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Premier multi-gène ADN ordonnançant le test lancé pour des malades du cancer

Le premier multi-gène ADN ordonnançant le test qui peut aider à prévoir les réactions des malades du cancer à la demande de règlement a été lancé dans le Service National de Santé (NHS), grâce à un partenariat entre les scientifiques à l'université d'Oxford et la confiance des hôpitaux NHS d'Université d'Oxford.

Le test emploie le dernier ADN ordonnançant des techniques pour trouver des mutations en travers de 46 gènes qui peuvent piloter l'accroissement de cancer des patients avec les tumeurs solides. La présence d'une mutation dans un gène peut potentiellement déterminer quelle demande de règlement un patient devrait recevoir.

Les chercheurs disent le nombre de repères vérifiés par gènes un changement d'opération d'introduire l'ADN de la deuxième génération ordonnançant la technologie dans les NHS, et des hérauts l'arrivée du médicament génomique avec le séquençage du génome entier des patients juste au coin de la rue.

Le beaucoup-gène ordonnançant le test a été lancé par l'institut national pour le centre de recherche biomédicale d'Oxford des recherches de santé (NIHR) (BRC), une collaboration entre la confiance des hôpitaux NHS d'Université d'Oxford et l'Université d'Oxford pour accélérer l'innovation de santé, et qui a pièce pièce cette initiative.

Le centre de diagnostic moléculaire de BRC effectue le test. Le laboratoire, basé aux hôpitaux d'Université d'Oxford, couvre tous les malades du cancer dans la région de Thames Valley. Mais les scientifiques examinent pour écailler ceci dans un service de NHS véritablement national par le cours de cette année.

Le test -300 neuf a pu sauvegarder manifestement plus dans des coûts de médicament en réussissant des patients aux bonnes demandes de règlement droits, réduisant le tort des effets secondaires ainsi que le temps détruit avant d'obtenir à un traitement efficace.

« Nous sommes les premiers pour introduire des tests diagnostique de multi-gène pour la tumeur profilant sur les NHS utilisant le dernier ADN ordonnançant la technologie, » dit M. Jenny Taylor du centre de confiance de Wellcome pour la génétique humaine à l'Université d'Oxford, qui est directeur de programme pour le médicament génomique au NIHR Oxford BRC et était impliquée dans le travail. « C'est un changement de pas important de la voie que nous faisons des choses. Ce test neuf de 46 gènes nous déménage à partir des méthodes conventionnelles pour l'ordonnancement des gènes uniques, et marque une opération énorme vers un séquençage du génome plus complet en infrastructure et en traitant les caractéristiques produites. »

M. Anna Schuh, qui dirige le centre de diagnostic moléculaire de BRC et est un hématologue de conseiller aux hôpitaux d'Université d'Oxford, ajoute : Les « patients aiment l'idée d'un test qui peut prévoir et dire d'avance s'ils réagiront à une demande de règlement autrement toxique. Ce que le patient voit n'est pas différent du présent. Une biopsie est prise de la tumeur du patient pour le dépistage génétique avec un conseiller parlant par les résultats quelques jours plus tard. Ce fait partie du procédé diagnostique normal. »

Le cancer est souvent décrit comme maladie génétique, puisque le passage qu'une cellule intervient en devenant cancéreuse tend à être piloté par des modifications à l'ADN des cellules. Et de plus en plus, les médicaments contre le cancer neufs dépendent de savoir si une mutation dans un gène unique est présente en cellules cancéreuses d'un patient.

Par exemple, un malade du cancer de poumon peut faire prendre une biopsie pour vérifier les changements du gène d'EGFR. S'il y a une mutation, le patient peut alors être soigné avec du médicament qui fonctionne comme inhibiteur d'EGFR. S'il n'y a aucune mutation, de tels médicaments ne fonctionneront pas et le patient obtiendrait un médicament différent qui serait plus efficace pour eux. Connaître la présence ou l'absence des mutations dans un certain gène peut choisir le circuit de demande de règlement pour ce patient.

Les NHS peuvent actuel déterminer des mutations en 2 ou 3 gènes - les gènes BRAF appelé, EGFR ou KRAS - utilisant une technologie de ordonnancement plus ancienne qui a été autour pendant des décennies. Des efforts sont effectués pour regarder augmenter le nombre de gènes de cancer ordonnancés à neuf en tant que norme.

Les scientifiques d'Oxford sont les premiers pour rendre de tels tests de multi-gène possibles dans les NHS utilisant le dernier ADN ordonnançant des techniques. Le service de NHS qu'ils ont lancé recherche des mutations en 46 gènes, et elles travaillent maintenant vers vérifier l'utilisation d'un test concernant 150 gènes.

Ayant des tests diagnostique ou une « Commission » qui peuvent examiner pour des mutations en familles multigéniques immédiatement seront importants pour l'accès à tous les médicaments contre le cancer neufs qui viennent le long.

« Il sera très difficile de manager dans les laboratoires diagnostiques de NHS sans Commissions de gène, » explique M. Schuh. « Actuel, les médicaments contre le cancer neufs tendent à obtenir reconnus à côté d'un détail de tests diagnostique à ce médicament qui peut déterminer quels patients bénéficieront. Mais en tant que médicaments de plus en plus aimez le ce venu le long, nous ne peut pas probablement exécuter tous les nombreux différents tests indépendants que ceci pourrait signifier. Nous avons besoin d'un test pour une gamme des médicaments. »

M. Taylor ajoute : « Nous avons voulu un test qui emploierait le dernier ADN ordonnançant des techniques pour trouver un large éventail de mutations en un large éventail de gènes. Un test qui pourrait couvrir plus de cancers et plus de demandes de règlement, tout pour un coût assimilé aux méthodes conventionnelles. »

Le test est exécuté sur un prochain rétablissement ordonnançant la plate-forme de Life Technologies Corporation, appelée la machine personnelle de génome d'ion (PGM (TM)). Le test et le logiciel d'accompagnement ont été considérablement modifiés comme en a été faite la demande par l'équipe d'Oxford pour répondre à des normes diagnostiques dans leur laboratoire.

