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La investigación podía cambiar la mirada de la gente de la manera en la expresión génica, inmunorespuesta

La investigación del centro unicelular de la genómica sobre el campus del genoma de Wellcome podría cambiar la manera que observamos la expresión génica y la inmunorespuesta. Publicado en métodos de la naturaleza, el nuevo método, trazador, ofrece una herramienta potente para la investigación en inmunorespuesta, la vacunación, el cáncer y la autoinmunidad.

¿Qué hace un ataque del linfocito T un antígeno, y otro lo recuerda por la vez próxima? Una serie de ARN que ordenaba experimentos por el grupo de Teichmann en el instituto europeo de la bioinformática (EMBL-EBI) y el instituto de Sanger de la confianza de Wellcome llevó al grupo a desarrollar una nueva técnica para entender los receptores del linfocito T. El trazador, una herramienta de secuencia unicelular, no prohibe a determinación de ambos la serie del receptor del linfocito T en células individuales, junto con el perfil de la expresión génica de cada célula. Esto abre nuevas posibilidades en el futuro de desarrollar los diagnósticos rápidos basados en el perfil genético de glóbulos.

Cuando su sistema inmune descubre a un invasor - si ésa es una enfermedad o, en el caso de enfermedad autoinmune, una parte de su propia carrocería - comienza a producir a un ejército de células de T para quitar el patógeno, que sí mismo está produciendo los lotes de diversas proteínas.

“Es un campo de batalla, con los aviones de caza en diversos frentes, los tiradores emboscados, generales e incluso los periodistas que testimonian,” explican a Mike Stubbington de EMBL-EBI, ahora en el instituto de Sanger. “Qué quisimos saber era cómo diversas poblaciones de células de T responden a la enfermedad - qué papel están desempeñando en la batalla.”

Las células de T se equipan de los receptores que pueden cerrar conectado a un invasor determinado fuera de un arsenal extenso de opciones posibles. Esto significa que son extremadamente variables, con cientos de miles de millones de series posibles de la DNA. Una combinación de series emparejadas determina qué proteína descubrirá un receptor, así que entender qué está suceso en el nivel molecular, es imprescindible encontrar ambas series en cada célula. Usando trazador, los científicos pueden considerar los perfiles de la DNA y del ARN (expresión) de estos receptores altamente variables del linfocito T al mismo tiempo.

Los investigadores encontraron que las series del receptor son únicas, a menos que las células de T tengan la misma célula del padre. La presencia de células del “hermano” prueba que una infección ha accionado la división de un linfocito T determinado, que indica que se está multiplicando para luchar al invasor. Usando trazador, los investigadores determinaron exacto las células del “hermano” y exploraron su diversa reacción a la infección de las salmonelas.

“Esta técnica nos ayuda a considerar si todos los “niños” de un linfocito T determinado hacen la misma cosa al mismo tiempo, que es un no se sabe en biología,” agrega a Tapio Lönnberg de EMBL-EBI. “Podemos comenzar a ver si el antígeno sí mismo desempeña un papel en cómo responderá un linfocito T, e incluso si es posible determinar cuáles es el invasor, apenas basado en la serie de un receptor del linfocito T.”

“Esta clase de trabajo de la ruptura se puede hacer solamente usando mediciones unicelulares,” dice a Sarah Teichmann, jefe de la genética celular en el instituto de Sanger. “Esta nueva herramienta para la secuencia unicelular nos da una nueva aproximación al estudio de las células de T, y abre nuevas oportunidades de explorar inmunorespuestas en enfermedad, la vacunación, el cáncer y la autoinmunidad.”

El paso siguiente para las personas es aplicar métodos similares al estudio de las células de B para entender mejor el sistema inmune adaptante en conjunto.

Source:

European Molecular Biology Laboratory - European Bioinformatics Institute