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Les chercheurs découvrent ARNt-lookalikes mitochondrial et nucléaire en génome humain

Le transfert RNAs (ARNt) sont les molécules de cheval de labour et la partie antiques du processus cellulaire qui produit les protéines, les synthons critiques de durée qui continuent une cellule faire fonctionner régulièrement. Une découverte neuve propose que le nombre de lieux génomiques humains qui pourraient coder pour des ARNt soit presque double ce qui est actuel connu. La plupart des lieux neuf recensés ressemblent aux séquences des ARNt mitochondriaux proposant des tiges neuves inattendues entre les génomes nucléaires et mitochondriaux humains, les tiges qui ne sont pas actuel comprises.

Le transfert RNAs (ARNt) représentent une composante intégrale de la traduction de l'l'ARN messager (ARNm) dans une séquence des acides aminés. TRNAs sont des molécules d'ARN de non-codage et peuvent être trouvés dans chacun des trois royaumes de durée c.-à-d., dans les archéobactéries, les bactéries et les eucaryotes.

Au niveau d'ADN, un triplet des nucléotides consécutifs connus sous le nom de « codon » est utilisé pour coder un acide aminé. Fréquemment, un acide aminé donné peut être codé par plus d'un codon : en fait, il y a 61 codons distincts codant les 20 acides aminés humains normaux. Pendant la traduction, chacun des codons contenus en région codante de l'ARNm actuel est identifié par son ARNt assorti et l'acide aminé correspondant ajouté à la séquence des acides aminés naissante. On l'a connu depuis de nombreuses années que chacun de ces 61 ARNt a les copies multiples écartées dans tout le génome qui est trouvé au noyau humain. La présence des lieux génomiques multiples à partir desquels la même molécule peut être effectuée est un tour assez normal de l'organisme génomique : le traitement de ces lieux en parallèle peut s'assurer que des quantités adéquates de chaque ARNt peuvent être produites assez rapidement pour contacter la forte demande que le processus de traduction acide aminé impose à la cellule. En plus des 61 ARNt qui sont trouvés dans le génome nucléaire humain, 22 ARNt supplémentaires sont codés dans le génome de l'organelle cellulaire connue sous le nom de mitochondrie : la mitochondrie, initialement une bactérie elle-même, emploie ces 22 ARNt pour effectuer des protéines hors du juste-au-dessus-un-douzaine des ARNm qui sont codés en son génome.

Les efforts de recherche récente ont prouvé que les ARNt peuvent avoir d'autres rôles, qui dépassent leur participation dans la synthèse des protéines. Par exemple, les ARNt peuvent affecter la physiologie d'une cellule, ils peuvent moduler l'abondance de molécules importantes, etc. Ceux-ci et d'autres découvertes inattendues ont rétabli l'intérêt en regardant ARNt, cette fois sous un prisme différent. Mais, combien d'ARNt sont codés par le génome humain et pourraient réellement être potentiellement impliqués dans la traduction acide aminée et d'autres procédés ?

Une équipe aboutie par Isidore Rigoutsos, directeur du centre de calcul de médicament à l'université de Thomas Jefferson (TJU), présenté pour aborder cette question et eux ont rapporté leurs découvertes dans une étude qui était simplement publiée dans les frontières de tourillon en génétique. « Ce qui nous avons trouvé, franchement, nous a étonnés, » a dit Rigoutsos.

L'équipe a recherché 3 milliards de paires de bases du génome humain les séquences d'ADN qui ont ressemblé aux 530 ARNt nucléaires et mitochondriaux connus. Quoiqu'ils aient employé des critères très rigoureux dans leurs recherches, ils ont trouvé 454" » des lieux assimilés, c.-à-d., des séquences qui ressemblent à l'ARNt, mais encore n'ont pas été expérimental confirmées en soi. Les chercheurs ont trouvé presque autant d'en tant que connus par lesquels ils ont commencé : 81% de ces ARNt-lookalikes n'avait pas été rapporté précédemment. Plutôt inopinément, l'équipe a constaté que la plupart de ces lieux neufs ont ressemblé à certains des 22 ARNt mitochondriaux.

Intéressant, les lookalikes découverts d'ARNt ne sont pas écartés uniformément en travers des 24 chromosomes. Au lieu de cela, ils ont pénétré préférentiellement quelques chromosomes et ont évité d'autres. Par exemple, les chromosomes 1, 2, 7, 8 et 9 prétendent la part du lion d'ARNt-lookalikes découvert. D'autre part, le chromosome 18 ne contient aucun lookalikes. En outre, certains des codons sont en particulier surreprésentés parmi les lookalikes alors que d'autres codons sont absents.

Les surprises ne se sont pas arrêtées là. L'équipe a également découvert que dans les chromosomes où l'ARNt-lookalikes sont trouvés leur emplacement n'est pas accidentel non plus. Au lieu de cela, les lookalikes sont positionnés dans la grande proximité aux ARNt nucléaires connus. Ceci naturellement prie la question si l'ARNt-lookalikes sont transcrits, juste comme les ARNt connus. En examinant les dépôts publics, l'équipe a trouvé la preuve de la transcription pour plus de 20% du l'ARNt-lookalikes découvert : les profils transcriptionnels semblent dépendre du type de cellules, qui propose que plus du regard-alikes s'avèrent pour être transcrits pendant que les caractéristiques de plus de types de cellules deviennent procurables. À plusieurs occasions, les caractéristiques publiques ont indiqué la preuve pour les molécules dont les points finaux ont apparié exact les points finaux du l'ARNt-lookalikes découvert par l'équipe. « Ceci excite certainement, mais il est actuel peu clair si ces molécules participent à la traduction comme ARNt, ou a des rôles entièrement différents, » a dit Rigoutsos.

Source:

Thomas Jefferson University (TJU)