Attenzione: questa pagina è una traduzione automatica di questa pagina originariamente in lingua inglese. Si prega di notare in quanto le traduzioni sono generate da macchine, non tutte le traduzioni saranno perfetti. Questo sito web e le sue pagine web sono destinati ad essere letto in inglese. Ogni traduzione del sito e le sue pagine web possono essere imprecise e inesatte, in tutto o in parte. Questa traduzione è fornita per comodità.

Tecnica di Metagenomics usata per recuperare i genoma di TB dalla mummia di 215 anni

I ricercatori all'università di Warwick hanno recuperato i genoma (TB) della tubercolosi dal tessuto polmonare di una mummia di 215 anni che usando una tecnica conosciuta come il metagenomics.

Il gruppo, piombo dal professor Mark Pallen, professore di genomica microbica alla facoltà di medicina di Warwick, lavorante con Helen Donoghue all'University College di Londra e collaboratori a Birmingham e Budapest, ha cercato di usare la tecnica per identificare il DNA di TB in un esemplare storico.

Il termine “metagenomics„ è usato per descrivere l'ordinamento espandibile del DNA dai campioni senza l'esigenza di cultura o amplificazione obiettivo-specifica o arricchimento. Questo approccio evita i flussi di lavoro complessi ed inaffidabili connessi con cultura dei batteri o l'amplificazione di DNA e attinge la capacità di lavorazione e la facilità d'uso notevoli degli approcci d'ordinamento moderni.

Il campione è venuto da una donna ungherese, Terézia Hausmann, che è morto il 25 dicembre 1797 28 invecchiati. Lei ha mummificato il resti è stata recuperata da una cripta nella città di Vác, Ungheria. Quando la cripta è stata aperta nel 1994, è stato trovato per contenere gli organismi naturalmente mummificati di 242 persone. Le analisi molecolari del campione del torace in uno studio precedente hanno confermato la diagnosi della tubercolosi ed hanno suggerito che il DNA di TB era estremamente ben conservato nel suo organismo.

Il professor Pallen ha spiegato l'importanza dell'innovazione, “la maggior parte degli altri tentativi di recuperare le sequenze del DNA da storico o i campioni antichi hanno sofferto dal rischio di contaminazione, perché contano sull'amplificazione di DNA in laboratorio, più loro hanno richiesto l'ottimizzazione onerosa delle analisi obiettivo-specifiche. La bellezza del metagenomics è che fornisce un semplice ma approccio altamente informativo, senza presupposto, unitaglia che funziona in un'ampia varietà di contesti. Alcuni mesi fa abbiamo indicato che il metagenomics ha permesso che noi identificassimo gli sforzi di uno scoppio di Escherichia coli dai campioni fecali ed alcune settimane fa un simile approccio fosse indicato da un altro gruppo per consegnare un genoma della lebbra da materiale storico„.

La ricerca, pubblicata questa settimana in New England Journal di medicina, indicato che Terézia Hausmann ha sofferto da un'infezione mista con due sforzi differenti del batterio di TB. Questi informazioni, riunite con lavoro sulla tubercolosi contemporanea, evidenziano il significato delle infezioni a varietà miste, specialmente quando la tubercolosi è altamente prevalente.

Il professor Pallen aggiunto, “erano affascinanti vedere le similarità fra le sequenze che del genoma di TB abbiamo recuperato ed il genoma di uno sforzo recente di scoppio in Germania. Mostra che una volta di più quella facendo uso del metagenomics può essere notevolmente efficace nel tenere la carreggiata l'evoluzione e la diffusione dei microbi senza l'esigenza cultura-in questo caso, metagenomes ha rivelato che alcuni stirpi di sforzo stanno circolando in Europa per più di due secoli.„

Source:

University of Warwick