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Técnica de Metagenomics usada para recuperar los genomas de la TB de momia de 215 años

Los investigadores en la universidad de Warwick han recuperado los genomas (TB) de la tuberculosis del tejido pulmonar de una momia de 215 años que usaba una técnica conocida como metagenomics.

Las personas, llevadas por profesor Mark Pallen, profesor de la genómica microbiana en la Facultad de Medicina de Warwick, trabajando con Helen Donoghue en la Universidad Londres y los colaboradores en Birmingham y Budapest, intentaron utilizar la técnica para determinar la DNA de la TB en un espécimen histórico.

El término “metagenomics” se utiliza para describir la secuencia indefinido de la DNA de muestras sin la necesidad de la cultura o amplificación o enriquecimiento objetivo-específica. Esta aproximación evita los flujos de trabajo complejos y no fiables asociados a la cultura de bacterias o a la amplificación de la DNA y drena en la producción notable y la facilidad de empleo de la secuencia moderna se acerca.

La muestra vino de una mujer húngara, Terézia Hausmann, que murió 28 envejecidos el 25 de diciembre de 1797. Ella momificó los restos fue recuperada de una cripta en la ciudad de Vác, Hungría. Cuando la cripta fue abierta en 1994, fue encontrado para contener a las carrocerías naturalmente momificadas de 242 personas. Los análisis moleculares de la muestra del pecho en un estudio anterior confirmaron la diagnosis de la tuberculosis e hicieron alusión que la DNA de la TB estaba extremadamente bien preservada en su carrocería.

Profesor Pallen explicó la importancia de la ruptura, “la mayoría de las otras tentativas de recuperar series de la DNA de histórico o las muestras antiguas han sufrido del riesgo de contaminación, porque confían en la amplificación de la DNA en el laboratorio, más ellas han requerido la optimización onerosa de análisis objetivo-específicos. La belleza del metagenomics es que ofrece un simple solamente la aproximación altamente informativa, suposición-libre, única que trabaja en una amplia variedad de contextos. Hace unos meses mostramos que el metagenomics permitió que determináramos deformaciones de un brote de Escherichia Coli de muestras fecales y hace unas semanas una aproximación similar fue mostrada por otro grupo para entregar un genoma de la lepra del material histórico”.

La investigación, publicada esta semana en New England Journal del remedio, mostrado que Terézia Hausmann sufrió de una infección mezclada con dos diversas deformaciones de la bacteria de la TB. Esta información, combinada con el trabajo sobre tuberculosis contemporánea, destaca la significación de infecciones de variedades mezcladas, determinado cuando la tuberculosis es altamente frecuente.

Profesor Pallen adicional, “era fascinadora ver las semejanzas entre las series del genoma de la TB que nos recuperamos y el genoma de una deformación reciente del brote en Alemania. Muestra que una vez más eso usando metagenomics puede ser notable efectiva en la búsqueda de la evolución y la extensión de microbios sin la necesidad cultura-en de este caso, metagenomes reveló que algunos linajes de la deformación han estado circulando en Europa por más de dos siglos.”

Source:

University of Warwick