investigación distribuidos, y los recursos analíticos distribuidos tales como secuenciadores y colliders del gen,” dijo a Guillermo K. Barnett, director de la configuración de la información para la Indiana CTSI. Las “personas de investigadores deben poder encontrarse colaborativo, someter concesiones de la junta, administrar programas de investigación, los archivos y los datos de la parte, instrumentación del acceso y los flujos de trabajo, y publicar resultados.”

Barnett, del instituto penetrante de las tecnologías de la universidad de Indiana, describió el proyecto hoy, el 19 de febrero, en la reunión anual de la asociación americana para el adelanto de la ciencia en Vancouver, A.C. Su charla era parte de un panel en HUBzero, una plataforma del software libre creada por los científicos de la universidad de Purdue para permitir que los científicos utilicen y las herramientas de la investigación de la parte, las presentaciones y las conclusión. El panel también incluido:

  • Michael McLennan, científico mayor de la investigación en la universidad de Purdue, que discutió nanoHUB.org, que ofrece la cibernético-infraestructura para la comunidad de la nanotecnología, conectando a investigadores con uno a y con la simulación y modelando las herramientas para hacer su trabajo.
  • Ellen M. Rathje, profesor del genio civil en la Universidad de Texas, que explicó la cibernético-infraestructura HUBzero-basada utilizó por la red del Jr. de George E. Brown para que la simulación de la ingeniería de terremoto permita a investigadores del terremoto compartir recursos.

Barnett exploró las aplicaciones de HUBzero de soportar investigación en asistencia sanitaria y práctica. Por ejemplo, el CUBO de la ingeniería del cuidado del cáncer es una organización virtual que soporta la investigación del cáncer colorrectal y de otros proyectos clínicos en la Facultad de Medicina y Purdue del IU. Los datos de la cubierta centralmente y haciéndole interfaces directos accesibles de la membrana del CUBO dieron lugar fácilmente a una aceleración marcada de la investigación a través de cinco personas distribuidas, Barnett dijo.

Además de la configuración modular del CUBO usual, publicar las herramientas para compartir las extensiones contentas y de fuente abierta de Joomla para las funciones, el CUBO de Indiana CTSI proporciona el apoyo federado de la identidad para el acceso de confianza a los datos sensibles. Incorpora las herramientas tales como parte al aire libre, que permite que los investigadores creen rápidamente los espacios de la membrana para compartir archivos y tener discusiones; Mozo de estación, una herramienta para crear, usar y compartir bases de datos de la investigación; e i2iConnect, que conecta a investigadores a los socios potenciales de la industria que están buscando ideas y proyectos innovadores.