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Moléculas individuales del hydroxymethylcytosine en la DNA descubierta por el nuevo método que implica análisis químico de la modificación y del nanopore

Cambia en las bases que componen la DNA para actuar como marcadores, informando a una célula qué genes debe leer y cuáles no debe. En el gorrón Angewandte Chemie, las personas británicas ahora han introducido un nuevo método que permite enriquecer los segmentos raros del gen que contienen el hydroxymethylcytosine bajo modificado y determinar las moléculas individuales del hydroxymethylcytosine en la DNA. Tales modificaciones se asocian a enfermedades autoinmunes y a cáncer.

Las bases adenina, guanina, citosina, y thymine componen la clave genética. Cada célula de la carrocería contiene un equipo idéntico de material genético completo. Sin embargo, los diversos tejidos en la carrocería son muy diferentes de uno a. Esto es porque las células tienen la capacidad de transcribir solamente una selección específica de genes en las proteínas, dejando otros genes inusitados. Factores epigenéticos tales como “marcadores” en el mando de la DNA este proceso. La citosina baja se puede equipar de diversos grupos laterales, tales como un grupo metílico o hidroximetílico. La metilación densa del gen regulador divide los interruptores en segmentos de los genes correspondientes. Durante el revelado del embrión, las configuraciones de la metilación inician la diferenciación de célula. Los cambios en las configuraciones de la metilación se asocian a enfermedades autoinmunes y a cáncer. Las configuraciones de Hydroxymethylcytosine también parecen desempeñar un papel en la diferenciación de células madres embrionarias así como en la expresión génica en células del sistema nervioso central.

Ordenando las técnicas que se pueden utilizar para descubrir específicamente bases epigenéticas sea así muy importante. Hasta la fecha, la identificación del hydroxymethylcytosine ha requerido procesos complejos, costosos, o falibles. Las personas llevadas por Hagan Bayley en la universidad de la Universidad de Oxford ahora han desarrollado una modificación química que permite la diferenciación del hydroxymethylcytosine y del methylcytosine con la secuencia en nanopores.

Convertido por Oxford Nanopore, una compañía formada por Hagan Bayley en 2005, el método del nanopore es una opción altamente prometedora a la secuencia de las moléculas individuales de la DNA sin un paso de la amplificación. FED por una enzima, un único cabo de la DNA filetea a través de un poro membrana-embutido de la proteína. Dependiendo de cuáles de las bases están en la parte más estrecha del poro en un momento dado, hay un cambio característico en el flujo de la corriente a través del poro.

Una reacción química entre el hydroxymethylcytosine, el bisulfito, y un péptido cisteína-que contiene que salga del otro base-incluyendo methylcytosine-sin cambios, perfecciona grandemente la resolución mientras que las diversas bases dan lugar a diferencias en corriente.

Importantemente, es posible sujetar un marcador fluorescente al sitio modificado, o un “aro molecular” que se pueda utilizar para sujetar los fragmentos raros de la DNA hydroxymethylcytosine-que contienen a los “ganchos de leva” que permiten que los fragmentos sean enriquecidos sobre fragmentos sin modificar, habilitando análisis rápido de la serie.