DNA del nanopore de la prueba de los investigadores nueva que ordena tecnología para descubrir causa de la resistencia antibiótico

La nueva DNA del nanopore que ordenaba tecnología en un dispositivo la talla de un bastón de USB se podía utilizar para diagnosticar la infección - según la nueva investigación de la universidad de East Anglia y de la salud pública Inglaterra.

Los investigadores probaron la nueva tecnología con un problema complejo - determinando la causa de la resistencia antibiótico en una deformación resistente de la nueva multi-droga de la bacteria que causa tifoideo.

Los resultados, publicados hoy en la biotecnología de la naturaleza del gorrón, revelan que la tecnología pequeña, accesible y de poco costo podría revolucionar la secuencia genomic.

La tecnología actual para “leído de largo” detalló la secuencia genomic se puede realizar usando la instrumentación costosa (alrededor de £500,000). Es compleja realizarse, y generalmente solamente disponible en laboratorios del especialista.

El equipo de investigación probó un nuevo dispositivo llamado MinION, producido por Oxford Nanopore Technologies Ltd. La máquina produce de largo la secuencia lee usando una diversa metodología que no requiera proyección de imagen óptima - pero en una pequeña parte del costo del instrumento (preveído para estar alrededor de £650 por el dispositivo). Este largo lee es importante al intentar determinar donde están los genes de resistencia.

Los investigadores probaron su utilidad con éxito correlacionando los genes de resistencia de la multi-droga en una deformación llamada el haplotipo H58 de Salmonella Typhi - cuál ha emergido recientemente global.

Establecieron claramente con éxito el sitio exacto en la estructura cromosómica que es casera a los genes que lo hace drogorresistente, conocido como isla antibiótico de la resistencia. El subordinado tardó apenas 18 horas para producir los resultados, con exactitud similar a las tecnologías actuales.

Lleve al Dr. Justin O'Grady del investigador, de la Facultad de Medicina de Norwich de UEA, dijo: “Este tipo de tecnología revolucionará la manera que caracterizamos la extensión rápida de enfermedades infecciosas resistentes a los antibióticos emergentes.

“Este análisis habría tardado previamente meses usando los métodos tradicionales, debido al análisis laboratorio-basado de poste-secuencia extenso. Para el momento en que los resultados estén disponibles, puede ser que sean bien inútiles para las intervenciones de la salud pública clínica de los diagnósticos y el conducir.

“Ésta es la primera investigación publicada en el mundo para demostrar el potencial enorme del subordinado que ordena para resolver problemas biológicos importantes y complejos.

La “salud pública y los laboratorios clínicos podrían pronto tener de fácil acceso a esta tecnología rápida, barata que, conjuntamente con la secuencia leída corta, es capaz de ofrecer los genomas bacterianos completo montados. Otras mejorías al sistema son probables quitar la necesidad de datos leídos cortos de la serie.

La “tecnología del subordinado podía potencialmente habilitar la identificación bacteriana, la diagnosis de enfermedades infecciosas y la detección de la resistencia a los medicamentos actualmente necesidad clínica.

“Este tipo de tecnología hace la secuencia de la generación siguiente accesible a los científicos por todas partes.”

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