Consommation diététique Habituelle de jumeaux monozygotes associés avec la composition fécale en microbiota

L'établissement des populations microbiennes dans (GI) le tractus gastro-intestinal est un procédé complexe, concerner microbien et des interactions d'hôte éventuellement ayant pour résultat une population dense et stable. Récent, l'identification de la substance microbienne des échantillons fécaux est devenue plus précise avec l'utilisation des méthodes gène-basées de l'ARN 16S. Cependant, bien que ces méthodes de dépistage moléculaire-basées aient les avantages apparents au-dessus des techniques culture-basées, elles concernent les pièges potentiels qui devraient être pris en compte en étudiant le microbiota fécal, tel que les conditions de stockage et l'acide désoxyribonucléique (ADN) - extraction. Par Conséquent, les effets de différentes conditions de stockage et des protocoles d'ADN-extraction relatif aux échantillons fécaux ont été évalués dans cette étude. Considérant Que le protocole d'ADN-extraction n'a pas affecté les nombres d'Espèces de Bacteroide, l'abondance de ce groupe a affiché une diminution significative après une mémoire de la semaine à -20°C. En Outre, les numéros groupe du groupe prédominant de bactéries, de rectale d'Eubacterium, de Clostridium de leptum, bifidobacteria et groupe d'Atopobium, étaient sensiblement plus élevés dans les échantillons enregistrés à -70°C après qu'ADN-extraction mécanique qu'après ADN-extraction enzymatique comme trouvés avec l'ACP de temps réel (qPCR). Ces résultats indiquent que le lysis mécanique rigoureux mène au dépistage des numéros bactériens plus élevés à partir des échantillons fécaux humains que l'ADN-extraction enzymatique. Par Conséquent, l'utilisation de différents protocoles d'ADN-extraction peut en partie expliquer des résultats contradictoires enregistrés dans des études précédentes.

La composition du microbiota intestinal humain est influencée par des facteurs hôte-particuliers tels que l'âge, la génétique et les conditions matérielles et chimiques produits dans la GI-région. D'autre part, elle est modulée par des facteurs environnementaux avec l'incidence sur l'hôte pendant la durée de vie, telle que le régime. L'incidence du régime sur le microbiota d'intestin a été habituellement évaluée en soumettant des gens au même régime réglé, et ensuite après les variations dans le microbiota. Dans la présente étude, la consommation diététique habituelle de jumeaux monozygotes était associée avec la composition fécale en microbiota, qui s'est analysée utilisant l'Électrophorèse en Gel de Gradient de qPCR et de Dénaturant (DGGE). L'effet du régime sur les nombres de bactéries a été décrit utilisant un modèle mélangé linéaire hiérarchique qui a compris les personnes jumelles, stratifiées par l'indice de masse corporelle, et leurs familles en tant qu'effets irréguliers. L'abondance et la diversité des groupes bactériens étudiés n'ont pas différé entre le grammage normal, le poids excessif, et les personnes obèses avec les techniques utilisées. Cependant, les admissions de l'énergie, de la graisse monoinsaturée, (n-3) de la graisse polyinsaturée, (n-6) de la graisse polyinsaturée et fibre soluble ont eu des associations significatives avec les numéros bactériens fécaux. De plus, les Co-jumeaux avec les consommations d'énergie identiques ont eu des numéros et des diversités plus assimilés de DGGE-profil des Espèces de Bacteroide que des Co-jumeaux avec différentes admissions. D'ailleurs, les Co-jumeaux qui ont ingéré les mêmes montants de graisse saturée ont eu les DGGE-profils très assimilés des Espèces de Bacteroide, attendu que les Co-jumeaux avec la consommation assimilée de la fibre ont eu la similitude bifidobacterial très faible de DGGE-profil.

Ensuite, l'incidence de la consommation d'énergie sur le microbiota fécal d'un groupe de 16 personnes obèses a été évaluée pendant une intervention de 12 mois, qui s'est composée d'un régime d'énergie très faible de 6 semaines (VLED) et ensuite d'une période complémentaire de 5, 8 et 12 mois. Le régime de régime a été combiné avec la consultation d'exercice et de mode de vie. Des échantillons Fécaux se sont analysés utilisant le qPCR, le DGGE et l'hybridation in situ fluorescente. L'effet du régime restreint d'énergie sur les numéros bactériens fécaux a été décrit utilisant un modèle mélangé linéaire qui a représenté des mesures répétées dans la même personne. La période de VLED a affecté les groupes microbiens fécaux principaux ; en particulier le bifidobacteria a diminué comparé aux numéros de spécification de base. En Outre, le changement des numéros des groupes bactériens fécaux étudiés, excepté des Espèces de Bacteroide, a suivi la consommation d'énergie et pas le grammage change pendant les 12 mois. Methanogens ont été trouvés dans 56% des participants à chaque remarque de temps d'échantillonnage, indépendamment du changement de l'admission énergétique. De plus, les relations entre les groupes et la perte de poids microbiens fécaux principaux, le changement de la masse grasse, et le changement de la masse pauvre ont été également évalués. La Perte de poids était associée avec une diminution des bactéries de groupe de Lactobacille, attendu que la perte de masse pauvre était associée avec des diminutions des bactéries de bifidobacteria et de groupe de Lactobacille. Ces découvertes confirment que le régime et l'admission énergétique jouent un rôle majeur dans la modulation du microbiota fécal.

En Conclusion, le potentiel d'employer l'information aux niveaux d'expression des gènes sélectés de stress en évaluant la qualité des produits probiotic a été évalué. À cet effet, des méthodes (RT) inverses de transcription-qPCR ont été développées pour étudier l'expression des gènes du stress clpL1 et clpL2 en cellules du rhamnosus VTT E-97800 de Lactobacille après exposition aux états liés traiter de stress ou à la lyophilisation. Des Traitements Thermiques ont été exécutés avec le rhamnosus VTT E-97800 de L. dans l'échelle de laboratoire, attendu que des traitements de l'acide ont été exécutés dans l'échelle de laboratoire et de fermenteur. L'ARN a été extrait des cellules fraîches et des poudres lyophilisées. les transcriptions clpL1 et clpL2 se sont analysées par Droite-qPCR utilisant le Vert I. clpL1 de SYBR étaient induites en cellules du rhamnosus VTT E-97800 de L. exposées à 50°C et jusqu'à beaucoup de peu de degré en cellules a exposé à 47°C. Aucune induction n'a été observée pour clpL2 pendant ou l'acide ou le traitement thermique en conditions l'unes des s'est appliqué. L'isolement d'ARN dans les poudres lyophilisées était infructueux, bien que plusieurs tentatives aient été effectuées avec des produits de haute qualité. Ces résultats suggèrent que cela les indicateurs se développants de qualité des produits probiotic basés sur des différences dans l'expression des gènes de stress soient une tâche provocante, puisque les conditions plutôt brutales sont apparemment nécessaires pour trouver des différences dans l'expression du gène. De plus, l'isolement infructueux d'ARN dans les poudres lyophilisées entrave les possibilités d'application de cette technique dans le contrôle qualité des produits probiotic.

Source : http://www.vtt.fi