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Technique de Metagenomics employée pour récupérer des génomes de TB de la momie de personne de 215 ans

Les chercheurs à l'université de Warwick ont récupéré des génomes (TB) de tuberculose du tissu de poumon d'une momie de personne de 215 ans employant une technique connue sous le nom de metagenomics.

L'équipe, aboutie par professeur Mark Pallen, professeur de génomique microbienne à la Faculté de Médecine de Warwick, travaillant avec Hélène Donoghue au centre d'enseignement supérieur Londres et collaboratrices à Birmingham et à Budapest, a recherché à employer la technique pour recenser TB ADN dans un spécimen historique.

Le terme « metagenomics » est employé pour décrire l'ordonnancement ouvert de l'ADN des échantillons sans besoin de culture ou amplification ou enrichissement d'objectif-détail. Cette approche évite les flux de travail complexes et peu fiables liés à la culture des bactéries ou à l'amplification de l'ADN et entraîne sur le débit remarquable et la simplicité d'utilisation de l'ordonnancement moderne s'approche.

L'échantillon est venu d'une femme hongroise, Terézia Hausmann, qui est mort 28 âgés le 25 décembre 1797. Elle a momifié des restes ont été récupérées d'une crypte dans la ville de Vác, Hongrie. Quand la crypte a été ouverte en 1994, on l'a avéré contenir les fuselages naturellement momifiés de 242 personnes. Les analyses moléculaires de l'échantillon de poitrine dans une étude précédente ont confirmé le diagnostic de la tuberculose et ont laissé entendre que TB ADN était extrêmement bonne préservée dans son fuselage.

Professeur Pallen a expliqué l'importance de la découverte, « la plupart des autres tentatives de récupérer des séquences d'ADN d'historique ou les échantillons antiques ont souffert du risque de contamination, parce qu'ils se fondent sur l'amplification de l'ADN dans le laboratoire, plus eux ont exigé l'optimisation onéreuse des analyses d'objectif-détail. La beauté du metagenomics est qu'elle fournit un simple mais l'approche hautement instructive, supposition supposition, taille unique qui fonctionne dans une grande variété de contextes. Il y a quelques mois nous avons prouvé que le metagenomics nous a permis de recenser des tensions d'une manifestation d'Escherichia coli des échantillons fécaux et il y a quelques semaines une approche assimilée a été montrée par un autre groupe pour fournir un génome de lèpre de matériau historique ».

La recherche, cette semaine publiée dans New England Journal de médicament, prouvé que Terézia Hausmann a souffert d'une infection mélangée avec deux tensions différentes de la bactérie de TB. Cette information, combinée avec le travail sur la tuberculose contemporaine, met en valeur la signification des infections à variétés mélangées, en particulier quand la tuberculose est hautement répandue.

Professeur Pallen ajouté, « elle était fascinante pour voir les similitudes entre les séquences de génome de TB que nous avons récupérées et le génome d'une tension récente de manifestation en Allemagne. Elle montre qu'une fois de plus c'utilisant le metagenomics peut être remarquablement efficace en suivant l'évolution et l'écart des microbes sans besoin de culture-dans ce cas, metagenomes a indiqué que quelques lignées de tension avaient diffusé en Europe pendant plus de deux siècles. »

Source:

University of Warwick