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La nueva prueba determina los virus que infectan gente y animales

Una nueva prueba descubre virtualmente cualquier virus que infecte gente y animales, según la investigación en la Facultad de Medicina de la universidad de Washington en St. Louis, en donde la tecnología fue desarrollada.

Muchos millares de virus se saben para causar enfermedad en gente y animales, y la fabricación de una diagnosis puede ser un ejercicio exhaustivo, requiriendo a veces una batería de diversas pruebas. Eso es porque las pruebas actuales no son bastante sensibles descubrir los niveles bajos de fallos de funcionamiento virales ni se limitan a descubrir solamente esos virus sospechosos de ser responsables de la enfermedad de un paciente.

“Con esta prueba, usted no tiene que conocer lo que usted está buscando,” dijo al autor mayor del estudio, Gregory Storch, Doctor en Medicina, Ruth L. Siteman profesor de la pediatría. “Echa una red amplia y puede descubrir eficientemente los virus que están presentes en los niveles muy bajos. Pensamos que la prueba será especialmente útil en las situaciones donde una diagnosis sigue siendo evasiva después de que prueba estándar o en las situaciones en las cuales la causa de un brote de la enfermedad es desconocida.”

Los resultados publicaron en línea en septiembre en la investigación del genoma del gorrón demuestran que el hospitalizado muestrea la nueva prueba - ViroCap llamado - puede descubrir los virus no encontrados por la prueba estándar basada en la secuencia del genoma. La nueva prueba se podría utilizar para descubrir brotes de virus mortales tales como Ebola, Marburgo y neumonía asiática (SARS), así como virus más rutinarios, incluyendo el rotavirus y el norovirus, que causan infecciones gastrointestinales severas.

Las series de prueba y descubren muestras el hospitalizado de los virus y son apenas tan sensibles como los análisis oro-estándar de la reacción en cadena (PCR) de polimerasa, que se utilizan extensamente en laboratorios clínicos. Sin embargo, incluso los análisis más expansivos de la polimerización en cadena pueden revisar solamente para hasta cerca de 20 virus similares al mismo tiempo.

Los investigadores de la universidad de Washington están haciendo la tecnología que desarrollaron público - disponible a los científicos y a los clínicos mundiales, en.beneficio de pacientes y de la investigación.

Los investigadores evaluaron la nueva prueba en dos equipos de muestras biológicas - por ejemplo, de sangre, de taburete y de secreciones nasales - de pacientes en el hospital de niños de St. Louis. En el primer, la prueba estándar que confió en la secuencia del genoma había descubierto virus en 10 de 14 pacientes. Pero la nueva prueba encontró virus en los cuatro niños que la prueba anterior había faltado. La prueba estándar no pudo descubrir virus comunes, diarios: gripe B, una causa de la gripe estacional; parechovirus, un virus gastrointestinal y respiratorio suave; virus de herpes 1, responsable de dolores fríos en la boca; y virus del varicela-zoster, que causa varicela.

En un segundo grupo de niños con fiebres inexplicadas, la prueba estándar había descubierto 11 virus en los ocho niños evaluados. Pero la nueva prueba encontró otros siete, incluyendo un virus respiratorio llamado el A humano 3A del adenovirus, que es generalmente inofensivo pero puede causar infecciones severas en algunos pacientes.

En todos, el número de virus descubiertos en los dos grupos pacientes saltó a 32 a partir del 21, un aumento del 52 por ciento.

“La prueba es tan sensible que también descubre deformaciones variables de los virus que están estrechamente vinculados genético,” dijo autor a Todd correspondiente Wylie, instructor de la pediatría. Las “variaciones genéticas ligeras entre virus no pueden ser distinguidas por las pruebas actualmente disponibles y complicar a menudo la capacidad de los médicos de descubrir todas las variantes con una prueba.”

Además, porque la prueba incluye la información genética detallada sobre diversas deformaciones de virus determinados, los subtipos se pueden determinar fácilmente. Por ejemplo, el estudio mostró que mientras que la prueba estándar determinó un virus mientras que la gripe A, que causa gripe estacional, la nueva prueba indicó que el virus era un subtipo determinado duro llamado H3N2.

La temporada de gripe pasada, H3N2 contribuyó a unas 36.000 muertes en los Estados Unidos. Y en algunos pacientes - determinado niños jovenes, más viejos adultos y gente con los sistemas inmunes debilitados - conocer que es la deformación H3N2 el presente puede alterar el tratamiento.

Para desarrollar la prueba, los investigadores apuntaron alargamientos únicos de la DNA o del ARN de cada grupo sabido de virus que infecta seres humanos y animales. En todos, el equipo de investigación incluyó 2 millones de alargamientos únicos del material genético de virus en la prueba. Estos alargamientos del material se utilizan como antenas para arrancar fuera las muestras el hospitalizado de los virus que son un fósforo genético. El material viral igualado entonces se analiza usando la secuencia genética de la alto-producción. Pues se descubren los virus totalmente nuevos, su material genético se podría agregar fácilmente a la prueba, Storch dijo.

Los investigadores proyectan conducto la investigación adicional para validar la exactitud de la prueba, así que podría ser varios años antes de que esté clínico disponible.

“También puede ser posible modificar la prueba de modo que pudiera ser utilizado para descubrir patógeno con excepción de virus, incluyendo bacterias, hongos y otros microbios, así como los genes que indicarían que el patógeno es resistente al tratamiento con los antibióticos u otras drogas,” dijo al co-autor Kristine Wylie, doctorado, profesor adjunto de la pediatría.

Mientras tanto, la tecnología se puede utilizar por los científicos para estudiar virus en una fijación de la investigación. Kristine Wylie investiga los virus en los cuales fije la residencia y en el cuerpo humano, conocidos colectivamente como el virome. La nueva prueba ofrecerá una manera de capturar la anchura y la profundidad completas de tales virus, y profundiza la comprensión de cómo desempeñan un papel en mantener la carrocería sana.

Source:

Washington University School of Medicine