Los investigadores despliegan la DNA movible que ordena laboratorios para ayudar a combate el virus de Zika extendido en el Brasil

Los investigadores de la universidad de Birmingham están trabajando con los socios de la salud en el Brasil para combate la extensión del virus de Zika desplegando un par de DNA movible que ordena laboratorios en un “viaje por carretera médico” con las áreas más afectadas del país.

Centrándose en áreas con los índices denunciados más altos de microcefalia, las personas de expertos globales utilizarán el genoma portátil, USB-movido por motor que ordena el equipo para analizar muestras del virus. Utilizarán los datos recopilados para rastrear la extensión del virus y para observar su aparición en pueblos y ciudad grandes.

Trabajando con el Instituto Evandro Chagas, en Belém - parte del Ministerio de Sanidad brasileño que está apoyando el proyecto, el instituto del remedio tropical, la universidad de São Paulo y al Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), en Salvador, Bahía - durante el período de muestreo de 30 días, las personas movibles de la prueba viajarán al Brasil del noreste y probarán las muestras a partir de 750 pacientes en el Brasil costero - de Belém sí mismo en el norte a Salvador en el este.

Llevado por la universidad de Birmingham, el proyecto es soportado por el Consejo de Investigación médico (MRC) y extrae juntos a expertos de la salud pública Inglaterra, las universidades de Oxford, Nottingham y Edimburgo, así como la universidad de Sydney, de Australia y del instituto de Ontario para la investigación de cáncer, en Toronto, Canadá.

El Dr. Nick Loman, del instituto de la microbiología y de la infección en la universidad de Birmingham, dijo: “Zika se está extendiendo a través de las Américas y el Pacífico y los genetistas están jugando a la puesta al día. Hay muy pocos público - las series disponibles de la DNA y apenas ningunos de las regiones donde están los más frecuentes los casos de la microcefalia.

“Usando los laboratorios movibles, podemos llevar los caminos del Brasil de nordeste para descubrir y para caracterizar la aparición temprana de Zika en centros urbanos grandes. Los datos que recopilamos ayudarán a entender cómo el virus se ha extendido a través del Brasil, América latina, y hacer mejores predicciones sobre cómo puede ser que se extienda a otras regiones en el futuro. Podemos también traer tecnología genomic punta de la vigilancia a los laboratorios de la salud pública previamente sin equipar con esta capacidad.

“La DNA portátil que ordena sistemas permite que hagamos el genoma del brote que ordena en tiempo real, afectando directamente la reacción al virus en la tierra, así como ayudando a construir un retrato de su evolución.

“Espero que nuestro trabajo en el Brasil revele más sobre los orígenes de Zika, cuantas veces ha entrado en las Américas, cómo obra recíprocamente con el sistema inmune, cuántas deformaciones allí es, y si obra recíprocamente con otros virus tales como dengue y Chikungunya. No tenemos ninguna sensación real para eso en el momento. Aunque el volumen de conocimiento está aumentando, hay mucho restante ser aprendido sobre el virus de Zika.”

Él agregó que el genoma que ordena en brotes es útil para entender cómo el virus se desarrolla, pero la información tuvo que estar disponible rápidamente para que esta información conduzca esfuerzos del mando. Este método y tecnología ha mostrado ya para ser útiles en la vigilancia de Ebola en Guinea durante la epidemia 2014-2016.

Las personas adoptarán un plan de acción abierto de los datos en el proyecto - fabricación libremente disponible cerco información para de los investigadores y de los analistas de la salud pública que investigan la extensión del virus como se genera. Las partes interesadas pueden encontrar la información y los datos aquí http://zibraproject.github.io/.

Los expertos en la Organización Mundial de la Salud (WHO) creen que el virus transmitido por mosquitos puede causar la microcefalia del defecto de nacimiento, que puede dar lugar a la pequeñez anormal de la culata de cilindro - una condición congénita asociada al revelado incompleto del cerebro. El virus también se asocia al síndrome de la Guillain-Barra - un desorden neurológico raro que pueda dar lugar a parálisis.

El WHO también ha denunciado los primeros signos de una subida posible de casos de la microcefalia fuera del Brasil, que es el país más muy afectado hasta ahora de un brote que se extiende rápidamente a través de América latina y del Caribe.

El equipo de investigación en el Brasil utilizará un secuenciador ligero de la DNA del subordinado de las tecnologías de Oxford Nanopore, que pesa menos que 100g y es movido por motor por USB de una computadora portátil. El dispositivo está siendo utilizado actualmente por más de 1.500 investigadores por todo el mundo.
Después de un período de entrenamiento inicial, el laboratorio de la vigilancia del genoma se establecerá de Belém, de visitar natal, de Joao Pessoa, de Recife y de Salvador.

El equipo del subordinado primero fue utilizado con éxito para la vigilancia alejada de la enfermedad por la universidad de personas Birmingham-llevadas en Conakry, Guinea, en abril de 2015 en donde las muestras de Ebola de pacientes podrían ser ordenadas tan pronto como los nuevos casos fueran diagnosticados. La información estaba disponible más rápidamente pues las muestras se podrían analizar en sitio, en tiempo real, bastante que siendo expidido a los laboratorios tradicionales del genoma situados a menudo en un diverso continente.

Ordenando 142 muestras de los pacientes de Ebola en Guinea, podían ofrecer la información muy detallada sobre cómo los casos eran relacionados, ofreciendo pistas importantes a los epidemiólogos de la Organización Mundial de la Salud que luchaban para parar la transmisión del virus.

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University of Birmingham

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