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Os pesquisadores descobrem tRNA-lookalikes mitocondriais e nucleares no genoma humano

Transferência RNAs (tRNAs) é as moléculas do laborioso e a parte antigas do processo celular que cria as proteínas, os blocos de apartamentos críticos de vida que mantêm uma pilha executar lisamente. Uma descoberta nova sugere que o número de locus genomic humanos que puderam codificar para tRNAs seja quase dobro o que é sabido actualmente. A maioria dos locus recentemente identificados assemelham-se às seqüências dos tRNAs mitocondriais que sugerem as relações novas inesperadas entre os genomas nucleares e mitocondriais humanos, as relações que não são compreendidas actualmente.

Transferência RNAs (tRNAs) representa um componente integral da tradução de um RNA de mensageiro (mRNA) em uma seqüência de ácido aminado. TRNAs é moléculas do RNA da não-codificação e pode ser encontrado em todos os três reinos da vida isto é, no archaea, nas bactérias e nos eukaryotes.

A nível do ADN, uma objectiva tripla dos nucleotides consecutivos conhecidos como o “codon” é usada para codificar um ácido aminado. Freqüentemente, um ácido aminado dado pode ser codificado por mais de um codon: de facto, há 61 codons distintos que codificam os 20 ácidos aminados humanos padrão. Durante a tradução, cada um dos codons contidos na região da codificação do mRNA à mão é reconhecido por seu tRNA de harmonização e pelo ácido aminado correspondente adicionado à seqüência de ácido aminado emergente. Soube-se por muitos anos que cada um destes 61 tRNAs tem as cópias múltiplas espalhadas durante todo o genoma que é encontrado no núcleo humano. A presença de locus genomic múltiplos de que a mesma molécula pode ser feita é um truque razoavelmente padrão da organização genomic: processar estes locus paralelamente pode assegurar-se de que as quantidades adequadas de cada tRNA possam ser geradas rapidamente bastante para encontrar a alta demanda que o processo de tradução do ácido aminado impor na pilha. Além do que os 61 tRNAs que são encontrados no genoma nuclear humano, 22 mais tRNAs são codificados no genoma do organelle celular conhecido como o mitochondrion: o mitochondrion, originalmente uma bactéria própria, usa estes 22 tRNAs para fazer proteínas fora do apenas-sobre-um-dúzia os mRNAs que são codificados em seu genoma.

Os esforços de pesquisa recentes mostraram que os tRNAs podem ter outros papéis, que vão além de sua participação na síntese da proteína. Por exemplo, os tRNAs podem afectar a fisiologia de uma pilha, eles podem modular a abundância de moléculas importantes, etc. Estes e outros resultados inesperados reviveram o interesse em olhar os tRNAs, esta vez sob um prisma diferente. Mas, quantos tRNAs realmente são codificados pelo genoma humano e poderiam ser potencial involvidos na tradução do ácido aminado e nos outros processos?

Uma equipe conduzida por Isidoro Rigoutsos, director do centro computacional da medicina na universidade de Thomas Jefferson (TJU), expor para abordar esta pergunta e eles relatou seus resultados em um estudo que fosse publicado apenas nas fronteiras do jornal nas genéticas. “O que nós encontramos, sincera, surpreendeu-nos,” disse Rigoutsos.

A equipe procurarou os 3 bilhão pares baixos do genoma humano pelas seqüências do ADN que se assemelharam aos 530 tRNAs nucleares e mitocondriais conhecidos. Mesmo que usassem critérios muito estritos em suas buscas, encontraram 454"” locus idênticos, isto é, as seqüências que olham como o tRNA, mas não foram confirmadas ainda experimental como tal. Os pesquisadores encontraram quase tanto como como conhecidos com que começaram: 81% destes tRNA-lookalikes não tinha sido relatado previamente. Um pouco inesperada, a equipe encontrou que a maioria destes locus novos se assemelharam a alguns dos 22 tRNAs mitocondriais.

Interessante, os lookalikes descobertos do tRNA não são espalhados uniformemente através dos 24 cromossomas. Em lugar de, penetraram preferencial alguns cromossomas e evitaram outro. Por exemplo, os cromossomas 1, 2, 7, 8 e 9 reivindicam a parte de leão dos tRNA-lookalikes descobertos. Por outro lado, o cromossoma 18 não contem nenhum lookalikes. Também, alguns dos codons sobre-são representados particularmente entre os lookalikes visto que outros codons são ausentes.

As surpresas não pararam lá. A equipe igualmente descobriu que nos cromossomas onde os tRNA-lookalikes são encontrados seus lugar não são acidentais tampouco. Em lugar de, os lookalikes são posicionados na grande proximidade aos tRNAs nucleares conhecidos. Isto naturalmente implora a pergunta se os tRNA-lookalikes estejam transcritos, apenas como os tRNAs conhecidos. Examinando repositórios públicos, a equipe encontrou a evidência da transcrição para mais de 20% dos tRNA-lookalikes descobertos: os perfis transcricionais parecem depender do tipo da pilha, que sugere que mais do olhar-alikes estejam encontradas para ser transcritas enquanto os dados de mais tipos da pilha se tornam disponíveis. Em várias ocasiões, os dados públicos revelaram a evidência para as moléculas cujos os valores-limite combinaram exactamente os valores-limite dos tRNA-lookalikes descobertos pela equipe. “Isto é certamente emocionante, mas é actualmente obscuro se estas moléculas participam na tradução como tRNAs, ou tem papéis totalmente diferentes,” disse Rigoutsos.

Source:

Thomas Jefferson University (TJU)