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La recherche a pu changer le regard de gens de voie à l'expression du gène, réaction immunitaire

La recherche du centre génomique unicellulaire sur le campus de génome de Wellcome pourrait changer la voie que nous regardons l'expression du gène et la réaction immunitaire. Publié dans des méthodes de nature, la méthode neuve, traceur, fournit un puissant outil pour la recherche dans la réaction immunitaire, la vaccination, le cancer et l'auto-immunité.

Que prépare à une crise à cellule T un antigène, et est-ce que des autres le rappellent pendant la fois prochaine ? Une suite d'ARN ordonnançant des expériences par le groupe de Teichmann à l'institut européen de bio-informatique (EMBL-EBI) et à l'institut de Sanger de confiance de Wellcome a abouti le groupe à développer une technique neuve pour comprendre des récepteurs des lymphocytes T. Le traceur, un outil de ordonnancement unicellulaire, permet à la détermination de les deux la séquence du récepteur des lymphocytes T en différentes cellules, avec le profil de l'expression du gène de chaque cellules. Ceci ouvrent des possibilités neuves à l'avenir pour développer la diagnose rapide basée sur le profil génétique des globules sanguins.

Quand votre système immunitaire trouve un envahisseur - si c'est une maladie ou, dans le cas de la maladie auto-immune, une partie de votre propre fuselage - elle commence à produire des forces terrestres des cellules de T pour retirer l'agent pathogène, que lui-même produit un bon nombre de différentes protéines.

« C'est un champ de bataille, avec des chasseurs sur différents fronts, des champs de tireur isolé, généraux et même les journalistes témoignant, » explique Mike Stubbington d'EMBL-EBI, maintenant à l'institut de Sanger. « Ce qui nous avons voulu savoir était comment les différentes populations des cellules de T répondent à la maladie - quel rôle ils jouent dans le combat. »

Des cellules de T sont équipées des récepteurs qui peuvent enclencher en circuit à un envahisseur particulier hors d'un tableau immense de choix possibles. Ceci signifie qu'elles sont extrêmement variables, avec des centaines de milliards de séquences d'ADN possibles. Une combinaison des séquences appareillées détermine quelle protéine un récepteur trouvera, ainsi pour comprendre ce qui se produit au niveau moléculaire, il est impérieux de trouver les deux séquences en chaque cellule. Utilisant le traceur, les scientifiques peuvent regarder les profils d'ADN et d'ARN (expression) de ces récepteurs des lymphocytes T hautement variables en même temps.

Les chercheurs ont trouvé que les séquences de récepteur sont seules, à moins que les cellules de T aient la même cellule de parent. La présence des cellules de « enfant de mêmes parents » montre qu'une infection a déclenché la division d'une cellule T particulière, qui indique qu'elle se multiplie pour combattre l'envahisseur. Utilisant le traceur, les chercheurs ont exactement recensé des cellules de « enfant de mêmes parents » et ont exploré leur réaction différente à la salmonellose.

« Cette technique nous aide à voir si tous les « enfants » d'une cellule T particulière font la même chose en même temps, qui est une question ouverte dans la biologie, » ajoute Tapio Lönnberg d'EMBL-EBI. « Nous pouvons commencer à voir si l'antigène lui-même joue un rôle dans la façon dont une cellule T répondra, et même s'il est possible de déterminer ce qu'est l'envahisseur, juste basé sur la séquence d'un récepteur des lymphocytes T. »

« Ce genre de travail de découverte peut seulement être fait utilisant des mesures unicellulaires, » dit Sarah Teichmann, chef de génétique cellulaire à l'institut de Sanger. « Cet outil neuf pour l'ordonnancement unicellulaire nous donne une approche neuve à l'étude des cellules de T, et fournit des possibilités neuves d'explorer des réactions immunitaires dans la maladie, la vaccination, le cancer et l'auto-immunité. »

La prochaine opération pour l'équipe est de s'appliquer les méthodes assimilées à l'étude des cellules de B pour comprendre mieux le système immunitaire adaptatif dans son ensemble.

Source:

European Molecular Biology Laboratory - European Bioinformatics Institute