L'ingestione dietetica Abituale dei gemelli monozygotic si è associata con la composizione fecale in microbiota

L'istituzione delle popolazioni microbiche (GI) nel gastrointestinale-tratto è finalmente un trattamento complesso, comprendere microbica ed interazioni ospite con conseguente popolazione densa e stabile. Recentemente, l'identificazione delle specie microbiche dai campioni fecali è diventato più accurata con l'uso ai dei metodi basati a gene del RNA 16S. Tuttavia, sebbene questi a metodi di rilevazione basati a molecolare abbiano vantaggi evidenti sopra alle le tecniche basate a cultura, comprendono i trabocchetti potenziali che dovrebbero essere presi in considerazione quando studia il microbiota fecale, quali le condizioni di stoccaggio e l'acido desossiribonucleico (DNA) - l'estrazione. Di Conseguenza, gli effetti delle condizioni di stoccaggio differenti ed i protocolli dell'DNA-estrazione relativo ai campioni fecali sono stati valutati in questo studio. Considerando Che il protocollo dell'DNA-estrazione non ha pregiudicato i numeri delle Speci del Batterioide, l'abbondanza di questo gruppo ha mostrato una diminuzione significativa dopo l'un'archiviazione della settimana a -20°C. Ancora, i numeri del gruppo predominante del rectale di Eubacterium, dei batteri, gruppo di leptum del Clostridio, bifidobacteria e gruppo di Atopobium, erano significativamente più alti in campioni memorizzati a -70°C dopo che l'DNA-estrazione meccanica che dopo l'DNA-estrazione enzimatica come individuati con la PCR (qPCR) in tempo reale. Questi risultati indicano che la lisi meccanica rigorosa piombo alla rilevazione di più alti numeri batterici dai campioni fecali umani che l'DNA-estrazione enzimatica. Di Conseguenza, l'uso dei protocolli differenti dell'DNA-estrazione può spiegare parzialmente i risultati contraddittori riferiti negli studi precedenti.

La composizione del microbiota intestinale umano è influenzata dai fattori host-specifici quali l'età, la genetica e le circostanze fisiche e chimiche incontrate nel Gi-tratto. D'altra parte, è modulata dai fattori ambientali con impatto sul host durante la durata della vita, quale la dieta. L'impatto della dieta sul microbiota dell'intestino è stato valutato solitamente sottoponendo la gente alla stessa dieta controllata e da allora in poi dopo le variazioni nel microbiota. Nello studio presente, l'ingestione dietetica abituale dei gemelli monozygotic è stata associata con la composizione fecale in microbiota, che è stata analizzata facendo uso di qPCR e del Denaturare l'Elettroforesi del Gel di Gradiente (DGGE). L'effetto della dieta sui numeri dei batteri è stato descritto facendo uso di un modello misto lineare gerarchico che ha incluso le persone gemellate, stratificato dall'indice di massa corporea e delle loro famiglie come effetti casuali. L'abbondanza e la diversità dei gruppi batterici studiati non hanno differito fra peso normale, il peso eccessivo e le persone obese con le tecniche usate. Tuttavia, le assunzioni di energia, di grasso monoinsaturo, (n-3) di grasso poli-insaturo, (n-6) di grasso poli-insaturo e fibra solubile hanno avute associazioni significative con i numeri batterici fecali. Inoltre, i co-gemelli con le assunzioni identiche di energia hanno avuti i numeri e diversità più simili di DGGE-profilo delle Speci del Batterioide che i co-gemelli con differenti assunzioni. Inoltre, i co-gemelli che hanno ingerito gli stessi importi di grasso saturato hanno avuti DGGE-profili molto simili delle Speci del Batterioide, mentre i co-gemelli con simile consumo di fibra hanno avuti similarità bifidobacterial molto bassa di DGGE-profilo.

Da Allora In Poi, l'impatto dell'assunzione di energia sul microbiota fecale di un gruppo di 16 persone obese è stato valutato durante l'intervento di 12 mesi, che ha consistito di una dieta di energia molto bassa di 6 settimane (VLED) e da allora in poi di un periodo di seguito di 5, 8 e 12 mesi. La pianificazione di dieta si è combinata con il consiglio di stile di vita e di esercizio. I campioni Fecali sono stati analizzati facendo uso di qPCR, di DGGE e dell'ibridazione in situ fluorescente. L'effetto della dieta limitata di energia sui numeri batterici fecali è stato descritto facendo uso di un modello misto lineare che ha rappresentato le misure ripetute nella stessa persona. Il periodo di VLED ha pregiudicato i gruppi microbici fecali principali; in particolare il bifidobacteria è diminuito confrontato ai numeri del riferimento. Ancora, il cambiamento nei numeri dei gruppi batterici fecali studiati, ad eccezione delle Speci del Batterioide, ha seguito l'assunzione di energia e non il peso cambia durante i 12 mesi. Methanogens è stato individuato in 56% dei partecipanti ad ogni punto di tempo di campionatura, indipendentemente dal cambiamento nell'assunzione energetica. Inoltre, le relazioni fra i gruppi e la perdita di peso microbici fecali principali, il cambiamento nella massa grassa ed il cambiamento nella massa magra egualmente sono stati valutati. La Perdita di peso è stata associata con una diminuzione nei batteri del gruppo del Lattobacillo, mentre la perdita di massa magra è stata associata con le diminuzioni sia nei batteri del gruppo del Lattobacillo che di bifidobacteria. Questi risultati confermano che la dieta e l'assunzione energetica svolgono un ruolo importante nella modulazione del microbiota fecale.

Per Concludere, il potenziale dell'utilizzazione delle informazioni ai livelli di espressione di geni selezionati di sforzo nella valutazione della qualità dei prodotti probiotici è stato valutato. A questo fine, i metodi (RT) inversi della trascrizione-qPCR sono stati messi a punto per studiare l'espressione dei geni di sforzo clpL1 e clpL2 in celle di rhamnosus VTT E-97800 del Lattobacillo dopo l'esposizione agli stati in relazione con il trattamento di sforzo o a liofilizzare. I Trattamenti Termici sono stati realizzati con il rhamnosus VTT E-97800 del L. nel disgaggio di laboratorio, mentre i trattamenti acidi sono stati eseguiti sia nel disgaggio del fermentatore che del laboratorio. Il RNA è stato estratto dalle celle fresche e dalle polveri liofilizzate. le trascrizioni clpL1 e clpL2 sono state analizzate dal RT-qPCR facendo uso di Verde I. clpL1 di SYBR sono state indotte in celle di rhamnosus VTT E-97800 del L. esposte a 50°C ed in molta poca misura in celle ha esposto a 47°C. Nessun'induzione è stata osservata per clpL2 durante o l'acido o il trattamento termico in c'è ne delle circostanze si è applicato. L'isolamento del RNA dalle polveri liofilizzate era infruttuoso, sebbene parecchi tentativi fossero fatti con i prodotti di qualità. Questi risultati indicano che quello gli indicatori di sviluppo di qualità per i prodotti probiotici basati sulle differenze nell'espressione dei geni di sforzo saranno un compito provocatorio, poiché le circostanze piuttosto dure sono apparentemente necessarie individuare le differenze nell'espressione genica. Inoltre, l'isolamento infruttuoso del RNA dalle polveri liofilizzate ostacola l'applicabilità di questa tecnica nel controllo di qualità dei prodotti probiotici.

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