ADN novo do nanopore do teste dos pesquisadores que arranja em seqüência a tecnologia para detectar a causa da resistência antibiótica

O ADN novo do nanopore que arranja em seqüência a tecnologia em um dispositivo o tamanho de uma vara de USB podia ser usado para diagnosticar a infecção - de acordo com a pesquisa nova da universidade de East Anglia e da saúde pública Inglaterra.

Os pesquisadores testaram a nova tecnologia com um problema complexo - determinando a causa da resistência antibiótica em uma tensão resistente da multi-droga nova da bactéria que causa tifóide.

Os resultados, publicados hoje na biotecnologia da natureza do jornal, revelam que a tecnologia pequena, acessível e eficaz na redução de custos poderia revolucionar arranjar em seqüência genomic.

A tecnologia actual para “lido por muito tempo” detalhou arranjar em seqüência genomic pode ser executada usando a instrumentação cara (em torno de £500,000). É complexa executar, e geralmente somente disponível em laboratórios do especialista.

A equipa de investigação testou um dispositivo novo chamado Sequaz, produzido tecnologias Ltd de Oxford Nanopore. A máquina produz por muito tempo arranjar em seqüência lê usando uma metodologia diferente que não exija a imagem lactente óptima - mas em uma fracção pequena do custo do instrumento (esperado ser em torno de £650 pelo dispositivo). Este longo lê é importante ao tentar determinar onde os genes de resistência estão.

Os pesquisadores provaram seu serviço público com sucesso traçando os genes de resistência da multi-droga em uma tensão chamada o haplotype H58 de Salmonela Tifo - qual emergiu recentemente global.

Localizaram com sucesso o ponto exacto na estrutura cromossomática que é home aos genes que o faz resistente aos medicamentos, sabido como uma ilha antibiótica da resistência. O sequaz tomou apenas 18 horas para produzir os resultados, com precisão similar às tecnologias actuais.

Conduza o Dr. Justin O'Grady do pesquisador, da Faculdade de Medicina do Norwich de UEA, disse-o: “Este tipo de tecnologia revolucionará a maneira que nós caracterizamos a propagação rápida de doenças infecciosas resistentes aos antibióticos emergentes.

“Esta análise previamente tomaria meses usando os métodos tradicionais, devido à análise laboratório-baseada cargo-arranjando em seqüência extensiva. Antes que os resultados estivessem disponíveis, puderam bem ser irrelevantes para intervenções da saúde pública clínica dos diagnósticos e do guiamento.

“Esta é a primeira pesquisa publicada no mundo para demonstrar o potencial enorme do sequaz que arranja em seqüência para resolver problemas biológicos importantes e complexos.

“A saúde pública e os laboratórios clínicos poderiam logo ter o acesso fácil a esta tecnologia rápida, barata que, em combinação com arranjar em seqüência lido curto, é capaz de fornecer genomas bacterianos inteiramente montados. Umas melhorias mais adicionais ao sistema são prováveis remover para breve os dados lidos da seqüência da necessidade.

Do “a tecnologia sequaz podia potencial permitir a identificação bacteriana, o diagnóstico de doenças infecciosas e a detecção de droga-resistência no ponto da necessidade clínica.

“Este tipo de tecnologia faz arranjar em seqüência da próxima geração acessível aos cientistas em toda parte.”

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