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La ricerca ha potuto cambiare lo sguardo della gente di modo ad espressione genica, risposta immunitaria

La ricerca dal centro unicellulare di genomica sulla città universitaria del genoma di Wellcome potrebbe cambiare il modo che esaminiamo l'espressione genica e la risposta immunitaria. Pubblicato nei metodi della natura, il nuovo metodo, elemento tracciante, fornisce uno strumento potente per ricerca sulla risposta immunitaria, sulla vaccinazione, sul cancro e sull'autoimmunità.

Che cosa prepara ad un attacco a cellula T un antigene ed un altro lo ricordano per la volta prossima? Una serie di RNA che ordina gli esperimenti dal gruppo di Teichmann all'istituto europeo di bioinformatica (EMBL-EBI) ed all'istituto di Sanger della fiducia di Wellcome piombo il gruppo sviluppare una nuova tecnica per la comprensione dei ricevitori a cellula T. L'elemento tracciante, uno strumento d'ordinamento unicellulare, concede alla determinazione di entrambi la sequenza del recettore delle cellule t in diverse celle, con il profilo dell'espressione genica di ogni cellule. Ciò apre le nuove possibilità in futuro per sviluppare i sistemi diagnostici rapidi basati sul profilo genetico dei globuli.

Quando il vostro sistema immunitario individua un invasore - se quella è una malattia o, nel caso della malattia autoimmune, una parte del vostro proprio organismo - comincia produrre un esercito delle celle di T per eliminare l'agente patogeno, che stesso sta producendo i lotti delle proteine differenti.

“È un campo di battaglia, con i combattenti sulle parti anteriori differenti, tiratori franchi, generali e perfino i giornalisti che testimoniano il,„ spiega Mike Stubbington di EMBL-EBI, ora all'istituto di Sanger. “Che cosa abbiamo voluto sapere era come le popolazioni differenti delle celle di T rispondono alla malattia - che ruolo stanno svolgendo nella battaglia.„

Le celle di T sono fornite di ricevitori che possono agganciarsi ad un invasore particolare da una vasta schiera delle opzioni possibili. Ciò significa che sono estremamente variabili, con le centinaia di miliardi di sequenze possibili del DNA. Una combinazione di sequenze accoppiate determina che proteina un ricevitore individuerà, in modo da capire che cosa sta accadendo al livello molecolare, è di importanza fondamentale da trovare entrambe le sequenze in ogni cella. Facendo uso dell'elemento tracciante, gli scienziati possono osservare i profili del RNA e del DNA (espressione) di questi ricevitori a cellula T altamente variabili allo stesso tempo.

I ricercatori hanno trovato che le sequenze del ricevitore sono uniche, a meno che le celle di T avessero la stessa cellula madre. La presenza di celle “del fratello germano„ prova che un'infezione ha avviato la divisione di una cellula T particolare, che indica che sta moltiplicandosi per combattere l'invasore. Facendo uso dell'elemento tracciante, i ricercatori hanno identificato esattamente le celle “del fratello germano„ ed hanno esplorato la loro risposta differente a salmonellosi.

“Questa tecnica ci aiuta a vedere se tutti i “bambini„ di una cellula T particolare fanno la stessa cosa allo stesso tempo, che è una questione aperta nella biologia,„ aggiunge Tapio Lönnberg di EMBL-EBI. “Possiamo cominciare vedere se l'antigene stesso svolge un ruolo in come una cellula T risponderà e perfino se è possibile determinare che cosa l'invasore è, basato appena sulla sequenza di un recettore delle cellule t.„

“Questo genere di lavoro dell'innovazione può essere fatto soltanto facendo uso delle misure unicellulari,„ dice Sara Teichmann, testa della genetica cellulare all'istituto di Sanger. “Questo nuovo strumento per l'ordinamento unicellulare ci dà un nuovo approccio allo studio sulle celle di T e dà le nuove possibilità esplorare le risposte immunitarie nella malattia, nella vaccinazione, nel cancro e nell'autoimmunità.„

Il punto seguente per il gruppo è di applicare i simili metodi allo studio sui linfociti B per capire meglio il sistema immunitario adattabile complessivamente.

Source:

European Molecular Biology Laboratory - European Bioinformatics Institute