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La CÔTELETTE développe le seul essai en laboratoire pour caractériser les gènes qui codent des molécules de HLA

Les experts en matière d'immunogénétique à l'hôpital pour enfants de Philadelphie (CHOP) ont développé un seul essai en laboratoire pour caractériser les gènes qui codent des molécules de HLA. Le test compte en circuit plus rapidement, un gène plus complet ordonnançant la technologie pour taper les antigènes humains de leucocyte (HLAs)--protéines complexes et hautement variables sur les surfaces de cellules qui sont essentielles à la fonction immunitaire.

Le test neuf peut améliorer des résultats de greffe par une évaluation plus de raffinage de la compatibilité de distributeur, et accélérera le choix de distributeur des Bureaux d'ordre de moelle osseuse. Il fournit également un outil avancé pour la recherche dans les maladies immunologiques, les maladies infectieuses, et le domaine de pharmacogenomics-the qui étudie l'influence des variations génétiques sur l'efficacité et la toxicité de médicament.

« Ce test neuf traite un problème de soixante ans, » a dit Dimitri Monos, Ph.D., directeur du laboratoire d'immunogénétique dans la Division de la diagnose génomique à l'hôpital pour enfants de Philadelphie. « Depuis la découverte des HLA au début des années 50, c'a été un défi caractérisent à exactement et complètement des séquences du gène de HLA. Nous avons maintenant utilisé les outils de ordonnancement de la deuxième génération pour avancer de manière significative taper de HLA. »

La CÔTELETTE est le premier hôpital n'importe où pour offrir ce test HLA-tapant complet neuf, basé sur la recherche considérable par Monos et collègues. « C'est un neuf, technologie disruptive, avec le potentiel de transformer la recherche et la pratique clinique, dans la greffe et d'autres domaines, » a dit Robert Doms, M.D., Ph.D., pathologiste-dans-responsable à la CÔTELETTE.

Les gènes de HLA sont la famille de gènes la plus complexe connue dans le génome humain entier. Les séquences du gène pour des HLA sont extrêmement polymorphes--hautement variable, à un degré pas adéquat capté par les essais de type conventionnels. Les tests actuels fournissent souvent des résultats ambigus et limités, en ordonnançant seulement des segments des gènes de HLA et ne pas discerner parmi différents allèles proposés par une séquence donnée. De plus, le contrôle préliminaire souvent doit être suivi d'un deuxième niveau du contrôle réfléchi, ajoutant des frais et le temps au procédé tapant de HLA.

Le test neuf, indique Monos, remplace les tests préliminaires et réfléchis par un test unique, fournissant le possible le plus de haute résolution en couvrant la pleine région génomique de HLA. Il peut actuel discerner parmi 10.500 allèles différents de tous les types connus de HLA et peut entièrement caractériser les allèles neufs à découvrir encore. On s'attend à ce que l'ordonnancement de la deuxième génération augmente considérablement la liste d'allèles de HLA.

Monos et collègues ont développé un protocole neuf pour le génotypage de HLA utilisant un Illumina- ordonnançant la plate-forme, le MiSeq. Les scientifiques ont validé le test en comparant ses résultats contre des caractéristiques précédemment ordonnancées d'une collection de plus de 300 échantillons caractérisés à cinq gènes différents. La convention entre les deux méthodologies était de 100 pour cent.

La CÔTELETTE offrira l'essai de type de HLA pour le contrôle patient en tant que service à médical et aux centres de formation générale. Le test est plus rapide, des méthodes moins qu'existantes plus précises, et de coût d'essai.

Le choc à courte portée le plus significatif du test neuf peut être dans les donneurs tapants dans des Bureaux d'ordre de moelle osseuse/cellule souche. À cause du coût élevé d'exécuter la haute définition HLA tapant sous des méthodes actuelles, la plupart des donneurs potentiels sont tapés à inférieur ou à l'intermédiaire-définition, avec une répétition, test à haute résolution requis pour évaluer la compatibilité quand un patient a besoin d'une greffe. La méthode neuve épargnera le temps et frais en tapant au commencement des donneurs au niveau d'allèle. Par conséquent, taper pas complémentaire sera nécessaire pour évaluer la compatibilité.

« Cette technologie plus rapide et plus complète nous permet de représenter mieux des différences génétiques subtiles entre les personnes, » a dit Monos. « Nous nous attendons à ce que cette connaissance fournisse les avantages cliniques, en facilitant des correspondances plus précises entre les donneurs de greffe et les bénéficiaires, et en évaluant la signification des mésappariements dans les régions génomique des HLA qui étaient précédemment non caractérisés. Supplémentaire, en se concentrant sur les détails fins des réactions immunitaires, cette technologie peut avancer notre compréhension de la façon dont les personnes spécifiques répondent aux maladies infectieuses, aux vaccinations, et aux médicaments particuliers. Ce test représente potentiellement un puissant outil en médicament personnalisé. »