Les experts en matière d'EUCAST disent que des méthodes de dépistage génétique ne peuvent pas être employées pour déterminer la susceptibilité antimicrobienne

Les experts au comité européen du contrôle antimicrobien de susceptibilité (EUCAST), qui définissent les concentrations optimales en médicament pour empêcher l'accroissement des agents pathogènes, ont constaté que des méthodes génétiques ne peuvent pas encore être employées pour déterminer la susceptibilité dans un certain nombre de substance bactérienne importante. Bien qu'il y ait eu des avances dans le séquençage du génome entier (WGS), qui laisse déterminer la séquence d'ADN du génome d'un organisme à un seul temps, il restent plusieurs barrières à surmonter avant que ce type de dépistage génétique puisse être employé dans les laboratoires cliniques, ils a conclu.

Un sous-comité d'EUCAST consacré à observer le rôle du GT dans le contrôle antimicrobien de susceptibilité (AST) a considéré la preuve publiée la plus récente sur l'utilisation du séquençage du génome entier comme outil pour le contrôle de susceptibilité. Le groupe - comportant de au-dessus de douzaine principaux experts et abouti par prof. Neil Woodford, le chef de la résistance antimicrobienne de l'Angleterre de santé publique et de l'élément de référence d'infections associé par santé - n'ont pas éliminé qu'il un jour sera possible que une analyse unique prévoie comment une substance des bactéries répondra à un traitement antibiotique spécifique, mais là sont peu de preuve de proposer que nous atteignions cette remarque dans un avenir proche.

Le Coordinateur technique des caractéristiques d'EUCAST, prof. Gunnar Kahlmeter de l'hôpital central, Växjö, Suède, a dit qu'il est prématuré de proposer que des points de rupture et les recommandations pour le contrôle phénotypique de susceptibilité plus ne soient exigés car les méthodes génétiques les erimeront d'un moment à l'autre. « Être utile dans une situation clinique, GT devra prévoir la résistance antimicrobienne et également la susceptibilité antimicrobienne, qui sont deux choses très différentes. Il sera également que le GT mesure le degré de résistance pour un organisme, quelque chose qui n'est actuel pas possible. »

Le groupe a choisi de comparer comment le GT peut prévoir si ou non l'organisme appartient au type sauvage (est sans mécanismes de résistance) avec la même prévision exécutée par l'utilisation des valeurs épidémiologiques de coupure (ECOFFs) développées par EUCAST. Si ou non et dans ce cas comment ceci peut être étendu aux points de rupture cliniques est discuté dans le papier.

Le sous-comité d'EUCAST a également mis en valeur qu'il n'y a actuel aucune voie d'évaluer à quel point les différents laboratoires précis de GT sont, et qu'il y a un besoin urgent de déterminer une base de données publique unique de tous les gènes de résistance connus dans des substances bactériennes différentes de sorte que les caractéristiques puissent être partagées et comparées plus facilement.

Les experts en matière d'EUCAST notent également que la technologie de GT est actuel limitée parce qu'elle ne peut pas être employée pour analyser des spécimens directement - les bactéries peuvent seulement être ordonnancé une fois elles ont été cultivées. Ceci mène inévitablement aux délais significatifs et aux coûts financiers complémentaires, qui est habituellement prohibitif pour la plupart des laboratoires.

EUCAST recommande que l'ordonnancement d'entier-génome devrait être effectué à une recherche et à une priorité de financement à l'avenir à examiner nos connaissances actuelles et pour développer des outils plus sophistiqués de prévision. Car les bactéries continuent à développer les mécanismes multiples de résistance, se démêler la génétique de leur interaction avec des antimicrobiens deviendra bien plus provocant et bien plus nécessaire, en particulier comme nous faisons face au spectre de la résistance au médicament extrême et de l'échec global de quelques antimicrobiens.