Métodos de la síntesis de la DNA: una entrevista con Clemens Richert

IMAGEN del ARTÍCULO de Clemens Richert

¿Cómo la síntesis de la DNA previamente se ha realizado en el laboratorio?

La síntesis automatizada de la DNA ha estado alrededor por casi tres décadas. La diferencia clave entre la metodología establecida para hacer los oligodeoxynucleotides (alargamientos cortos de la DNA de una sola fila) y nuestro método es el cabo del patrón.

Durante síntesis convencional de la DNA, la serie es determinada por el flujo de soluciones de las botellas que contienen los cuatro diversos bloques huecos (A, C, G, o T), controlada por una computador. En nuestro caso, la síntesis es dirigida por un cabo del patrón y es totalmente (bio) substancia química.

Así pues, nuestro método está más cercano a qué naturaleza hace cuando la DNA se repliega antes de la división celular. Utilizamos a un grupo más reactivo en los bloques huecos (un grupo amino), y mantenemos a este grupo un estado unreactive durante la incorporación en el cabo creciente, usando qué químicos sintetizados llaman de “grupo protección” para prevenir la polimerización no específica. Así pues, la selección de la base correcta en cada paso se puede regular por emparejar bajo de la Watson-Tortícolis.

¿Cómo cruciales eran las enzimas a esta técnica?

En absoluto. Nuestro método es enzima-libre. Esto es qué lo hace que excita.

¿Usted ha manejado producir una técnica de copiado sin las enzimas?

Sí, creemos tan. Debo mencionar, aunque, que estamos leyendo actualmente los alargamientos bastante cortos de la serie del patrón, y la tasa de error es bastante importante.

Esta nueva técnica puede sintetizar la DNA en la dirección preferida por naturaleza (3' dirección) y la dirección opuesta (5' dirección). ¿Cuáles son las ventajas de esto?

A este punto, consideramos este trabajo investigación básica. Así pues, es interesante ver que la síntesis patrón-dirigida de un cabo de la hija no está limitada al incremento en el 3' a 5' dirección. Si la naturaleza fuera ejecutar la réplica en ambas direcciones, no habría necesidad de los fragmentos de Okazaki. Presumimos que la naturaleza no eligió esta opción para mejorar procesos de la réplica del mando.

¿Cuáles son las limitaciones actuales a este método?

Qué estamos produciendo es técnico no DNA, sino un análogo cercano de la DNA con un átomo de oxígeno que es reemplazado por una mitad del NH. Las dos estructuras son isoelectrónicas (el mismo número de electrones) y áspero isostéricas (los stuctures tridimensionales similares en el duplex), pero no son idénticas.

Esto puede tener ventajas, pero es también una limitación. Estamos trabajando en las versiones que utilizan bloques huecos del ARN sin modificar para vencer esta limitación. También, según lo mencionado anterior, nos limitan actualmente a los alargamientos cortos (un giro espiral, 10 nucleótidos), sobre todo debido a nuestra técnica analítica (espectrometría de masa).

¿Cómo usted piensa métodos de la síntesis de la DNA se convertirá en el futuro?

Hay una carrera para los métodos que producen cabos más largos en una única corrida en un sintetizador de la DNA, de modo que menos reacciones de la ligadura sean genomas necesarios del sintético del montaje. No somos parte de esa carrera. Nuestro trabajo se centra en la demostración de la capacidad intrínseca de ácidos nucléicos a la réplica.

¿Usted tiene planes para la investigación adicional en esta área?

Oh, sí. La “cumbre siguiente” que estamos esperando toma de altura es demostrar varios cartuchos del copiado sin las enzimas. Estamos también muy interesados en qué series sobreviven varios cartuchos de la réplica.

¿Dónde pueden los programas de lectura encontrar más información?

http://chip.chemie.uni-stuttgart.de/

Sobre Clemens Richert

clip_image002

Ph.D. en Humano-Biología, 1993, L.M.U. Munich, Ph.D. en Chemistry, 1994, ETH Zurich

Actualmente silla de la química biológica en la universidad de Stuttgart

Presidente de la sociedad alemana de la química del ácido nucléico (DNG, ven: http://dnarna.de).

April Cashin-Garbutt

Written by

April Cashin-Garbutt

April graduated with a first-class honours degree in Natural Sciences from Pembroke College, University of Cambridge. During her time as Editor-in-Chief, News-Medical (2012-2017), she kickstarted the content production process and helped to grow the website readership to over 60 million visitors per year. Through interviewing global thought leaders in medicine and life sciences, including Nobel laureates, April developed a passion for neuroscience and now works at the Sainsbury Wellcome Centre for Neural Circuits and Behaviour, located within UCL.

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Cashin-Garbutt, April. (2018, August 23). Métodos de la síntesis de la DNA: una entrevista con Clemens Richert. News-Medical. Retrieved on March 31, 2020 from https://www.news-medical.net/news/20120907/DNA-synthesis-methods-an-interview-with-Clemens-Richert.aspx.

  • MLA

    Cashin-Garbutt, April. "Métodos de la síntesis de la DNA: una entrevista con Clemens Richert". News-Medical. 31 March 2020. <https://www.news-medical.net/news/20120907/DNA-synthesis-methods-an-interview-with-Clemens-Richert.aspx>.

  • Chicago

    Cashin-Garbutt, April. "Métodos de la síntesis de la DNA: una entrevista con Clemens Richert". News-Medical. https://www.news-medical.net/news/20120907/DNA-synthesis-methods-an-interview-with-Clemens-Richert.aspx. (accessed March 31, 2020).

  • Harvard

    Cashin-Garbutt, April. 2018. Métodos de la síntesis de la DNA: una entrevista con Clemens Richert. News-Medical, viewed 31 March 2020, https://www.news-medical.net/news/20120907/DNA-synthesis-methods-an-interview-with-Clemens-Richert.aspx.