Ce travail a été cofinancé par le conseil de stratégie technologique, l'agence de l'innovation du R-U, par une concession à NIHR Oxford BRC, Life Technologies Corporation, AstraZeneca, et recherche de Janssen et développement, LLC, une des sociétés pharmaceutiques de Janssen.

En tant qu'élément du développement de test, l'équipe d'Oxford a examiné pour améliorer la préparation de premier prélèvement dans le laboratoire, et pour fournir le support de logiciel et d'infrastructure pour traiter et analyser la quantité d'informations impliquée. Avant tout, le groupe d'Oxford a effectué des tests et les comparaisons pour vérifier la robustesse de la technique avec des biopsies de cancer dirigent des patients.

L'équipe comparée le test neuf de 46 gènes contre des techniques conventionnelles pour 80 biopsies consécutives de cancer dans le flux de travail du laboratoire d'hôpital.

L'ADN de la deuxième génération ordonnançant la méthode a trouvé toutes les mutations que la méthode conventionnelle a faites ; il a trouvé des mutations neuves que la méthode conventionnelle n'a pas faites ; et les mutations trouvées présentent au beaucoup des niveaux plus bas dans les échantillons. Le moment pris pour le test de 46 gènes également monté dans le temps de basculement normal pour des échantillons au laboratoire.

Il y a avantage bien d3terminé en examinant certains des 46 gènes compris dans le test ; il y a avantage clinique probable ou susceptible dans l'examen critique certains des autres ; les mutations en d'autres gènes pourraient être importantes dans quelques cancers mais pas d'autres ; et les autres gènes, nous ne savons pas jusqu'à présent. Mais ayant le ce les chercheurs de moyen d'information peuvent vérifier si une mutation a la signification biologique.

« Nous pouvons maintenir des caractéristiques, l'encaisser et la joindre avec des caractéristiques cliniques anonymes sur les patients » cancers pour la future recherche, 'explique M. Schuh.

Le test recherche des mutations dans des régions de « point névralgique » de chaque gène - endroits où les mutations sont pour se produire. Ceci signifie que le test peut manquer jusqu'à 5% de mutations, car ils peuvent se produire ailleurs, mais c'est toujours sensiblement meilleur que le régime de « faux négatif » suivre des méthodes actuelles.

Il peut également trouver des mutations actuelles dans seulement 5% des cellules tumorales présentes dans un échantillon. C'est beaucoup inférieur qu'est possible actuel, et est important en pouvant saisir l'information des cellules présentes dans seulement des petits nombres dans une tumeur, mais qui sont encore importants en pilotant l'accroissement de cancer.

Après avoir prouvé qu'il est possible d'introduire le test de 46 gènes en tant que service de NHS, les chercheurs déménagent maintenant en circuit pour vérifier le potentiel d'un test qui des gènes de la séquence 150. L'équipe emploiera le test d'abord de tous avec 500 échantillons existants provenant des patients participant aux tests cliniques de cancer pour pouvoir comparer les résultats rétrospectivement à l'information des essais. Ils emploieront alors le test avec 1000 biopsies neuves de cancer pour comprendre mieux comment l'information supplémentaire pourrait être employée dans des demandes de règlement de guidage pour des patients et leurs résultats.

M. Schuh dit : « « Tests de Commission les » ont le potentiel significatif tandis que nous attendons le coût d'ordonnancer les génomes patients entiers pour descendre. Même puis, les tests de Commission peuvent être avec nous pendant quelque temps. Après que le séquençage du génome entier entre dans l'utilisation, il se peut que des tests de Commission soient employés d'abord avec biopsies de patients des », avec seulement ceux dont le test de Commission ne donne aucun résultat faisant séquencer leur ADN entier pour rechercher des altérations génétiques plus rares. '

Seigneur Howe, ministre de santé, a dit : 'Nous voulons être parmi les meilleurs pays au monde à traiter le cancer et savoir que de meilleurs soins réglés pour des patients pourraient potentiellement sauver des durées.

La 'recherche de santé comme ceci est incroyablement importante et je suis avec plaisir nous pourrais supporter le travail des chercheurs à Oxford par l'institut national pour le centre de recherche biomédicale de recherches de santé.

« En traduisant rapidement des découvertes de la recherche en matière de génétique sur les avantages réels pour des patients, leur travail s'assurera que les patients obtiennent les bonnes demandes de règlement immédiatement, réduisent des effets secondaires potentiels et nous aident également à employer des fonds de NHS plus effectivement. »

La Commission de 46 gènes est basée sur la chimie d'AmpliSeq d'ion (TM) de Life Technologies Corporation. Le test exige très une petite quantité d'ADN (5 nanogrammes), un avantage en fonctionnant avec les échantillons cliniques qui sont type limités dans la quantité.

La machine personnelle de génome d'ion (PGM (TM) et ion AmpliSeq (TM) sont pour l'usage de recherches seulement, non destiné à l'utilisation dans les diagnostics. Les technologies de durée destine pour poursuivre la nomination de CE-IVD pour le PGM.