Les chercheurs déploient l'ADN mobile ordonnançant des laboratoires pour aider à combattre la propagation des virus de Zika au Brésil

Les chercheurs de l'université de Birmingham travaillent avec des associés de santé au Brésil pour combattre l'écart du virus de Zika en déployant une paire d'ADN mobile ordonnançant des laboratoires sur un « voyage par la route » médical par les endroits les plus affectés du pays.

Se concentrant sur des endroits avec les régimes rapportés les plus élevés de la microcéphalie, une équipe des experts globaux utilisera le matériel portatif et à la force de l'USB de séquençage du génome pour analyser des échantillons de virus. Ils emploieront des caractéristiques recueillies pour suivre l'écart du virus et pour repérer son émergence dans de grandes villes.

Fonctionnant avec l'Instituto Evandro Chagas, dans Belém - une partie du Ministère de la Santé brésilien qui supporte le projet, l'institut du médicament tropical, l'université de São Paulo et le Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), dans Salvador, le Bahia - au cours de la période d'échantillonnage de 30 jours, les équipes mobiles de contrôle se déplaceront au Brésil du nord-est et vérifieront les échantillons provenant de 750 patients au Brésil côtier - de Belém lui-même dans le nord à Salvador dans l'est.

Abouti par l'université de Birmingham, le projet est supporté par le Conseil " Recherche " médical (MRC) et réunit des experts de la santé publique Angleterre, les universités d'Oxford, Nottingham et Edimbourg, ainsi que l'université de Sydney, de l'Australie et de l'institut d'Ontario pour la cancérologie, à Toronto, le Canada.

M. Nick Loman, de l'institut de la microbiologie et de l'infection à l'université de Birmingham, a dit : « Zika écarte en travers des Amériques et le Pacifique et les généticiens jouent le rattrapage. Il y en a très peu publiquement - des séquences d'ADN procurables et à peine des régions où les cas de la microcéphalie sont les plus répandus.

« Utilisant les laboratoires mobiles, nous pouvons prendre aux routes du Brésil du nord-est pour trouver et caractériser l'émergence tôt de Zika à de grands centres urbains. Les caractéristiques que nous recueillons aideront à comprendre comment le virus a écarté en travers du Brésil, Amérique latine, et effectuer de meilleures prévisions au sujet de la façon dont il pourrait s'écarter à d'autres régions à l'avenir. Nous pouvons également porter la technologie génomique tranchante de contrôle aux laboratoires de santé publique précédemment non armés avec cette capacité.

« L'ADN portatif ordonnançant des systèmes nous permettent de faire le séquençage du génome de manifestation en temps réel, influençant directement sur la réaction au virus au sol, ainsi qu'aidant à établir une illustration de son évolution.

« J'espère que notre travail au Brésil indiquera plus au sujet des origines de Zika, combien de fois il est entré en les Amériques, comment il agit l'un sur l'autre avec le système immunitaire, combien tensions là sont, et s'il agit l'un sur l'autre avec d'autres virus tels que la dengue et le Chikungunya. Nous n'avons aucun sentir réel pour cela à l'heure actuelle. Quoique le volume de la connaissance augmente, il y a beaucoup restant pour être renseigné sur le virus de Zika. »

Il a ajouté que le séquençage du génome dans les manifestations est utile pour comprendre comment le virus évolue, mais l'information a dû être procurable rapidement pour que cette information guide des efforts de contrôle. Ces méthode et technologie a déjà montré pour être utiles dans le contrôle d'Ebola dans Guinée pendant l'épidémie 2014-2016.

L'équipe adoptera une police ouverte de caractéristiques sur le projet - effectuer procurable librement rassemblé parinformation aux chercheurs et les analystes de santé publique vérifiant l'écart du virus comme il est produit. Les ayants droit peuvent trouver l'information et données ici http://zibraproject.github.io/.

Les experts à l'Organisation Mondiale de la Santé (WHO) croient que le virus transmis par les moustiques peut entraîner la microcéphalie d'anomalie congénitale, qui peut avoir comme conséquence la petite dimension anormale de la tête - un état congénital lié au développement du cerveau inachevé. Le virus est également associé au syndrome de Guillain-Barre - un trouble neurologique rare qui peut avoir comme conséquence la paralysie.

L'OMS a également rapporté les premiers signes d'une augmentation possible dans des cas de microcéphalie en dehors du Brésil, qui est le pays le plus gravement atteint jusqu'ici dans une manifestation écartant rapidement en travers de l'Amérique latine et des Caraïbe.

L'équipe de recherche au Brésil utilisera un compteur séquentiel léger du subordonné ADN des technologies d'Oxford Nanopore, qui pèse moins que 100g et est actionné par l'USB d'un ordinateur portable. Le dispositif actuel est employé par plus de 1.500 chercheurs mondiaux.
Après une période de première formation, le laboratoire de contrôle de génome visera de Belém, de la visite natale, de Joao Pessoa, de Recife et de Salvador.

Le matériel de subordonné a été la première fois utilisé avec succès pour le contrôle de la maladie distant par l'université des équipes dirigées par le Birmingham à Conakry, Guinée, en avril 2015 où des échantillons d'Ebola provenant des patients pourraient être ordonnancés dès que des caisses neuves ont été diagnostiquées. L'information était procurable plus rapidement car des échantillons pourraient s'analyser sur le site, en temps réel, plutôt qu'étant expédié aux laboratoires traditionnels de génome souvent situés sur un continent différent.

En ordonnançant 142 échantillons provenant des patients d'Ebola en Guinée, ils pouvaient fournir très les informations détaillées au sujet de la façon dont les cas étaient relatifs, fournissant des indices importants aux épidémiologistes de l'Organisation Mondiale de la Santé luttant pour arrêter la boîte de vitesses du virus.

Source:

University of Birmingham

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