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Le test neuf recense les virus qui infectent des gens et des animaux

Un test neuf trouve pratiquement n'importe quel virus qui infecte des gens et des animaux, selon la recherche à l'École de Médecine d'université de Washington à St Louis, où la technologie a été développée.

Beaucoup de milliers de virus sont connus pour entraîner la maladie chez les gens et les animaux, et effectuer un diagnostic peut être un exercice approfondi, exigeant parfois une batterie de différents tests. C'est parce que les tests actuels ne sont pas assez sensibles pour trouver les concentrations faibles des parasites viraux ou sont limités à trouver seulement ces virus soupçonnés d'être responsables de la maladie d'un patient.

« Avec ce test, vous ne devez pas savoir ce que vous recherchez, » avez dit l'auteur supérieur de l'étude, Gregory Storch, DM, Ruth L. Siteman professeur de la pédiatrie. « Elle moule un réseau grand et peut efficacement trouver les virus qui sont présents aux concentrations très faibles. Nous pensons que le test sera particulièrement utile dans les situations où un diagnostic demeure évasif après que contrôle normal ou dans les situations dans lesquelles la cause d'une épidémie est inconnue. »

En ligne publiés de résultats en septembre dans la recherche de génome de tourillon expliquent que l'hospitalisé échantillonne le test neuf - ViroCap appelé - peut trouver des virus non trouvés par le contrôle normal basé sur le séquençage du génome. Le test neuf pourrait être employé pour trouver des manifestations de virus mortels tels qu'Ebola, Marbourg et syndrôme respiratoire aigu sévère (SARS), ainsi que virus plus courants, y compris les rotavirus et le norovirus, qui entraînent des infections gastro-intestinales sévères.

Les séquences de test et trouve des échantillons d'hospitalisé de virus et est juste comme sensible que les analyses d'amplification en chaîne par polymérase (PCR) d'étalon-or, qui sont appliquées largement dans les laboratoires cliniques. Cependant, même les analyses d'ACP les plus expansives peuvent seulement examiner pour jusqu'à environ 20 virus assimilés en même temps.

Les chercheurs d'université de Washington effectuent la technologie qu'ils ont développé publiquement - procurable aux scientifiques et aux cliniciens mondiaux, au profit des patients et de la recherche.

Les chercheurs ont évalué le test neuf dans deux ensembles d'échantillons biologiques - par exemple, du sang, des selles et des sécrétions nasales - des patients à l'hôpital pour enfants de St Louis. Dans le premier, le contrôle normal qui s'est fondé sur le séquençage du génome avait trouvé des virus dans 10 de 14 patients. Mais le test neuf a trouvé des virus dans les quatre enfants qu'un contrôle plus tôt avait manqués. Le contrôle normal n'a pas trouvé les virus courants et quotidiens : grippe B, une cause de la grippe saisonnière ; parechovirus, un gastro-intestinal doux et virus respiratoire ; virus du herpès 1, responsable des boutons de fièvre dans la bouche ; et virus varicelle-zona, qui entraîne la varicelle.

Dans un deuxième groupe d'enfants avec des fièvres inexpliquées, le contrôle normal avait trouvé 11 virus dans les huit enfants évalués. Mais le test neuf a trouvé encore sept, y compris un B humain appelé 3A d'adénovirus de virus respiratoire, qui est habituellement inoffensif mais peut entraîner des infections sévères dans quelques patients.

En tout, le nombre de virus trouvés dans les deux groupes patients a sauté à 32 de 21, une augmentation de 52 pour cent.

« Le test est si sensible qu'il trouve également des tensions variables des virus qui sont étroitement liés génétiquement, » a dit l'auteur Todd correspondant Wylie, un instructeur de la pédiatrie. Les « légères variations génétiques parmi des virus souvent ne peuvent pas être discernées par les tests actuellement disponibles et compliquer la capacité des médecins de trouver toutes les variantes avec un test. »

De plus, parce que le test comprend des informations génétiques détaillées sur des tensions variées des virus particuliers, des sous-types peuvent être recensés facilement. Par exemple, l'étude a prouvé que tandis que le contrôle normal recensait un virus pendant que la grippe A, qui entraîne la grippe saisonnière, le test neuf indiquait que le virus était un sous-type particulièrement brutal H3N2 appelé.

La saison de la grippe passée, H3N2 a contribué à environ 36.000 morts aux Etats-Unis. Et dans quelques patients - en particulier jeunes enfants, adultes plus âgés et les gens avec le système immunitaire affaibli - savoir que la tension H3N2 est le présent peut modifier la demande de règlement.

Pour développer le test, les chercheurs ont visé de seules extensions d'ADN ou d'ARN de chaque groupe connu de virus qui infecte des êtres humains et des animaux. En tout, l'équipe de recherche a inclus 2 millions de seules extensions de matériel génétique des virus dans le test. Ces extensions de matériau sont employées en tant que sondes pour plumer à l'extérieur les échantillons d'hospitalisé de virus qui sont une correspondance génétique. Le matériau viral apparié alors s'analyse utilisant l'ordonnancement génétique de haut-débit. Car des virus complet nouveaux sont découverts, leur matériel génétique pourrait facilement être ajouté au test, Storch a dit.

Les chercheurs planification pour conduire la recherche complémentaire pour valider l'exactitude du test, ainsi ce pourrait être plusieurs années avant qu'il soit cliniquement procurable.

« Il peut également être possible de modifier le test de sorte qu'il ait pu être employé pour trouver des agents pathogènes autres que des virus, y compris des bactéries, des champignons et d'autres microbes, ainsi que les gènes qui indiqueraient que l'agent pathogène est résistant au traitement avec des antibiotiques ou d'autres médicaments, » a dit le co-auteur Kristine Wylie, PhD, professeur adjoint de la pédiatrie.

Dans le même temps, la technologie peut être employée par des scientifiques pour étudier des virus dans un cadre de recherches. Kristine Wylie vérifie les virus dans lesquels installez le domicile et sur le corps humain, collectivement connus sous le nom de virome. Le test neuf fournira une voie de capter la pleines largeur et profondeur de tels virus, et approfondit la compréhension de la façon dont elles jouent un rôle en maintenant le fuselage sain.

Source:

Washington University School of Medicine