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L'approche neuve a pu démocratiser le contrôle viral, dit le scientifique d'UCSF

Le virus transmis par les tiques de Lone Star a été d'une manière concluante recensé en tant qu'élément d'une famille d'autres bunyaviruses appelés de virus transmis par les tiques, qui entraînent souvent la fièvre, les difficultés respiratoires et la purge, selon la recherche neuve aboutie par des scientifiques chez Uc San Francisco (UCSF).

Ce qui a effectué le travail promettant particulièrement, a indiqué l'investigateur principal Charles Chiu, DM, PhD, était la vitesse à laquelle le virus a été définitivement recensé. L'équipe a employé une approche neuve au gène ordonnançant qu'activé leur pour reconstruire complet le génome précédemment inconnu des virus en moins de 24 heures - sensiblement plus rapidement les techniques de ordonnancement que conventionnelles, qui peuvent prendre des jours aux semaines.

La technique, ordonnancement profond ultra-rapide appelé, combine profondément l'ordonnancement - une technologie émergente qui reconstruit une séquence d'ADN entière d'un extrait minuscule d'ADN - avec des techniques de calcul avancées et les algorithmes développés dans les laboratoires de Chiu et de ses collaborateurs de recherches.

Chiu, un professeur adjoint de médicament de laboratoire à UCSF et le directeur de la diagnose et de la découverte virales d'UCSF-Abbott centrent, rapporté les résultats dans un papier publié dans PLOS UN le 29 avril. Il peut trouver en ligne chez http://www.plosone.org/.

L'équipe a constaté que le virus de Lone Star, qui est transporté par le tiret de Lone Star, americanum d'Amblyomma, est liée à un groupe de virus humains comprenant la fièvre sévère avec le virus de syndrome de thrombopénie, qui des centaines infectées d'agriculteurs en Chine entre 2008 et 2010 ; Le virus de Bhanja, a au commencement trouvé en Inde ; Le virus de Palma, a trouvé au Portugal ; et virus de centre, une maladie récent rapportée parmi des agriculteurs au Missouri.

« Nous n'avons pas montré que le virus de Lone Star entraîne la maladie chez l'homme, » Chiu avons averti, « bien que le laboratoire et les caractéristiques d'ordonnancement proposent que ce soit une possibilité distincte. »

Il a dit que le travail peut s'avérer significatif à la lumière du fait que presque toutes les maladies apparaissantes découvertes pendant les dernières deux décennies ont provenu des animaux. Tandis que les causes de beaucoup de maladies infectieuses humaines « ont été assez bien caractérisées, » il a dit, des chercheurs ont « a seulement touché le sommet de l'iceberg » en ce qui concerne les agents pathogènes qui ont le potentiel de réussir des animaux aux êtres humains.

Chiu a indiqué un certain nombre de transmissions de la maladie animal-à-humaines sérieuses et inattendues au cours des 10 dernières années, y compris le radar à ouverture synthétique en 2003, la grippe H1N1 en 2009, et la manifestation actuelle de la grippe aviaire H7N9, qui a déjà eu comme conséquence les plus de 20 morts en Chine.

La « nature nous projette soutenu des curveballs, » Chiu a dit. « Nous vraisemblablement serons toujours confrontés au danger des virus nouveaux de manifestation provenant des animaux ou des insectes. Il sera extrêmement important de recenser et caractériser ces virus aussi rapidement que possible - pour obtenir un avantagé sur le développement des analyses diagnostiques pour le contrôle et les médicaments, ou les vaccins pour la demande de règlement - avant qu'ils aient une occasion d'écarter réellement. »

Dans de telles circonstances, l'ordonnancement profond ultra-rapide sera « extrêmement utile, » il a dit. « Avant que le radar à ouverture synthétique a été recensé et ordonnancé suivre des méthodes conventionnelles, davantage qu'une semaine de temps avait été détruit. Ce genre de délai pourrait être tout à fait risqué dans un virus qui s'étend rapidement dans les populations humaines. »

Chiu et son équipe planification pour introduire une interface utilisateur graphique qui permettra à de petits laboratoires d'analyser et atteindre ultra-rapide, profond-ordonnançant des caractéristiques par le nuage calculant au-dessus de l'Internet, quoiqu'ils n'aient pas accès aux ordinateurs avancés.

« Ceci signifiera que n'importe quel laboratoire distant en Asie ou en Afrique - où beaucoup de ces manifestations récentes se sont produites - pourra utiliser un compteur séquentiel portatif et inducteur-disponible de benchtop accroché jusqu'à un smartphone ou l'ordinateur portable avec une connexion Internet, pour obtenir une séquence génétique complète d'un agent pathogène nouvel dans des heures, » a dit Chiu. « Notre espoir est que ces efforts démocratiseront le contrôle et l'enquête sur les maladies infectieuses. »