Os peritos de EUCAST dizem que os métodos de teste genético não podem ser usados para determinar a susceptibilidade antimicrobial

Os peritos no comitê europeu no teste antimicrobial da susceptibilidade (EUCAST), que define as concentrações óptimas da droga para inibir o crescimento dos micróbios patogénicos, encontraram que os métodos genéticos não podem ainda ser usados para testar para a susceptibilidade em um número de espécie bacteriana importante. Embora tenha estado uns avanços no genoma inteiro que arranja em seqüência (WGS), que reserva determinar a seqüência do ADN do genoma de um organismo em uma única estadia, há ainda diversos obstáculos a superar antes que este tipo de teste genético possa ser usado em laboratórios clínicos, ele concluiu.

Uma subcomissão de EUCAST dedicada a rever o papel do WGS no teste antimicrobial da susceptibilidade (AST) considerou a evidência publicada a mais recente no uso do genoma inteiro que arranja em seqüência como uma ferramenta para o teste da susceptibilidade. O grupo - compreendendo sobre de dúzia peritos principais e conduzido pelo prof. Neil Woodford, o chefe da resistência antimicrobial de Inglaterra da saúde pública e a unidade associada cuidados médicos da referência das infecções - não ordenaram para fora que um dia será possível para um único ensaio prever como uma espécie de bactérias responderá a uma droga antimicrobial específica, mas lá são pouca evidência a sugerir que nós alcançássemos este ponto em um futuro próximo.

O coordenador técnico dos dados de EUCAST, prof. Gunnar Kahlmeter do hospital central, Växjö, Suécia, disse que é prematuro sugerir que os pontos de ruptura e as recomendações para o teste fenotípico da susceptibilidade estivessem exigidos já não porque os métodos genéticos os substituirão em qualquer altura que logo. “Ser do uso em uma situação clínica, WGS precisará de prever a resistência antimicrobial e igualmente a susceptibilidade antimicrobial, que são duas coisas bastante diferentes. Igualmente será necessário que o WGS determine o grau de resistência para um organismo, algo que não é actualmente possível.”

O grupo escolheu comparar como o WGS pode prever mesmo se o organismo pertence ao tipo selvagem (é sem mecanismos da resistência) com a mesma previsão executada com o uso dos valores epidemiológicos da interrupção (ECOFFs) desenvolvidos por EUCAST. Mesmo se e nesse caso como isto pode ser estendido aos pontos de ruptura clínicos é discutido no papel.

A subcomissão de EUCAST igualmente destacou que não há actualmente nenhuma maneira de avaliar como os laboratórios diferentes exactos do WGS são, e que há uma necessidade urgente de estabelecer uma única base de dados pública de todos os genes de resistência conhecidos dentro das espécies bacterianas diferentes de modo que os dados pudessem ser compartilhados e comparou mais facilmente.

Os peritos de EUCAST igualmente notam que a tecnologia do WGS está limitada actualmente porque não pode ser usada para analisar directamente espécimes - as bactérias podem somente ser arranjado em seqüência uma vez elas foram cultivadas. Isto conduz inevitàvel ao tempo de atraso significativo e aos custos financeiros adicionais, que é geralmente proibitivo para a maioria de laboratórios.

EUCAST recomenda que arranjar em seqüência do inteiro-genoma deve ser feito a uma pesquisa e a uma prioridade de financiamento no futuro a expandir em nosso conhecimento actual e para desenvolver umas ferramentas mais sofisticadas da previsão. Porque as bactérias continuam a desenvolver mecanismos múltiplos da resistência, desembaraçar a genética de sua interacção com antimicrobianos tornar-se-á ainda mais desafiante e ainda mais necessário, particularmente como nós enfrentamos o espectro da resistência de droga extrema e da falha global de alguns antimicrobianos.