A entrada dietética Habitual de gêmeos monozygotic associou com a composição fecal do microbiota

O estabelecimento de populações microbianas (GI) no gastrintestinal-intervalo é um processo complexo, envolvimento microbiano e interacções do anfitrião eventualmente tendo por resultado uma população densa e estável. Recentemente, a identificação da espécie microbiana das amostras fecais tornou-se mais exacta com o uso dos métodos 16S gene-baseados RNA. Contudo, embora estes métodos de detecção molecular-baseados tenham benefícios aparentes sobre técnicas cultura-baseadas, envolvem as armadilhas potenciais que devem ser tomadas na consideração ao estudar o microbiota fecal, tal como as condições de armazenamento e o ácido deoxyribonucleic (ADN) - extracção. Conseqüentemente, os efeitos de condições de armazenamento diferentes e os protocolos da ADN-extracção em amostras fecais foram avaliados neste estudo. Considerando Que o protocolo da ADN-extracção não afectou os números dos Bacteróides spp., a abundância deste grupo mostrou uma diminuição significativa após o um armazenamento da semana em -20°C. Além Disso, os números de grupo predominante das bactérias, do rectale de Eubacterium, de leptum do Clostridium grupo, bifidobacteria e grupo de Atopobium, eram significativamente mais altos nas amostras armazenadas em -70°C depois que ADN-extracção mecânica do que após a ADN-extracção enzimático como detectados com PCR do tempo real (qPCR). Estes resultados indicam que o lysis mecânico rigoroso conduz à detecção de uns números bacterianos mais altos das amostras fecais humanas do que a ADN-extracção enzimático. Conseqüentemente, o uso de protocolos diferentes da ADN-extracção pode em parte explicar os resultados contraditórios relatados em estudos precedentes.

A composição do microbiota intestinal humano é influenciada por factores anfitrião-específicos tais como a idade, as genéticas e as circunstâncias físicas e químicas encontradas no Soldado-intervalo. Por outro lado, é modulada por factores ambientais com impacto no anfitrião durante o tempo, tal como a dieta. O impacto da dieta no microbiota do intestino foi avaliado geralmente sujeitando povos à mesma dieta controlada, e depois disso depois das SHIFT no microbiota. No estudo actual, a entrada dietética habitual de gêmeos monozygotic foi associada com a composição fecal do microbiota, que foi analisada usando o qPCR e Desnaturando a Electroforese do Gel do Inclinação (DGGE). O efeito da dieta nos números das bactérias foi descrito usando um modelo misturado linear hierárquico que incluísse os indivíduos gêmeos, estratificado pelo índice de massa corporal, e suas famílias como efeitos aleatórios. A abundância e a diversidade dos grupos bacterianos estudados não diferiram entre o peso normal, o excesso de peso, e indivíduos obesos com as técnicas usadas. Contudo, as entradas da energia, da gordura monounsaturated, (n-3) da gordura poliinsaturado, (n-6) da gordura poliinsaturado e fibra solúvel tiveram associações significativas com os números bacterianos fecais. Além, os co-gêmeos com entradas idênticas da energia tiveram uns números e umas diversidades mais similares do DGGE-perfil dos Bacteróides spp. do que co-gêmeos com entradas diferentes. Além Disso, os co-gêmeos que ingeriram as mesmas quantidades de gordura saturada tiveram DGGE-perfis muito similares dos Bacteróides spp., visto que os co-gêmeos com consumo similar de fibra tiveram a similaridade bifidobacterial muito baixa do DGGE-perfil.

Depois Disso, o impacto da entrada da energia no microbiota fecal de um grupo de 16 indivíduos obesos foi avaliado durante uma intervenção de 12 meses, que consistisse em uma dieta de energia muito baixa de 6 semanas (VLED) e depois disso em um período da continuação de 5, 8 e 12 meses. O plano da dieta foi combinado com a assistência do exercício e do estilo de vida. As amostras Fecais foram analisadas usando o qPCR, o DGGE e a hibridação in situ fluorescente. O efeito da dieta restrita da energia nos números bacterianos fecais foi descrito usando um modelo misturado linear que esclarecesse medidas repetidas no mesmo indivíduo. O período de VLED afectou os grupos microbianos fecais principais; em particular o bifidobacteria diminuiu comparado aos números da linha de base. Além Disso, a mudança nos números dos grupos bacterianos fecais estudados, à excecpção do Bacteróide spp., seguiu a entrada da energia e não o peso muda durante os 12 meses. Methanogens foi detectado em 56% dos participantes em cada ponto do tempo da amostra, apesar da mudança na entrada energética. Além, os relacionamentos entre os grupos e a perda de peso microbianos fecais principais, a mudança na massa gorda, e a mudança na massa magra foram avaliados igualmente. A perda de Peso foi associada com uma diminuição nas bactérias do grupo do Lactobacilo, visto que a perda em massa magra foi associada com as diminuições nas bactérias do bifidobacteria e do grupo do Lactobacilo. Estes resultados confirmam que a dieta e a entrada energética jogam um papel importante na modulação do microbiota fecal.

Finalmente, o potencial de utilizar a informação em níveis da expressão de genes selecionados do esforço em avaliar a qualidade de produtos probióticos foi avaliado. Com esta finalidade, os métodos (RT) reversos da transcrição-qPCR foram desenvolvidos para estudar a expressão de genes do esforço clpL1 e clpL2 em pilhas do rhamnosus VTT E-97800 do Lactobacilo após a exposição às condições processar-relacionadas do esforço ou à liofilização. Os Tratamento Térmicos foram executados com o rhamnosus VTT E-97800 do L. na escala de laboratório, visto que os tratamentos ácidos foram executados na escala do laboratório e do fermentador. O RNA foi extraído das pilhas frescas e dos pós liofilizados. os transcritos clpL1 e clpL2 foram analisados pelo RT-qPCR usando SYBR que o I. Verde clpL1 foi induzido nas pilhas do rhamnosus VTT E-97800 do L. expor a 50°C e a muita pouca extensão nas pilhas exps a 47°C. Nenhuma indução foi observada para clpL2 durante ou o ácido ou o tratamento térmico em algumas das circunstâncias aplicou-se. O isolamento do RNA dos pós liofilizados era mal sucedido, embora diversas tentativas fossem feitas com produtos de alta qualidade. Estes resultados sugerem que isso os indicadores se tornando da qualidade para os produtos probióticos baseados em diferenças na expressão de genes do esforço sejam uma tarefa desafiante, desde que as circunstâncias um pouco ásperas são aparentemente necessários detectar diferenças na expressão genética. Além, o isolamento mal sucedido do RNA dos pós liofilizados impede da aplicabilidade desta técnica no controle da qualidade de produtos probióticos.

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