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Découvertes de raffinage de mappage plus de 200 gènes de maladie de Crohn

Par Joanna Lyford, journaliste supérieur de medwireNews

Les chercheurs ont employé une technique génétique de mappage pour recenser plus de 200 gènes liés à la maladie de Crohn (CD), lui effectuant le trouble bien-caractérisé jusqu'à présent.

Nikolas supérieur Maniatis auteur (centre d'enseignement supérieur Londres, R-U) a dit dans une déclaration de pression : « La découverte de tant de localisations des gènes pour la maladie de Crohn est une étape importante vers l'avant en comprenant la maladie, qui a une base génétique très compliquée. Nous espérons que la méthode que nous avons employée ici pourra être employée pour recenser les gènes impliqués dans d'autres maladies qui sont assimilé complexes, par exemple les cancers et le diabète différents. »

Avant cette étude, 71 intervalles chromosomiques ont été connus pour être associés au CD, pourtant ceux-ci ont expliqué moins d'un quart de l'héritabilité de la condition. Pour gagner davantage d'analyse, Maniatis et collègues ont employé une approche neuve de mappage qui localise des variantes causales basées sur les plans à haute résolution dans des éléments de déséquilibre de lien (plans de LDU).

Ils se sont appliqués la technique aux ensembles de données à partir de deux études de la taille du génome récent entreprises d'association : le consortium de cas-témoin de confiance de Wellcome (WTCCC), qui comprend 1698 patients présentant le CD et 2948 contrôles ; et l'institut national américain du diabète et des maladies rénales digestives et (Institut national du diabète et des maladies digestives et de rein), qui inclut 813 patients présentant le CD et 947 contrôles éthniquement appariés.

D'une manière primordiale, les deux ensembles de données comprennent l'information phénotypique détaillée sur différents patients, y compris l'emplacement et la gravité de l'inflammation intestinale, permettant aux chercheurs de subdiviser des patients par exposé de la maladie.

Leur analyse a confirmé des associations entre le CD et 66 des 71 lieux précédemment rapportés, ainsi qu'a donné des estimations plus précises d'emplacement pour ces intervalles. En outre, l'équipe a recensé 78 régions neuves de gène qui ont répondu à des critères pour la signification de la taille du génome, fournissant à la preuve irréfutable de l'association le CD pour 144 gènes.

Supplémentaire, ils ont recensé 56 nominalement signes significatifs « avec plus rigoureux et le colocalization précis, » écrivent Maniatis et autres dans le tourillon américain de la génétique humaine. « Au total, nous fournissons la preuve pour 200 régions de gène, confirmant que le CD est vraiment multifactoriel et complexe en nature. »

Les chercheurs notent que la majorité de ces signes tracent aux gènes uniques, et que plusieurs des gènes recensés sont connus pour être fonctionellement impliqués dans des procédés immunisés et inflammatoires ; intéressant, leurs effets se sont étendus aux gens avec l'inflammation supplémentaire-iléique ainsi qu'iléique.

« Les gènes recensés faciliteront des modèles plus puissants de recherche expérimentale comprenant une gamme des études fonctionnelles et les analyses analytiques de voie pour le CD, » l'équipe conclut.

« Vu les estimations de haute définition, les résultats présentés ici laisseront des études resequencing plus visées et intelligemment plus conçues, où soigneusement caractérisées, des sous-groupes homogènes de cas peuvent plus à fond être vérifiées. »

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