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Primer arsenal de SNP optimizado para la población japonesa

Un grupo de investigación, llevado por profesor Masao Nagasaki y profesor adjunto mayor Yosuke Kawai en la organización médica de Tohoku Megabank de la universidad de Tohoku, ha diseñado con éxito el primer arsenal de SNP que se ha optimizado para la población japonesa.

SNP, que representa único polimorfismo del nucleótido, es una variación de la serie de la DNA que ocurre común dentro de una población.

Este nuevo arsenal, llamado el “arsenal de Japonica,” reviste la región del entero-genoma de la cual el SNPs poseído por el pueblo japonés se puede obtener con un alto nivel de exactitud.

El diseño del arsenal de Japonica fue logrado desarrollando y ejecutando un algoritmo único de la selección de SNP y analizando, en un superordenador, toda la información del genoma de los 1.070 individuos que participaron en la cohorte studies*2 del proyecto médico de Tohoku Megabank.

Usando tecnología del genotipo imputation*3, la información sobre un máximo de 20 millones de SNPs se supone de solamente 659.253 SNPs en el arsenal de Japonica.

El arsenal de Japonica tiene una exactitud de la imputación que sea por lo menos los 10% mejores que otras matrices existentes de SNP que contengan un número equivalente de SNPs, y ofrezca un nivel de funcionamiento al cual sea equivalente o más arriba que existe SNP las matrices que contienen tres o más cronometra el número de SNPs.

Esta investigación ha producido una herramienta de análisis básica para la identificación en grande y el estudio de los genes relacionados con la constitución y las enfermedades físicas que son peculiares al japonés. Ha rendido hasta ahora los resultados importantes que pueden acelerar la investigación de la atención sanitaria y del remedio personalizados.

Los resultados de esta investigación fueron liberados en la versión en línea del gorrón de la genética humana el 25 de junio de 2015.

Source:

Tohoku University