Génome d'autisme non timide au sujet du bricolage avec les gènes importants

Une équipe internationale, aboutie par des chercheurs à partir de l'Université de Californie, École de Médecine de San Diego, a découvert que les mutations « faites au hasard » dans le génome ne sont pas bien si faites au hasard après tout. Leur étude, pour être publiée dans la cellule de tourillon le 21 décembre, prouve que la séquence d'ADN dans quelques régions du génome humain est tout à fait volatile et peut subir une mutation dix fois plus fréquemment que le reste du génome. Les gènes qui sont liés à l'autisme et à un grand choix d'autres troubles ont en particulier une forte tendance de subir une mutation.

Les boîtiers des mutations ou les « hotspots » ne sont pas seuls au génome d'autisme mais sont au lieu une caractéristique intrinsèque du génome humain, selon l'investigateur principal Jonathan Sebat, PhD, professeur de psychiatrie et médicament cellulaire et de molécule, et responsable du centre de Beyster pour la génomique moléculaire des maladies neuropsychiatriques chez Uc San Diego.

« Nos découvertes fournissent quelques analyses dans la base fondamentale de autisme-que, étonnant, le génome n'est pas timide au sujet du bricolage avec ses gènes importants » a dit Sebat. « À l'effet contraire, les gènes de pathogène tendent à être hypermutable. »

Sebat et collaborateurs de Hôpital-San Diego des enfants de Rady et de centre de génome de BGI en Chine ont ordonnancé les génomes complets des vrais jumeaux avec le trouble de spectre d'autisme et de leurs parents. Quand ils comparés les génomes des jumeaux aux génomes de leurs parents, les scientifiques ont recensé beaucoup de mutations de « lignée germinale » (les variants génétiques dans lesquels étaient présents jumelle mais pas présent dans leur mère ou père).

Presque 600 mutations germinales - hors d'un total de 6 milliards de paires de bases - ont été trouvées dans les 10 paires de vrais jumeaux ordonnancés dans l'étude. Une moyenne de 60 mutations a été trouvée dans chaque enfant.

« Tout le nombre de mutations que nous avons trouvées n'était pas étonnant, » a dit Sebat, « est exact il ce que nous compterions basé sur le taux de mutation humain normal. » Ce que les auteurs ont trouvé étonnant était que les mutations ont tendu à grouper dans certaines régions du génome. Quand les scientifiques ont regardé soigneusement les sites de la mutation, ils pouvaient déterminer les raisons pour lesquelles quelques régions génomique sont « chaudes » tandis que d'autres régions sont froides.

La « mutabilité pourrait être expliquée par les propriétés intrinsèques du génome, » a dit le chercheur post-doctoral Jacob Michaelson, auteur important d'Uc San Diego de l'étude. « Nous pourrions exactement prévoir le taux de mutation d'un gène basé sur la séquence d'ADN locale et sa structure de la chromatine, signifiant la manière dont l'ADN est empaqueté. »

Les chercheurs ont également observé quelques exemples remarquables de mutation grouper dans un enfant individuel, où une douche des mutations s'est produite d'un seul trait. « Quand les mutations multiples se produisent dans le même lieu, un tel événement a une possibilité plus grande de perturber un gène, » a dit Michaelson.

Les chercheurs ont conjecturé que les gènes hypermutable pourraient être appropriés à la maladie. Quand ils ont prévu les taux de mutation pour des gènes, les auteurs ont constaté que les gènes qui ont été liés à l'autisme étaient plus mutables que le gène moyen, proposant que certains des coupables génétiques qui contribuent à l'autisme soient des hotspots de mutation.

Les auteurs ont observé une tendance assimilée pour d'autres gènes de la maladie. Les gènes liés aux troubles dominants ont tendu à être hautement mutables, alors que les taux de mutation étaient inférieurs pour des gènes liés aux traits complexes.

« Nous planification pour nous concentrer sur ces hotspots de mutation dans nos futures études, » a dit Sebat. Le « ordonnancement de ces régions dans de plus grands numéros des patients a pu nous permettre de recenser plus des facteurs de risque génétique pour l'autisme. »

Les chercheurs à l'hôpital pour enfants d'Uc San Diego et de Rady recrutent activement des familles par EXTENSION appelée d'étude génétique une « , » qui est financée par la fondation de Simons. Pour plus d'informations sur cette étude ou pour obtenir impliqué dans la recherche d'autisme chez Uc San Diego, visite http://reachproject.ucsd.edu

Source:

University of California