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Técnica de Metagenomics usada para recuperar genomas da TB da mamã das pessoas de 215 anos

Os pesquisadores na universidade de Warwick recuperaram genomas (TB) da tuberculose do tecido de pulmão de uma mamã das pessoas de 215 anos que usa uma técnica conhecida como o metagenomics.

A equipe, conduzida pelo professor Marcação Pallen, professor da genómica microbiana na Faculdade de Medicina de Warwick, trabalhando com Helen Donoghue no University College Londres e nos colaboradores em Birmingham e em Budapest, procurou usar a técnica para identificar o ADN da TB em um espécime histórico.

O termo “metagenomics” é usado para descrever arranjar em seqüência em aberto do ADN das amostras sem a necessidade para a cultura ou amplificação ou enriquecimento alvo-específico. Esta aproximação evita os trabalhos complexos e incertos associados com a cultura das bactérias ou a amplificação do ADN e desenha-os na produção notável e a acessibilidade de arranjar em seqüência moderno aproxima-se.

A amostra veio de uma mulher húngara, Terézia Hausmann, que morreu 28 envelhecidos o 25 de dezembro de 1797. Mumificou sobras foi recuperada de uma cripta na cidade de Vác, Hungria. Quando a cripta foi aberta em 1994, encontrou-se para conter os corpos naturalmente mumificados de 242 povos. As análises moleculars da amostra da caixa em um estudo precedente confirmaram o diagnóstico da tuberculose e sugeriram que o ADN da TB era extremamente bem preservado em seu corpo.

O professor Pallen explicou a importância da descoberta, “a maioria outras de tentativas de recuperar seqüências do ADN de histórico ou as amostras antigas sofreram do risco de contaminação, porque confiam na amplificação do ADN no laboratório, mais elas exigiram a optimização ingrato de ensaios alvo-específicos. A beleza do metagenomics é que fornece um simples mas altamente informativo, suposição-livre, um-tamanho-ajuste-toda aproximação que trabalha em uma grande variedade de contextos. Há alguns meses atrás nós mostramos que o metagenomics permitiu que nós identificassem tensões de uma manifestação de Escherichia Coli das amostras fecais e uma aproximação similar estêve mostrada há algumas semanas atrás por um outro grupo para entregar um genoma da lepra do material histórico”.

A pesquisa, publicada esta semana em New England Journal da medicina, mostrado que Terézia Hausmann sofreu de uma infecção misturada com duas tensões diferentes da bactéria da TB. Esta informação, combinada com o trabalho na tuberculose contemporânea, destaca o significado de infecções da misturado-tensão, particularmente quando a tuberculose é altamente predominante.

Professor Pallen adicionado, “era fascinante ver as similaridades entre as seqüências que do genoma da TB nós recuperamos e o genoma de uma tensão recente da manifestação em Alemanha. Mostra que uma vez mais aquela que usa o metagenomics pode ser notàvel eficaz em seguir a evolução e a propagação dos micróbios sem a necessidade para cultura-neste caso, metagenomes revelou que algumas linhagens da tensão têm circulado em Europa por mais de dois séculos.”

Source:

University of Warwick