Nanopore neuf ADN de test de chercheurs ordonnançant la technologie pour trouver la cause de la résistance aux antibiotiques

Le nanopore neuf ADN ordonnançant la technologie sur un dispositif la taille d'une clé de mémoire USB a pu être employé pour diagnostiquer l'infection - selon la recherche neuve de l'université d'East Anglia et de santé publique Angleterre.

Les chercheurs ont vérifié la technologie neuve avec un problème complexe - déterminant la cause de la résistance aux antibiotiques dans une souche résistante neuve de multi-médicament de la bactérie qui entraîne typhoïde.

Les résultats, aujourd'hui publié en biotechnologie de nature de tourillon, indiquent que la petite, accessible et rentable technologie pourrait révolutionner l'ordonnancement génomique.

La technologie actuelle pour « longtemps affiché » a détaillé l'ordonnancement génomique peut être exécutée utilisant l'instrumentation chère (autour de £500,000). Elle est complexe pour exécuter, et généralement seulement procurable dans des laboratoires de spécialiste.

L'équipe de recherche a vérifié un dispositif neuf MinION appelé, produit par Oxford Nanopore Technologies Ltd. que la machine produit longtemps l'ordonnancement indique utilisant une méthodologie différente qui n'exige pas la représentation optimale - mais à une petite part de coût d'instrument (prévu pour être autour de £650 selon le dispositif). Ces long s'affiche est important en essayant pour déterminer où les gènes de résistance sont.

Chercheurs prouvés son installation en traçant avec succès les gènes de résistance de multi-médicament dans une haplotype appelée H58 - qui de salmonella typhi de tension a récent apparu mondial.

Ils ont avec succès indiqué exactement l'endroit exact dans la structure chromosomique qui est à la maison aux gènes qui le rend résistant à la drogue, connu comme île de résistance aux antibiotiques. Le subordonné a pris juste 18 heures pour produire les résultats, avec l'exactitude assimilée aux technologies actuelles.

Aboutissez M. Justin O'Grady de chercheur, à partir de la Faculté de Médecine de Norwich d'UEA, avez dit : « Ce type de technologie révolutionnera la manière dont nous caractérisons la propagation rapide des maladies infectieuses résistant aux antibiotiques apparaissantes.

« Cette analyse aurait précédemment pris des mois suivre des méthodes traditionnelles, dues à l'analyse basée sur laboratoire de goujon-ordonnancement considérable. Avant que les résultats soient procurables, ils pourraient bien être inutiles des interventions pour santé publique clinique de diagnose et de guidage.

« C'est la première recherche publiée dans le monde pour expliquer le potentiel énorme du subordonné ordonnançant pour résoudre des problèmes biologiques importants et complexes.

« La santé publique et les laboratoires cliniques pourraient bientôt avoir l'accès facile à cette technologie rapide et bon marché qui, en combination avec l'ordonnancement affiché court, est capable de fournir les génomes bactériens entièrement assemblés. D'autres améliorations au système sont susceptibles d'enlever les caractéristiques affichées de séquence du besoin pour faire court.

La « technologie de subordonné a pu potentiellement activer l'identification bactérienne, le diagnostic des maladies infectieuses et le dépistage de la résistance au médicament au moment où le besoin clinique.

« Ce type de technologie rend l'ordonnancement de prochain rétablissement accessible aux scientifiques partout. »

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