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A pesquisa podia mudar o olhar dos povos da maneira na expressão genética, resposta imune

A pesquisa do centro da genómica da Único-Pilha sobre o terreno do genoma de Wellcome poderia mudar a maneira que nós olhamos a expressão genética e a resposta imune. Publicado em métodos da natureza, o método novo, projétil luminoso, fornece uma ferramenta poderosa para a pesquisa na resposta imune, na vacinação, no cancro e na auto-imunidade.

Que faz a um ataque de célula T um antígeno, e outro recorda-o pela próxima vez? Uma série de RNA que arranja em seqüência experiências pelo grupo de Teichmann no instituto europeu da bioinformática (EMBL-EBI) e no instituto de Sanger da confiança de Wellcome conduziu o grupo desenvolver uma técnica nova para compreender os receptors de célula T. O projétil luminoso, uma único-pilha que arranja em seqüência a ferramenta, permite à determinação de ambos a seqüência do receptor de célula T em pilhas individuais, junto com o perfil da expressão genética de cada pilha. Isto abre possibilidades novas no futuro para desenvolver os diagnósticos rápidos baseados no perfil genético dos glóbulos.

Quando seu sistema imunitário detecta um invasor - se aquela é uma doença ou, no caso da doença auto-imune, uma parte de seu próprio corpo - começa produzir um exército de pilhas de T para remover o micróbio patogénico, que próprio está produzindo lotes de proteínas diferentes.

“É um campo de batalha, com os combatentes em partes dianteiras diferentes, atiradores furtivos, generais e mesmo os journalistas que testimoniam,” explicam Mike Stubbington de EMBL-EBI, agora no instituto de Sanger. “O que nós quisemos saber era como as populações diferentes de pilhas de T respondem à doença - que papel estão jogando na batalha.”

As pilhas de T são equipadas com os receptors que podem travar sobre a um invasor particular fora de uma disposição vasta de opções possíveis. Isto significa que são extremamente variáveis, com centenas de biliões de seqüências possíveis do ADN. Uma combinação de seqüências emparelhadas determina que proteína um receptor detectará, assim que para compreender o que esteja acontecendo a nível molecular, é imperativo encontrar ambas as seqüências em cada pilha. Usando o projétil luminoso, os cientistas podem olhar os perfis do ADN e do RNA (expressão) destes receptors de célula T altamente variáveis ao mesmo tempo.

Os pesquisadores encontraram que as seqüências do receptor são originais, a menos que as pilhas de T tivessem a mesma pilha do pai. A presença de pilhas do “irmão” mostra que uma infecção provocou a divisão de um t cell particular, que indique que está multiplicando para lutar o invasor. Usando o projétil luminoso, os pesquisadores identificaram exactamente pilhas do “irmão” e exploraram sua resposta diferente à infecção das salmonelas.

“Esta técnica ajuda-nos a considerar se todas as “crianças” de um t cell particular fazem a mesma coisa ao mesmo tempo, que é uma questão aberta na biologia,” adiciona Tapio Lönnberg de EMBL-EBI. “Nós podemos começar ver se o antígeno próprio joga um papel em como um t cell responderá, e mesmo se é possível determinar o que o invasor é, apenas baseado na seqüência de um receptor de célula T.”

“Este tipo do trabalho da descoberta pode somente ser feito usando medidas da único-pilha,” diz Sarah Teichmann, cabeça da genética celular no instituto de Sanger. “Esta nova ferramenta para arranjar em seqüência da único-pilha dá-nos uma aproximação nova ao estudo de pilhas de T, e abre-a oportunidades novas de explorar respostas imunes na doença, na vacinação, no cancro e na auto-imunidade.”

O passo seguinte para a equipe é aplicar métodos similares ao estudo de pilhas de B para compreender melhor o sistema imunitário adaptável no conjunto.

Source:

European Molecular Biology Laboratory - European Bioinformatics Institute