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Différentes molécules de hydroxymethylcytosine dans l'ADN trouvé par la méthode neuve concernant l'analyse de modification chimique et de nanopore

Change dans les bases qui composent l'ADN pour agir en tant que bornes, indiquant à une cellule quels gènes il devrait afficher et ce qu'il ne devrait pas. Dans le tourillon Angewandte Chemie, une équipe britannique a maintenant introduit une méthode neuve qui permet pour enrichir les segments rares de gène qui contiennent le hydroxymethylcytosine de base modifié et pour recenser différentes molécules de hydroxymethylcytosine dans l'ADN. De telles modifications sont associées aux maladies auto-immune et au cancer.

Les bases adénine, guanine, cytosine, et thymines composent code génétique. Chaque cellule du fuselage contient un ensemble identique de matériel génétique complet. Cependant, les tissus variés dans le fuselage sont très différents entre eux. C'est parce que les cellules ont la capacité de transcrire seulement un choix spécifique des gènes en protéines, laissant d'autres gènes inutilisés. Facteurs épigénétiques tels que des « bornes » sur le contrôle d'ADN ce procédé. La cytosine de base peut être équipée avec différents groupes latéraux, tels qu'un groupe méthylique ou hydroxyméthylique. La méthylation dense du gène de réglementation segmente des contacts hors des gènes correspondants. Pendant le développement de l'embryon, les configurations de méthylation commencent la différenciation cellulaire. Des changements des configurations de méthylation sont associés aux maladies auto-immune et au cancer. Les configurations de Hydroxymethylcytosine semblent également jouer un rôle dans la différenciation des cellules souche embryonnaires ainsi que dans l'expression du gène en cellules du système nerveux central.

En ordonnançant les techniques qui peuvent être employées pour trouver particulièrement les bases épigénétiques soyez ainsi très important. Jusqu'à présent, l'identification du hydroxymethylcytosine a exigé des procédés complexes, chers, ou sujets aux erreurs. Une équipe aboutie par Hagan Bayley à l'université de l'Université d'Oxford a maintenant développé une modification chimique qui tient compte de la différenciation du hydroxymethylcytosine et du methylcytosine par l'ordonnancement dans les nanopores.

Développé par Oxford Nanopore, une compagnie constituée par Hagan Bayley en 2005, la méthode de nanopore est une alternative hautement prometteuse à l'ordonnancement de différentes molécules d'ADN sans opération d'amplification. Fed par une enzyme, une monocaténaire d'ADN filète par un pore membrane-encastré de protéine. Selon lesquelles des bases sont dans la partie la plus étroite du pore à un moment donné, il y a un changement caractéristique du flux du courant par le pore.

Une réaction chimique entre le hydroxymethylcytosine, le bisulfite, et un peptide cystéine-contenant qui part de l'autre base-y compris methylcytosine-sans modification, améliore grand la définition pendant que les bases variées ont comme conséquence les différences dans le courant.

D'une manière primordiale, il est possible de fixer une borne fluorescente au site modifié, ou un « oeil » moléculaire qui peut être employé pour fixer les fragments d'ADN hydroxymethylcytosine-contenants rares aux « crochets » qui permettent aux éclats d'être enrichis au-dessus des éclats non modifiés, activant l'analyse de séquences rapide.