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La nueva aproximación podía democratizar vigilancia viral, dice al científico de UCSF

El virus señal-soportado de Lone Star se ha determinado concluyente como parte de una familia de otros virus señal-soportados llamados los bunyaviruses, que causan a menudo fiebre, problemas respiratorios y la extracción de aire, según la nueva investigación llevada por los científicos en Uc San Francisco (UCSF).

Qué hizo el trabajo que prometía especialmente, dijo al investigador principal Charles Chiu, Doctor en Medicina, doctorado, era la velocidad a la cual el virus fue determinado definitivo. Las personas utilizaron una nueva aproximación al gen que ordenaba que habilitado les para reconstruir totalmente el genoma previamente desconocido de los virus en menos de 24 horas - importante más rápidamente las técnicas de secuencia que convencionales, que pueden llevar días las semanas.

La técnica, llamada secuencia profunda ultrarrápida, combina profundamente la secuencia - una tecnología emergente que reconstruye una serie entera de la DNA de un recorte minúsculo de la DNA - con técnicas avanzadas y algoritmos de cómputo desarrollados en los laboratorios de Chiu y de sus colaboradores de la investigación.

Chiu, un profesor adjunto del remedio del laboratorio en UCSF y el director de los diagnósticos y del descubrimiento virales de UCSF-Abbott centran, denunciado los resultados en un papel publicado en PLOS UNO el 29 de abril. Puede ser encontrado en línea en http://www.plosone.org/.

Las personas encontraron que el virus de Lone Star, que es llevado por la señal de Lone Star, americanum de Amblyomma, se relacionan con un grupo de patógeno humanos incluyendo fiebre severa con el virus del síndrome de la trombocitopenia, que infectó a centenares de granjeros en China entre 2008 y 2010; El virus de Bhanja, encontró inicialmente en la India; El virus de Palma, encontró en Portugal; y el virus del centro, una enfermedad denunció recientemente entre granjeros en Missouri.

“No mostramos que el virus de Lone Star causa enfermedad en seres humanos,” a Chiu advertimos, “aunque el laboratorio y los datos de la secuencia sugieran que esto es una posibilidad distinta.”

Él dijo que el trabajo puede demostrar ser importante a la luz del hecho que casi todas las enfermedades emergentes descubiertas durante las últimas dos décadas han originado en animales. Mientras que las causas de muchas enfermedades infecciosas humanas “se han caracterizado bastante bien,” él dijo, los investigadores tiene “tocó solamente la punta del iceberg” en cuanto a los patógeno que tienen el potencial de pasar de animales a los seres humanos.

Chiu apuntó a varias transmisiones animal-a-humanas serias e inesperadas de la enfermedad durante los 10 años pasados, incluyendo el SARS en 2003, la gripe H1N1 en 2009, y el brote actual de gripe aviar H7N9, que ha dado lugar ya a más de 20 muertes en China.

La “naturaleza nos está lanzando continuamente los curveballs,” Chiu dijo. “Nos harán frente probablemente siempre con la amenaza de los virus nuevos del brote que originan en animales o insectos. Será extremadamente importante determinar y caracterizar esos virus lo más rápidamente posible - conseguir una ventaja en el revelado de los análisis diagnósticos para la vigilancia y las drogas, o las vacunas para el tratamiento - antes de que tengan una ocasión de extenderse realmente.”

En tales condiciones económicas, la secuencia profunda ultrarrápida será “extremadamente útil,” él dijo. “Para el momento en que el SARS fue determinado y ordenado usando métodos convencionales, más que una semana del tiempo había sido perdido. Esa clase de retraso podría ser muy aventurada en un virus que se extiende rápidamente en poblaciones humanas.”

Chiu y sus personas proyectan introducir una interfaz gráfica de usuario que permita que los pequeños laboratorios analicen y lleguen hasta ultrarrápido, profundo-ordenando datos a través de la nube que calcula sobre el Internet, aunque no tienen acceso a las computadores avanzadas.

“Esto significará que cualquier laboratorio alejado en Asia o África - donde han ocurrido muchos estos brotes recientes - podrá utilizar un secuenciador portátil, campo-listo del benchtop enganchado hasta un smartphone o la computadora portátil con una conexión a internet, para obtener una serie genética completa de un patógeno nuevo dentro de horas,” dijo a Chiu. “Nuestra esperanza es que estos esfuerzos democratizarán la vigilancia y la investigación de enfermedades infecciosas.”