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Os Pesquisadores geram o modelo 3D do genoma humano do parasita de malária

Uma equipa de investigação conduzida por um biólogo de pilha no University Of California, Riverside gerou um modelo 3D do genoma humano do parasita de malária em três fases diferentes no ciclo de vida do parasita - a primeira vez que tal arquitetura 3D foi gerada durante a progressão do ciclo de vida de um parasita.

O parasita que causa a malária nos seres humanos é falciparum do Plasmodium. O mosquito fêmea dos Anófeles transmite o falciparum do P. de um ser humano contaminado aos indivíduos saudáveis, espalhando a malária no processo. De acordo com a Organização Mundial de Saúde, 207 milhões de pessoas calculado foram contaminados com malária em 2012, conduzindo a 627.000 mortes.

“Compreender a organização espacial dos cromossomas é essencial compreender o regulamento da expressão genética em toda a pilha eucariótica,” disse Karine Le Roch, um professor adjunto da biologia celular e da neurociência, que conduzisse o estudo.

Sua equipa de investigação igualmente encontrou que aqueles genes que precisam de ser expressados altamente no parasita de malária - por exemplo, os genes envolvidos na tradução - tendem a se aglomerar na mesma área do núcleo de pilha, quando os genes que precisam de ser reprimidos firmemente - por exemplo, os genes envolvidos na virulência - forem encontrados em outra parte na estrutura 3D da “em um centro repressão.” A estrutura 3D para o genoma do parasita de malária revelou um centro principal da repressão.

Os genes da Virulência no parasita de malária são uma grande família dos genes que são responsáveis para a sobrevivência do parasita dentro dos seres humanos. A equipe de Le Roch encontrou que estes genes, organizados toda em um centro da repressão em uma área distinta no núcleo, parecem conduzir a organização completa do genoma do parasita.

Os resultados do Estudo apareceram a semana passada em linha na Pesquisa do Genoma, um international, jornal par-revisto essa pesquisa original proeminente das características que fornece introspecções novas na biologia do genoma de todos os organismos. O artigo de investigação aparecerá na cópia na introdução de Junho do jornal.

“Nós traçamos com sucesso todas as interacções físicas entre elementos genéticos no núcleo do parasita,” Le Roch disse. “Para fazer Assim, nós usamos “um método da captação da conformação do cromossoma, “seguido pela produção alta que arranja em seqüência a tecnologia - uma metodologia recentemente desenvolvida para analisar a organização dos cromossomas no estado natural da pilha. Nós usamos então os mapas de todas as interacções físicas para gerar um modelo 3D do genoma para cada fase do ciclo de vida do parasita analisado.”

Para compreender a biologia de um organismo ou de qualquer tipo da pilha, os cientistas precisam de compreender não somente a informação codificada na seqüência do genoma mas também como a seqüência é comprimida e organizada fisicamente em cada pilha/tecido, e como as mudanças na arquitetura do genoma 3D podem jogar um papel crítico na expressão genética, na morfogênese do cromossoma e na estabilidade de regulamento do genoma. Em pilhas humanas, as mudanças na organização do cromossoma e a consolidação podem conduzir às doenças tais como o cancro.

“Se nós compreendemos como o genoma do parasita de malária está organizado no núcleo e que os componentes controlam esta organização, nós podemos poder interromper esta arquitetura e para interromper, também, a revelação do parasita,” Le Roch disse. “Nós sabemos que a arquitetura do genoma é crítica na expressão genética de regulamento e, mais importante, nos genes de regulamento que são críticos para a virulência do parasita. Agora nós podemos mais com cuidado procurarar pelos componentes ou pelas drogas que podem interromper esta organização, ajudando na identificação de estratégias novas da anti-malária.”

O laboratório de Le Roch está olhando agora outras fases do ciclo de vida da malária a fim identificar os componentes responsáveis para a arquitetura do genoma 3D.

“A importância da arquitetura do genoma era inicialmente provavelmente crítica para somente uns eukaryotes mais altos,” ela explicou. “Mas nós encontramos, a nossa surpresa, que a arquitetura do genoma está ligada pròxima à virulência mesmo no caso do parasita de malária.”

Source: Universidade Da California - Beira-rio