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L'étude emploie des approches automatisées pour caractériser le génome viral de Zika

L'émergence subite de l'épidémie de virus de Zika en Amérique latine en 2015-16 a pris au dépourvu le monde scientifique. Une maladie connue peu qui a été diagnostiquée la première fois dans l'environnement de forêt de Zika de l'Ouganda en 1947, la maladie en grande partie a affecté l'année dernière des populations en Afrique jusqu'à son émergence en français la Polynésie française il y a quelques années et puis le Brésil et Amérique du Sud. Le virus de Zika est écarté principalement par les moustiques d'aegypti d'aedes et, comme le virus de dengue, appartient à la famille de flaviviridae avec l'encéphalite japonaise et au virus West Nile. Dorénavant il n'y a aucun remède ou prophylactics connu pour les infections par un virus de Zika qui entraînent des frissons, des mal et des fièvres, mais ce qui effectue ce plus mauvais est l'association de la microcéphalie (petite caisse de cerveau) dans les nouveaux-nés et d'autres maladies neurologiques telles que le syndrome de Guillian-Barre. L'événement olympique à Rio cette année est un autre sujet d'inquiétude sur les possibilités de plus grande propagation de la maladie autour du monde.

Tandis que les gouvernements en Amérique latine et ailleurs se concentrent sur le contrôle de vecteur et la conscience croissante de citoyen, laboratoires de recherche autour du monde sont profondément engagées dans les médicaments et les vaccins se développants contre le virus de Zika. Dans ce procédé la compréhension du caractère du virus de Zika en termes de sa biologie moléculaire est concernée indispensable, parce que l'efficacité des médicaments et des vaccins dépendra en grande partie de ce que nous pouvons principalement comprendre du virus. La disponibilité du nucléotide et des caractéristiques de séquence protéique a permis à cette étude utilisant des approches automatisées de caractériser le virus en termes de propriétés biologiques variées d'intérêt comme des relations phylogénétiques, des rapports de passage-transversion, l'usage acide aminé, la polarisation d'usage de codon et l'index de hydropathie.

Nos études ont prouvé que le virus de Zika a des parallèles proches au virus de dengue dans plusieurs aspects tels que des rapports de passage-transversion, le vecteur préférentiel pour son écart, structure de génome et semblable, avec la structure de génome étant plus compliquée avec un grand nombre de distribution de base complexe le long de la séquence ; c'ont été clairement évidents dans certains des 2D plots graphiques de représentation. Nous avons également des différences très apparentes rapportées entre les séquences virales d'isolement dans les pays africains et les isolats des périodes plus récentes en Asie, Pacifique et en Amériques. L'usage de codon et les comptes acides aminés montrent également des différences remarquables dans les fréquences de quelques résidus. Ces aspects du génome viral de Zika proposent que les modifications qualitatives aient eu lieu entre les séquences africaines plus anciennes et les variantes plus récentes diffusant dans la région de l'Asie-Pacifique-Amérique. Puisque la manifestation en île de jappement en 2007 et l'épidémie récente au Brésil en 2015 ont mené aux graves infections dans les femmes enceintes et des cas rapportés de boîte de vitesses nouvelle par le contact sexuel, il est possible que certaines des modifications déterminées par cette recherche pourraient constituer des facteurs facilitant cette pathogénicité. Vu la propension des êtres humains de se déplacer et les conséquences du changement climatique qui sont susceptibles de faciliter la propagation de la maladie, ces études de bio-informatique pourraient former la base du contrôle efficace et une surveillance plus proche des génomes du virus de Zika. Certains des auteurs actuels ont proposé des attitudes assistées par ordinateur en ce qui concerne un tel contrôle et modèle conséquent des médicaments et des vaccins pour combattre l'accroissement et l'écart de Zika et d'autres virus zoonotiques, qui peut être pris sous la considération au profit des populations dans leur ensemble.

Source:

Bentham Science Publishers