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Os pesquisadores do USP desenvolvem a plataforma nova para detectar 416 vírus das regiões tropicais

Os pesquisadores da universidade de São Paulo (USP) em Ribeirão Preto em Brasil desenvolveram uma plataforma que analisasse amostras clínicas dos pacientes para diagnosticar a infecção por 416 vírus encontrados nas regiões tropicais do mundo.

De acordo com seus criadores, a ferramenta pode ser usada por laboratórios de referência tais como o instituto de Adolfo Lutz, a fundação de Oswaldo Cruz (Fiocruz) e o instituto de Evandro Chagas em Brasil para ajudar à fiscalização epidemiológica detectando os micróbios patogénicos com o potencial causar epidemias nos seres humanos.

Os resultados do projecto de investigação, que foi coordenado por Victor Hugo Aquino, um professor na universidade da escola farmacêutica do Ribeirão Preto de São Paulo (FCFRP-USP), e apoiado por FAPESP, foram publicados em PLoS negligenciaram doenças tropicais.

“O número de pacientes com dengue, infecção suspeitada de Zika ou de chikungunya aumentará quando o verão chega,” disse Aquino, autor principal do artigo. “Os métodos convencionais são freqüentemente incapazes de confirmar o diagnóstico destas doenças, assim que nós não sabemos que vírus estão circulando.”

Em sua opinião, se uma ferramenta gosta isto tinha estado disponível quando Zika começou a circular em Brasil, ele pôde ter sido possível para restringir sua propagação ao lugar inicial da manifestação. “Nós tomamos uns muitos tempos realizar que uma epidemia era corrente porque ninguém estava pensando de Zika naquele tempo,” ele disse.

Além do que os micróbios patogénicos, a plataforma detecta outro que foi identificada até agora somente esporàdica mas poderia transformar-se epidemias.

Os exemplos incluem Mayaro, um alphavirus relativo ao chikungunya que é transmitido por mosquitos selvagens tais como janthinomys de Haemagogus, e Oropouche, que causou as epidemias limitadas às comunidades riverine na região das Amazonas e é transmitido até agora principalmente por midges do paraensis de Culicoides da espécie.

“Há diversos outros vírus que não causaram ainda problemas nos seres humanos mas pode fazer tão um dia,” Aquino disse. “Estão evoluindo todo o tempo, e com a degradação dos agentes infecciosos de ambientes naturais limitados uma vez às ameias naturais poderia espalhar mais muito longe.”

Embora a plataforma seja projectada sobretudo detectar os micróbios patogénicos transmitidos por artrópodes tais como mosquitos e tiquetaques, pode igualmente diagnosticar os agentes infecciosos transmitidos por mamíferos pequenos, como o hantavirus.

Aquino explicou que a selecção abrange todos os vírus que ocorrem em regiões tropicais com as seqüências do ADN depositadas em GenBank, uma base de dados pública mantida pelo centro nacional para a informação de biotecnologia (NCBI), que é parte da biblioteca nacional dos Estados Unidos da medicina (NLM).

Como trabalha

A plataforma consiste em uma corrediça do microarray do ADN com as oito secundário-disposições idênticas que contêm as pontas de prova virais replicated pelo menos três vezes terminar a disposição com 15.000 pontas de prova. Cada ponta de prova contem as seqüências para 60 nucleotides que são complementares aos genomas dos vírus a ser detectados.

De acordo com Aquino, as seqüências foram montadas com base na informação de GenBank usando a bioinformática.

“Se uma amostra de sangue contem um dos 416 vírus incluídos no microchip, o genoma do micróbio patogénico ligará com uma das pontas de prova para produzir um marcador que possa ser detectado por um varredor,” Aquino disse.

O dispositivo que lê os resultados é o mesmo que aquele usado em ensaios do microarray para a análise da expressão genética.

“Inicialmente, o teste não será para a toda a população devido ao custo alto,” Aquino disse. “Será usado em pacientes com dengue suspeitada, Zika ou outras doenças febris cujo o diagnóstico não é confirmado por métodos convencionais.”

A metodologia foi validada usando 20 vírus disponíveis no laboratório da virologia de FCFRP-USP. Os testes da validação não apontaram à cruz-hibridação, que produz um resultado positivo para mais de um agente infeccioso e impede a identificação correcta de únicos vírus.

Não obstante, o método provou eficaz diagnosticar caixas da co-infecção, como quando o mesmo paciente foi contaminado por Zika e por dengue.

Source:

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo